引物的熔解溫度與退火溫度
primer的一個重要參數是熔解溫度(Tm)。這是當50%的primer和互補序列表現為雙鏈DNA分子時的溫度.Tm對于設定PCR退火溫度 是必需的。在理想狀態下，退火溫度足夠低，以保證primer同目的序列有效退火， 同時還要足夠高，以減少非特異性結合。合理的退火溫度從55℃到70℃。退火溫度一般設定比primer的 Tm低5℃。設定Tm有幾種公式。有的是來源于高鹽溶液中的雜交，適用于小于18堿基的primer。有的是根據GC含量估算Tm。確定primerTm最可信的方法是近鄰分析法。這種方法從序列一級結構和 相鄰堿基的特性預測primer的雜交穩定性。大部分計算器程序使用近鄰分析法。根據所使用的公式及primer序列的不同，Tm會差異很大。因為大部分公式提供一個估算的Tm值，所有退火溫度 只是一個起始點。可以通過分析幾個逐步提高退火溫度的反應以提高特異性。開始低于估算的Tm5℃，以2℃為增量，逐步提高退火溫度。較高的退火溫度......閱讀全文
引物溶解引物保存
1. 如何測定引物的OD值？用紫外分光光度計在260nm波長測定溶液的吸光度來定量，請注意紫外分光光度計的使用，測定時溶液的吸光度最好稀釋到0.2~0.8之間（吸光度太高或太低會有較大的誤差）。DNA干粉用一定體積的水充分振蕩溶解以后，取部分溶液稀釋到1 ml 并在1 ml 標準比色皿中測定其吸光度
引物溶解引物保存
1. ?如何測定引物的OD值？ 用紫外分光光度計在260nm波長測定溶液的吸光度來定量，請注意紫外分光光度計的使用，測定時溶液的吸光度最好稀釋到0.2~0.8之間（吸光度太高或太低會有較大的誤差）。DNA干粉用一定體積的水充分振蕩溶解以后，取部分溶液稀釋到1 ml 并在1 ml 標準比色皿中測定其
引物設計的引物設計原則
1、引物長度一般為15-30bp，常用的為18-27bp，但不能大于38bp；2、引物GC含量一般為40%-60%，以45-55%為宜，上下游引物GC含量和Tm值要保持接近；3、引物所對應的模板序列的Tm值最好在72℃左右，至少要在55-80℃之間，Tm值曲線以選取72度附近為佳，5'到 3
引物設計的引物設計原則
1、引物長度一般為15-30bp，常用的為18-27bp，但不能大于38bp；2、引物GC含量一般為40%-60%，以45-55%為宜，上下游引物GC含量和Tm值要保持接近；3、引物所對應的模板序列的Tm值最好在72℃左右，至少要在55-80℃之間，Tm值曲線以選取72度附近為佳，5'到 3
引物設計的引物設計原則
1、長度：15—30bp，其有效長度[Ln=2(G十C)十(A十T)]一般不大于38，否則PCR的最適延伸溫度會超過Taq酶的最佳作用溫度(74度)，從而降低產物的特異性。2、G十C含量：應在40%一60%之間，PCR擴增中的復性溫度一般較Tm值低等于引物的Tm值減去5—10度。引物長度小于20時，
引物設計的引物設計原則
1、引物長度一般為15-30bp，常用的為18-27bp，但不能大于38bp；2、引物GC含量一般為40%-60%，以45-55%為宜，上下游引物GC含量和Tm值要保持接近；3、引物所對應的模板序列的Tm值最好在72℃左右，至少要在55-80℃之間，Tm值曲線以選取72度附近為佳，5'到 3
什么是上游引物和下游引物
雖然這個問題很簡單，但我怎么發覺挺難回答的......上游引物就是和要擴增基因片斷上游序列結合的引物（引物就是單鏈寡聚核苷酸，基因擴增需要從引物開始），同理，下游引物指與目的基因片斷下游序列結合者。具體示意如下：（上下兩條長線代表DNA模板）5'-----------------------
快速了解反轉錄引物隨機引物
隨機引物是指當特定mRNA由于含有使逆轉錄酶終止的序列而難于拷貝其全長序列時，可采用隨機六聚體這一非特異的引物來拷貝全長mRNA。 1.特異性引物一般在增低豐度目的基因才選擇使用，用得比較少。一般都推薦用Oligo(dT)或隨機引物代替基因特異性引物。由于rna的二級結構破壞不完全，導致特異性
設計引物遵循原則、引物保存和各種PCR的引物設計
一 設計引物應遵循以下原則1 、引物長度： 15-30bp，常用為20bp左右。2 、引物擴增跨度： 以200-500bp為宜，特定條件下可擴增長至10kb的片段。3 、引物堿基：G+C含量以40-60%為宜，G+C太少擴增效果不佳，G+C過多易出現非特異條帶。ATGC最好隨機分布，避免5個以上
PCR引物
PCR?Primer Design and Reaction Optimization?(Molecular Biology Techniques Manual)??PCR Primer Design?(Newman Lab)??PCR Primer Design?(Eppendorf)Detail
PCR引物
PCR Primer Design and Reaction Optimization?(Molecular Biology Techniques Manual)??PCR Primer Design?(Newman Lab)??PCR Primer Design?(Eppendorf)Detail
設計引物時需要避免引物之間形成什么而造成引物自連。
設計引物時需要避免引物之間形成_堿基互補配對。而造成引物自連。相同末端或相同黏性末端或相同平末端。末端特指雙鏈DNA分子的端位堿基，是專用名詞，不可以用在單鏈引物上。且引物之間的堿基互補配對不一定是所有堿基都能夠互補配對，少量配對也會使兩種引物結合在一起，從而不能獲得特異性DNA產物。
引物篇：普通PCR－和－QPCR－引物異同點
Q問題： 普通PCR 和 QPCR 引物 是否一樣？ A 回答： 二者的設計原則有相同也有不同； 相同處： ? 序列的查找是一致的； ? 序列選取應在基因的保守區段； ? 選取合適的擴增片段大小 ?
PCR引物和測序引物有什么區別
一、定義不同：PCR是體外酶促合成特異DNA片段的一種方法，由高溫變性、低溫退火（復性）及適溫延伸等反應組成一個周期，循環進行，使目的DNA得以迅速擴增,具有特異性強、靈敏度高、操作簡便、省時等特點。測序引物分自帶引物和通用引物，自帶引物為客戶自行設計的PCR擴增引物或者載體及目的片段上設計的引物進
通用引物和特異性引物的區別
通用引物，含義為克隆位點兩旁的序列匹配，目的是引擴出DNA片段，主要用來測序。而序列特異性引物指一種測定基因突變的方法。通用引物是一般和載體多克隆位點兩旁的序列匹配，或者是與載體里面的一些啟動、終止元件匹配。這樣不管載體插入什么DNA片段，都可以用通用引物擴出來。通用引物可以用來測序，但是只是“通用
引物篇：普通PCR－和－QPCR－引物異同點
Q問題： 普通PCR 和 QPCR 引物 是否一樣？ A 回答：?????二者的設計原則有相同也有不同；相同處：??????????序列的查找是一致的；??????????序列選取應在基因的保守區段；??????????選取合適的擴增片段大小??????????避免引物自身或與引物之間形成4個或4個
上游引物和下游引物有什么區別
簡單的說上游引物就是和要擴增基因片斷上游序列結合的引物,下游引物指與目的基因片斷下游序列結合者.上游引物：DNA分子兩端不一樣，因為核苷酸分子不是對稱的，5'位有個磷酸，3'位是-OH 就是：磷酸端和羥基端。DNA復制總是從5’端到3’端，因為DNA聚合酶只能往3’端加核苷酸。下游引
怎樣設計引物
一般是通過設計軟件，例如oligo6，primer5等，你可以在網上搜一下引物設計軟件下載和使用說明，是比較容易的。至于設計引物的一般原則如下：* 序列選取應在基因的保守區段* 避免引物自身或與引物之間形成4個或4個以上連續配對，避免引物自身形成環狀發卡結構* 典型的引物18到24個核苷長。引物需要
引物延伸實驗
實驗材料 RNA試劑、試劑盒 T4多核苷酸激酶dATP醋酸鈉乙醇EDTARNaseA苯酚氯仿儀器、耗材 恒溫培養箱NAP-5柱-70°C冰箱低溫離心機實驗步驟 1. ?依次加入下列試劑，建立用以標記引物的反應混合液（終體積10 μl）（1）2.5 μl ?H2O（2）1 μl ?10×T4多核苷酸激
引物延伸反應
Primer extension analysis is used to determine the location and quantitate the amount of the 5′-end of specific RNAs. An end-labeled oligonucleotide i
引物延伸實驗
? ? ? ? ? ? 實驗材料 RNA 試劑、試劑盒 T4多核苷酸激酶 dATP 醋酸鈉 乙醇
引物延伸實驗
引物延伸分析用于確定位置和定量特定RNA的5'-端的數量。結束標記的寡核苷酸雜交，RNA和利用中存在的脫氧核苷酸逆轉錄作為底漆。因此RNA的反轉錄成cDNA，變性聚丙烯酰胺凝膠電泳分析。cDNA的長度反映了基地之間的標記引物和RNA的5'-端核苷酸的數量，基因產品的數量是針對性的RN
隨機引物法
此法系可用于從低熔點瓊脂糖凝膠中回收 DNA 的放射性標記 ( Feinberg 和 Vogelstein 1983，1984)。本實驗來源「分子克隆實驗指南第三版」黃培堂等譯。實驗方法原理此法系可用于從低熔點瓊脂糖凝膠中回收 DNA 的放射性標記 ( Feinberg 和 Vogelstein 1
PCR的引物
特異性的引物決定了所擴增的DNA片段，引物（primer）本質上是人工合成的小片段寡聚核苷酸片段，一般不超過50個堿基（通常18－25個），它們與所要擴增的DNA片段的正鏈與負鏈的末端完全互補。在“退火”時引物結合于DNA模板的起始和終止點，DNA聚合酶結合到這兩個位置，開始合成新的DNA鏈。
如何溶解引物？
干燥后的引物質地非常疏松，開蓋前最好離心一下，或管垂直向上在桌面上敲敲，將引物粉末收集到管底。根據計算出的體積加入去離子無菌水或10mM Tris pH7.5緩沖液，室溫放置幾分鐘，振蕩助溶，離心將溶液收集到管底。溶解引物用的水一般不要用蒸餾水，因為有些蒸餾水的pH值比較低（pH4-5）,引物在這種
引物參數計算
Simple javascript Oligo CalculatorOligo CalculatorEnter Oligo Sequence in BoxLength?Melting Temperature (Tm)??°C%GC contentMolecular Weight:??daltons
如何保存引物？
引物合成后，經過一系列處理和純化步驟，旋轉干燥而成無色或白色絮狀干粉。干 粉：運輸時常溫運輸，-20℃可以保存一年。儲存液：配好后分裝成幾管，避免反復凍融，-20℃可以保存半年。工作液：常規使用，4℃保存，也可-20℃保存，但應避免反復凍融。修飾熒光引物：需要避光保存，盡快使用為宜。
引物合成詳解
1. 引物是如何合成的？ 目前引物合成基本采用固相亞磷酰胺三酯法。DNA合成儀有很多種, 主要都是由ABI/PE 公司生產，而Bioneer自行研制的ZL384并行高通量DNA合成儀，可實現99%的高合成率。無論采用什么機器合成，合成的原理都相同，主要差別在于合成產率的高低，試劑消耗量的不
引物如何保存？
拿到手的引物一般已分裝為兩管。我們建議先溶解其中一管用于實驗，另一管干粉保存備用，以備不時之需。干粉狀態的引物非常穩定。-20℃可保存2年以上。常見的做法是將引物溶解至10倍的存儲度，-20℃長期保存。使用時取出稀釋至1倍的工作液。工作液保存于4℃即可。在4℃下引物溶液是比較穩定的，保存一周以上仍可
什么是引物？
引物，是指在核苷酸聚合作用起始時，刺激合成的，一種具有特定核苷酸序列的大分子，與反應物以氫鍵形式連接，這樣的分子稱為引物。引物通常是人工合成的兩段寡核苷酸序列，一個引物與靶區域一端的一條DNA模板鏈互補，另一個引物與靶區域另一端的另一條DNA模板鏈互補，其功能是作為核苷酸聚合作用的起始點，核酸聚合酶