PCR技術（十六）：PCR產物測序
PCR技術代替了為測序而反復進行的分子克隆和模板制備步驟。PCR技術與自動測 序技術相結合后，它將成為一種最快、最有效的測定核苷權序列的方法。本章主要綜 述各種測模板的制備以及如何完成PCR產物的直接測序。與傳統的將PCR片段克隆入質 粒或病毒基因組相比，直接序列分析有兩個主要的優點:1)由于它是一個不依賴于生 物體(如細菌、病毒等)的體外系統，因而它更容易標準化(即例于自化2);對于每個待 測樣品，只需測定一個單鏈序列，因而它也就更快和更準確。相比之下，間接測序為 了區別在PCR反應過程中由DNA聚合酶引入的隨機錯朽核苷酸所引起的原始基因組序列 中的突變，以及由體外重組而產生的人工擴增產物，如產生鑲嵌等位基因(混合克隆) 等，每個樣品不得不測定幾個PCR產物克隆的序列。 不需借助在細菌中克隆就可直接獲得清蜥和準確的序列結果，其難易程度取決 于:1)只擴增靶序列的PCR引物的擴增能力(通常稱為PCR特異性);2用以獲笪測序模板......閱讀全文
PCR技術（十六）：PCR產物測序
PCR技術代替了為測序而反復進行的分子克隆和模板制備步驟。PCR技術與自動測 序技術相結合后，它將成為一種最快、最有效的測定核苷權序列的方法。本章主要綜 述各種測模板的制備以及如何完成PCR產物的直接測序。與傳統的將PCR片段克隆入質 粒或病毒基因組相比，直接序列分析有兩個主要的優點:1)由于它是一
PCR產物測序結果分析
pcr產物測序的最大風險是有在凝膠上看起來的一個條帶，實際上有多個分子。也就是說長度相似的分子有可能在電泳的時候只有一條帶。如果只是進行pcr產物回收，沒有進行凝膠分離的過程的話，東西可能更多了。問題就在于，如果出現雙峰或者多峰，這個樣品就白送了，什么也結果也沒有。特別你現在用的還是簡并引物，本身目
DNA測序電泳前測序PCR產物的處理
1. 加入12 μl的TSR于離心管中，劇烈振蕩，讓其充分溶解DNA沉淀，稍離心。 2. 將溶液轉移至蓋體分離的0.2 ml PCR管中，稍離心。 3. 在PCR儀上進行熱變性(95℃ 2 min)，冰中驟冷，待上機。
PCR實驗技術指南之產物測序
1. DNA 直接測序：指直接分析不經分離的PCR 擴增產物，如果各個位點上堿基序列都是一致的，則所得信號是確定的，否則，在那些有相異堿基的位點出現模糊信號， 如果模板在多數情況下被正確擴增，則少數的突變將被掩蓋，這是結果顯示的是模板的序列.但是，當擴增的前幾輪即出現錯誤擴增并被后續的循環積累，這時
DNA測序醋酸鈉/乙醇法純化PCR產物
1. 將混合物離心，將擴增產物轉移到1.5 ml EP管中。 2. 加入25 μl醋酸鈉/乙醇混合液，充分振蕩，置冰上10 min以沉淀DNA。12 000 r/min于4℃離心30 min，小心棄上清。 3. 加70%(V/V)的乙醇50 μl洗滌沉淀2次。12 000 r/min于4℃離
PCR產物克隆
克隆方法：1. 平端連接 通常情況下，PCR產物可直接與平端載體DNA進行連接，但其連接效率效低。因為TaqDNA聚合酶具有非模板依賴性末端轉移酶活性，能在兩6條DNA鏈的3''末端加上一個多余的堿基，使合成的PCR產物成為3''突出一個堿基的DNA分子。這種DN
PCR產物克隆
PCR克隆主要有TA克隆法, 限制性酶切與連接法，雜交法和近期開發出來的特異性重組法等。但因為TA克隆法操作最簡單，快速和高效的原因，成為Taq聚合酶PCR產物的最佳克隆方法。TA克隆法由Invitrogen發明，并擁有全球TA Cloning商標的ZL權。TA克隆方法（Original TA Cl
PCR產物克隆
克隆方法：1. 平端連接? 通常情況下，PCR產物可直接與平端載體DNA進行連接，但其連接效率效低。因為TaqDNA聚合酶具有非模板依賴性末端轉移酶活性，能在兩6條DNA鏈的3''''末端加上一個多余的堿基，使合成的PCR產物成為3'''&#
PCR產物污染誘因
PCR反應的zui大特點是不僅具有較大擴增能力而且還有著極高的靈敏性，但令人頭痛的問題是易污染，極其微量的污染即可造成假陽性的產生。污染原因（1）標本間交叉污染:標本污染主要有收集標本的容器被污染，或標本放置時，由于密封不嚴溢于容器外，或容器外粘有標本而造成相互間交叉污染；標本核酸模板在提取過程中，
PCR產物的克隆
?PCR產物克隆大致分為兩類，即平頭連接和粘頭連接。?? 平頭連接是將制備好的平頭載體和補平或削平的PCR產物直接進行連接。載體可用EcoR V或Sma I切成平頭；PCR產物純化后，可以在22℃用DNA聚合酶I作用30min（利用該酶所具有的3’→5’外切酶活性和5’→3’的聚合酶活性）。如果要求
PCR產物的克隆
PCR產物克隆大致分為兩類，即平頭連接和粘頭連接。平頭連接是將制備好的平頭載體和補平或削平的PCR 產物直接進行連接。載體可用EcoR V或Sma I切成平頭；PCR 產物純化后，可以在22℃用DNA聚合酶I作用30min（利用該酶所具有的3’→5’外切酶活性和5’→3’的聚合酶活性）。如果要求
PCR－產物定量實驗
試劑、試劑盒 DNA 標準TEPCR 產物儀器、耗材 熒光計金屬箔紙微量離心管實驗步驟 方法 A: 熒光測定法熒光測定法可以在納克級范圍精確定量。熒光計和 DNA 定量試劑盒許多公司都有出售。確定熒光計是否安裝了適合于特定染料的激發和發射的部件至關重要。該方法在設計上適用于配有帶藍色 LED
PCR－產物純化實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 TE 或去離子水 PCR 產物 儀器、耗材 離心機和轉子 PCR 濾 件
PCR－產物定量實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 DNA 標準 TE PCR 產物 儀器、耗材 熒光計 金屬箔紙
PCR－產物純化實驗
介紹一個采用 AmiconMicrocon-PCR 濾件（Millipore) 的方法，有效地去除冗余dNTP 和引物的方法純化 PCR 產物。本實驗來源于 PCR 實驗指南（第二版），作者：種康，瞿禮嘉。試劑、試劑盒TE 或去離子水PCR 產物儀器、耗材離心機和轉子PCR 濾 件微量離心管實驗步驟
PCR－產物定量實驗
測序之前對模板精確定量至關重要。根據 DNA 用量的多少，有幾種不同的方法可供選擇。下面介紹另外兩種方法：熒光測定法和比較溴化物染色法。本實驗來源于 PCR 實驗指南（第二版），作者：種康，瞿禮嘉。試劑、試劑盒DNA 標準TEPCR 產物儀器、耗材熒光計金屬箔紙微量離心管實驗步驟方法 A: 熒光測定
PCR產物純化方法
Purification of PCR Products in Preparation for CloningJoseph SambrookPeter Maccallum Cancer Institute and The University of Melbourne, AustraliaDavid
PCR－產物純化實驗
試劑、試劑盒 TE 或去離子水PCR 產物儀器、耗材 離心機和轉子PCR 濾 件微量離心管實驗步驟 一、材料1. 緩沖液和溶液TE(lOmmol/L Tris-HCl，lmmol/L EDTA，pH7.5) 或去離子水2. 核酸和寡核苷酸待測序的 PCR 產物3. 離心機和轉子帶有固定傾角轉子的小型
簡述PCR－產物純化
PCR 反應完成目標 DNA 的擴增后，PCR 產物可以用于進一步的研究，例如用于 DNA 測序、克隆、分析基因的功能和表達等。然而，通過 PCR 反應后體系中仍然存在具有活性的 DNA 聚合酶，剩余的 dNTP、引物以及反應緩沖體系中的各種金屬離子等。因此，我們必須通過一定的方法從反應體系中提純
PCR產物的克隆
PCR?產物的克隆?PCR?產物克隆大致分為兩類，即平頭連接和粘頭連接。??? 平頭連接是將制備好的平頭載體和補平或削平的?PCR?產物直接進行連接。載體可用EcoR V?或?Sma I?切成平頭；?PCR?產物純化后，可以在?22?℃用DNA聚合酶I作用30min（利用該酶所具有的3’→5’外切酶
PCR產物保存時間
未純化的PCR產物-20℃放上一周沒有什么問題。純化后若以干粉狀態可在-20℃保存好幾個月，若溶于Tris可保存一兩個月。注意不要用純水溶解。
PCR產物克隆方法
平端連接 通常情況下，PCR產物可直接與平端載體DNA進行連接，但其連接效率效低。因為TaqDNA聚合酶具有非模板依賴性末端轉移酶活性，能在兩6條 DNA鏈的3'末端加上一個多余的堿基，使合成的PCR產物成為3'突出一個堿基的DNA分子。這種DNA分子的連接效率很低。由
純化測序反應產物實驗
試劑、試劑盒 甲酰胺核酸寡核苷酸儀器、耗材 ABI PRISM 3100Genetic Analyzer微量離心管DTR Gel Filtration Cartridges (Edge Biosystems)或相應的真空濃縮儀實驗步驟 一、材料1.緩沖液和溶液樣品上樣液所用的樣品上樣液取決于所用的設
純化測序反應產物實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 甲酰胺 核酸 寡核苷酸 儀器、耗材 ABI PRISM 3100Genetic An
純化測序反應產物實驗
電泳之前純化測序反應產物以去除多余的、尚未結合的染料終止子是非常必要的。離心柱可以是快速、有效地去除未結合的染料終止子。本實驗來源于 PCR 實驗指南（第二版），作者：種康，瞿禮嘉。試劑、試劑盒甲酰胺核酸寡核苷酸儀器、耗材ABI PRISM 3100Genetic Analyzer微量離心管DTR
PCR技術（十）：PCR產物克隆方法
平端連接 通常情況下，PCR產物可直接與平端載體DNA進行連接，但其連接效 率效低。因為TaqDNA聚合酶具有非模板依賴性末端轉移酶活性，能 在兩6條DNA鏈的3'末端加上一個多余的堿基，使合成的PCR產物成為 3'突出一個堿基的DNA分子。這種DNA分子的連接效率很低。由于PCR
DNA測序PCR測序反應
1. 取0.2 ml的PCR管，用記號筆編號，將管插在顆粒冰中，按下表加試劑： 所加試劑 測定模板管 標準對照管 BigDye Mix 1 μl 1 μl 待測的質粒DNA 1 μl － pGEM-3Zf (+) 雙鏈DNA － 1 μl 待測DNA的正向引物 1 μl － M13(
PCR產物電泳結果分析
基因組樣品的模板量摸一個濃度吧，這個模板濃度不太合適。PCR產物以smear的形式出現，要么是樣本降解，要么就是完全沒有特異的擴增。要通過PCR篩選基因敲除的小鼠，最基本的要求就是引物特異性好，擴增效率高。不然沒法篩選的。如果這對引物之前篩選過，你可以換換模板，重新合成下引物就行，如果完全沒有用于篩
PCR產物的電泳檢測
PCR產物的電泳檢測時間一般為48h以內，有些最好于當日電泳檢測，大于48h后帶型不規則甚致消失。常見問題如下：????一、假陰性，不出現擴增條帶????PCR反應的關鍵環節有①模板核酸的制備，②引物的質量與特異性，③酶的質量及，?④PCR循環條件。尋找原因亦應針對上述環節進行分析研究。????模板
PCR產物電泳結果分析
基因組樣品的模板量摸一個濃度吧，這個模板濃度不太合適。PCR產物以smear的形式出現，要么是樣本降解，要么就是完全沒有特異的擴增。要通過PCR篩選基因敲除的小鼠，最基本的要求就是引物特異性好，擴增效率高。不然沒法篩選的。如果這對引物之前篩選過，你可以換換模板，重新合成下引物就行，如果完全沒有用于篩