對PCR引物設計原則的簡介
首先引物與模板的序列要緊密互補，其次引物不能在模板的非目的位點引發DNA 聚合反應(即錯配) ，再次引物與引物之間避免形成穩定的二聚體或發夾結構。引物設計應注意如下要點：1.引物的長度一般為15-30 bp，常用的是18-27 bp。2.引物序列在模板內應當沒有相似性較高，尤其是3’端相似性較高的序列，否則容易導致錯配。引物3’端出現3 個以上的連續堿基，如GGG 或CCC，也會使錯誤引發機率增加。3.引物3’端的末位堿基對Taq 酶的DNA 合成效率有較大的影響。不同的末位堿基在錯配位置導致不同的擴增效率，末位堿基為A 的錯配效率明顯高于其他3個堿基，因此應當避免在引物的3’端使用堿基A。4.引物序列的GC 含量一般為40-60%，過高或過低都不利于引發反應。上下游引物的GC含量不能相差太大。5.引物的另一個重要參數是熔解溫度(Tm)。這是當50%的引物和互補序列表現為雙鏈DNA分子時的溫度。合理的退火溫度從55℃到70℃。為......閱讀全文
Troubleshooting－for－PCR－and－multiplex－PCR
Troubleshooting discussion is based on the PCR protocol as described in the table below. All reactions are run for 30 cycles.COMPONENTVOLUMEFINALCONCE
PCR簡介/PCR儀
PCR的要素基本的PCR須具備PCR儀圖冊1.要被復制的DNA模板 Template2.界定復制范圍兩端的引物Primers.3.DNA聚合酶Taq. Polymearse4.合成的原料（四種脫氧核苷酸）及水。 PCR儀工作原理利用升溫使DNA變性，在聚合酶的作用下使單鏈復制成雙鏈，進而達到基因復制
多重PCR（Multiplex－PCR）
一般PCR僅應用一對引物，通過PCR擴增產生一個核酸片段，主要用于單一致病因子等的鑒定.多重PCR(multiplex PCR)，又稱多重引物PCR或復合PCR，它是在同一PCR反應體系里加上二對以上引物，同時擴增出多個核酸片段的PCR反應，其反應原理，反應試劑和操作過程與一般PCR相同.??? 多
多重PCR（Multiplex－PCR）
一般PCR僅應用一對引物，通過PCR擴增產生一個核酸片段，主要用于單一致病因子等的鑒定.多重PCR(multiplex PCR)，又稱多重引物PCR或復合PCR，它是在同一PCR反應體系里加上二對以上引物，同時擴增出多個核酸片段的PCR反應，其反應原理，反應試劑和操作過程與一般PCR相同.??? 多
重疊PCR—overlap－PCR
1、簡介?重疊PCR也是基本的PCR原理：變性-退火-延伸。不同的是在重疊PCR過程是兩個或者幾個片段重疊延伸之后，再進行指數擴增的PCR過程。 ?2、基本原理*步：PCR產生兩個或者幾個片段，這幾個片段之間必須有重疊區。?第二步：以兩個片段為例，見上圖，*步產生的兩個片段，A D鏈之間有互補，B
普通PCR梯度PCR－原位PCR－熒光定量PCR儀的區別
普通PCR儀： 一般把一次PCR擴增只能運行一個特定退火溫度的PCR儀，稱之為普通PCR儀，也就是傳統的PCR儀。如果要用它做不同的退火溫度則需要多次運行。如；（ABI 2720） 梯度PCR儀： 一次性PCR擴增可以設置一系列不同的退火溫度條件（通常12種溫度梯度）的稱
反轉錄PCR（RTPCR,－Reversed－Transcript－PCR）
1 原理 RT—PCR是一種將cDNA合成與PCR技術結合分析基因表達的快速靈敏的方法，主要用于對表達信息進行檢測或定量分析,還可以用來檢測基因表達差異而不必構建cDNA文庫克隆cDNA。RT-PCR的模板可以為總RNA或poly(A)+選擇性RNA。逆轉錄反應可以使用逆轉錄酶，以隨機引物、ol
直接原位PCR（In－situ－PCR）
原位PCR是原位雜交細胞定位和PCR的高靈敏度相結合的技術，使得靶基因檢測有了極大的改進。此技術是在細胞（爬片、甩片或涂片）或組織（石蠟、冰凍切片）上直接對靶基因片段進行擴增，通過摻入標記基團直接顯色或結合原位雜交進行檢測的方法。一、組織切片和細胞樣品的制備試劑與配置10%福爾馬林；二甲苯；PBS操
直接原位PCR（In－situ－PCR）
原位PCR是原位雜交細胞定位和PCR的高靈敏度相結合的技術，使得靶基因檢測有了極大的改進。此技術是在細胞（爬片、甩片或涂片）或組織（石蠟、冰凍切片）上直接對靶基因片段進行擴增，通過摻入標記基團直接顯色或結合原位雜交進行檢測的方法。一、組織切片和細胞樣品的制備試劑與配置10%福爾馬林；二甲苯；PBS操
反向PCR－（inversePCR）
實驗方法原理 反向PCR是克隆T-DNA插入位點側翼DNA序列非常有效的方法。?1. ?選擇合適的限制性內切酶位點。并在T-DNA的邊界（左邊界、右邊界均可）和酶切位點附近設計引物P1、P2；2. ?回收DNA，T4連接酶連接，使酶切后的DNA片段環化；3. ?回收連接后的DNA，用引物P1、P2做
反向PCR－（inversePCR）
利用反向PCR可對未知序列擴增后進行分析，探索鄰接已知DNA片段的序列，并可將僅知部分序列的全長cDNA進行分子克隆，建立全長的DNA探針。可用于：（1）基因游走研究；（2）轉位因子研究；（3）已知序列DNA旁側病毒整合位點分析等研究。實驗方法原理反向PCR可用于研究與已知DNA區段相連接的未知染色
反向PCR－（inversePCR）
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 反向PCR可用于研究與已知DNA區段相連接的未知染色體序列，因此又可稱為染色體緩移或染色體步移。這時選擇的引物雖然與核心DNA區兩末端序列互補，但兩引物3’端是相互反向的。擴增前先用限制性內切酶酶切樣品DNA，然后用DNA連接
反向PCR（inverse－PCR）簡介
反向PCR是一種多聚合酶鏈式反應（PCR）應用的方法，可使已知序列的核心區邊側的未知DNA成幾何級數擴增。用適當的限制性內切裂解含核心區的DNA，以產生適合于PCR擴增大小的片段，然后片段的末端再連接形成環狀分子。PCR的引物同源于環上核心區的末端序列，但其方向可使鏈的延長經過環上的未知區而不是分開
菌落PCR（Colony－PCR）方法
菌落PCR（Colony PCR）可不必提取基因組DNA，不必酶切鑒定，而是直接以菌體熱解后暴露的DNA為模板進行PCR擴增，省時少力。建議使用載體上的通用引物。通常利用此方法進行重組體的篩選或者DNA測序分析。最后的PCR產物大小是載體通用引物之間的插入片斷大小。具體方法：1、PCR混合物的制備T
PCR技術（十四）：反向PCR
描述一種大聚合酶鏈反應(PCR)應用的方法，使在已知序列的核心區邊側的未知 DNA成幾何級數擴增。用適當的限制性內切裂解含核心區的DNA，以產生適合于PCR擴 增大小的片段，然后片段的末端再連接形成環狀分子。PCR的引物同源于環上核心區 的末端序列，但其方向性，使鏈的延長經過環上的未知區而不是分開引
PCR
PCRPolymerase Chain Reaction1) Add the following to a microfuge tube:10 ul reaction buffer1 ul 15 uM forward primer1 ul 15 uM reverse primer1 ul templ
PCR
實驗概要protocal for PCR實驗步驟PCR?1) Add the following to a microfuge tube:? ? ? ? 10 ul reaction buffer? ? ? ? 1 ul 15 uM forward primer? ? ? ? 1 ul 15 uM
PCR技術－PCR技術的應用
一滴殘留在裙子上的精液使得美國總統Bill Clinton不得不坦承他與白宮實習生有不正當的關系。因為他知道現在的生物科技就連一個精子也能被用來做為證據。這種將極微量的生物標本化為可供鑒定的現代技術正是PCR(Polymerase chain reaction)--聚合酶鏈式反應具有的特色之一。
實時熒光定量PCR（realtime－PCR）
實驗材料 細胞樣品試劑、試劑盒 RNA提取試劑盒熒光定量PCR MixTRIZOLdNTP氯仿逆轉錄酶MMLV異丙醇Taq酶DEPC水ddH2OTEMgCl2瓊脂糖溴化乙錠MOPS甲醛乙酸鈉EDTAEB溴酚蘭儀器、耗材 離心管離心機風光光度計電泳槽凝膠板Realtime PCR儀實驗步驟 一、 樣品
PCR技術－PCR技術的應用
一滴殘留在裙子上的精液使得美國總統Bill?Clinton不得不坦承他與白宮實習生有不正當的關系。因為他知道現在的生物科技就連一個精子也能被用來做為證據。這種將極微量的生物標本化為可供鑒定的現代技術正是PCR(Polymerase?chain?reaction)--聚合酶鏈式反應具有的特色之一。這也
實時熒光定量PCR（realtime－PCR）
實驗步驟一、 樣品RNA的抽提?1. ?取凍存已裂解的細胞，室溫放置5分鐘使其完全溶解。2. ?兩相分離 每1 ml的TRIZOL試劑裂解的樣品中加入0.2 ml的氯仿，蓋緊管蓋。手動劇烈振蕩管體15秒后，15到30℃孵育2到3分鐘。4℃下12 000 rpm離心15分鐘。離心后混合液體將分為下層的
原位PCR與PCR的區別
PCR是提取細胞或組織中的DNA進行基因擴增反應，而原位PCR是保持細胞或組織的完整性，使PCR反應體系滲透到組織和細胞中，在細胞的靶DNA所在的位置上進行基因擴增，不但可以檢測到靶DNA，而且還可以了解靶DNA存在于何種細胞中，更有利于探討靶DNA與細胞之間的關系。 PCR所采用的反應體系能
什么是反向PCR（inverse－PCR）
反向PCR（inverse PCR）反向PCR是一種多聚合酶鏈式反應（PCR）應用的方法，可使已知序列的核心區邊側的未知 DNA成幾何級數擴增。用適當的限制性內切裂解含核心區的DNA，以產生適合于PCR擴增大小的片段，然后片段的末端再連接形成環狀分子。PCR的引物同 源于環上核心區的末端序列，但其方
降落PCR（Touchdown－PCR）的原理
Touchdown PCR是指每隔一個循環降低1°C反應退火溫度，直至達到“Touchdown”退火溫度，然后以此退火溫度進行10個左右的循環。該方法最初出現是為了避開確定最佳退火溫度而進行的復雜的反應優化過程。正確和非正確退火溫度之間的任何差異將造成每個循環PCR產物量的兩倍差異（每攝氏度造成4倍
免疫PCR技術（ImmunoPCR）
免疫PCR技術（Immuno-PCR）?免疫PCR方法（Immuno-PCR）是Takeshi等1992年將免疫學反應和PCR技術相結合而創建的一種新的檢測技術，具有抗原、抗體反應的特異性和PCR技術的高效性。它運用PCR的高度敏感性來放大抗原抗體反應的特異性，使實驗中只需數百個抗原分子即可檢測，甚
什么是反向PCR（inverse－PCR）
反向PCR（inverse PCR）反向PCR是一種多聚合酶鏈式反應（PCR）應用的方法，可使已知序列的核心區邊側的未知 DNA成幾何級數擴增。用適當的限制性內切裂解含核心區的DNA，以產生適合于PCR擴增大小的片段，然后片段的末端再連接形成環狀分子。PCR的引物同 源于環上核心區的末端序列，但其方
PCR技術（一）：PCR技術概論
?PCR技術概論PCR技術簡史PCR技術的基本原理PCR反應體系與反應條件PCR反應特點PCR擴增產物的分析 聚合酶鏈反應(Polymerase Chain Reaction ,PCR)是80年代中期發展起來的體外核酸擴增技術。 它具有特異、敏感、產率高、 快速、 簡便、重復性好、易自動化等突出
PCR技術（十六）：PCR產物測序
PCR技術代替了為測序而反復進行的分子克隆和模板制備步驟。PCR技術與自動測 序技術相結合后，它將成為一種最快、最有效的測定核苷權序列的方法。本章主要綜 述各種測模板的制備以及如何完成PCR產物的直接測序。與傳統的將PCR片段克隆入質 粒或病毒基因組相比，直接序列分析有兩個主要的優點:1)由于它是一
實時熒光定量PCR（realtime－PCR）
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 實時熒光定量PCR技術，是指在PCR反應體系中加入熒光基團，利用熒光信號積累實時監測整個PCR進程，最后通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。 實驗材料
PCR技術－PCR技術的應用
一滴殘留在裙子上的精液使得美國總統Bill Clinton不得不坦承他與白宮實習生有不正當的關系。因為他知道現在的生物科技就連一個精子也能被用來做為證據。這種將極微量的生物標本化為可供鑒定的現代技術正是PCR(Polymerase chain reaction)--聚合酶鏈式反應具有的特色之一。