甲基化芯片在表觀遺傳學中的應用
表觀遺傳改變可以定義為基因的遺傳性或獲得性改變，但是這種改變和DNA序列改變無關。DNA甲基化是最為常見的表觀遺傳改變；啟動子或第一外顯子CpG島中的甲基化改變將導致基因表達失活；組蛋白的化學修飾也可以作為表觀遺傳改變；組蛋白發生乙酰化改變的基因通常被開啟。CpG島的異常甲基化是導致基因沉默和過度表達的最主要的改變，常規的方法不能在全基因組水平上對甲基化進行檢查。表觀遺傳分析與基因芯片技術結合起來則可以高通量進行甲基化的定性、定量分析。目前建立了2種基于芯片的甲基化分析方法：一個是甲基化特異寡核苷酸芯片(methylation specific oligonucleotide arrays，MSO)方法，另一個是差異甲基化雜交法(differential methylation hybridization method，DMH)。第一種方法利用直接雜交原理，只是在標記前先用亞硫酸氫鈉處理DNA，從而使所有未甲基化的胞......閱讀全文
甲基化芯片在表觀遺傳學中的應用
表觀遺傳改變可以定義為基因的遺傳性或獲得性改變，但是這種改變和DNA序列改變無關。DNA甲基化是最為常見的表觀遺傳改變；啟動子或第一外顯子CpG島中的甲基化改變將導致基因表達失活；組蛋白的化學修飾也可以作為表觀遺傳改變；組蛋白發生乙酰化改變的基因通常被開啟。 CpG島的異常甲基化是導致基
甲基化芯片在表觀遺傳學中的應用
表觀遺傳改變可以定義為基因的遺傳性或獲得性改變，但是這種改變和DNA序列改變無關。DNA甲基化是最為常見的表觀遺傳改變；啟動子或第一外顯子CpG島中的甲基化改變將導致基因表達失活；組蛋白的化學修飾也可以作為表觀遺傳改變；組蛋白發生乙酰化改變的基因通常被開啟。CpG島的異常甲基化是導致基因沉默和過度表
表觀遺傳學關于DNA甲基化
表觀遺傳學是研究表觀遺傳變異的遺傳學分支學科從目前的研究來看,X 染色體劑量補償、DNA 甲基化、組蛋白密碼、基因組印記、表觀基因組學和人類表觀基因組計劃等問題都是表觀遺傳學研究的內容。其中甲基化是基因組DNA 的一種主要表觀遺傳修飾形式,是調節基因組功能的重要手段。在脊椎動物中,CpG二核
表觀遺傳學修飾
組蛋白修飾 表觀遺傳學是指表觀遺傳學改變 (DNA 甲基化、組蛋白修飾和非編碼 RNA 如 miRNA) 對 表觀基因組基因表達的調節，這種調節不依賴基因序列的改變且可遺傳表觀。因素如 DNA 甲基化、組蛋白修飾和 miRNA 是對環境刺激因素變化的反映，這些表觀遺傳學因素相互作用以調節基因
Arraystar－DNA甲基化芯片干細胞移植改善骨質疏松表觀機制
施松濤教授任職于賓夕法尼亞大學，長期從事口腔再生醫學及其臨床轉化方面的研究工作。近期其研究團隊利用Arraystar DNA甲基化芯片研究移植間充質干細胞（MSC）通過表觀遺傳調控Notch信號改善紅斑狼瘡患者的骨質疏松。這一重要研究發現發布在Cell Metabolism雜志（IF：17.5
什么是表觀遺傳學
是研究不涉及DNA序列改變的基因表達和調控的可遺傳修飾，即探索從基因演繹為表型的過程和機制的一門新興學科。遺傳學是指基于基因序列改變所 致基因表達水平變化，如基因突變、基因雜合丟失和微衛星不穩定等。而表觀遺傳學則是指基于非基因序列改變所致基因表達水平變化，如DNA甲基化和染色質構象變化等；表觀基因組
甲基化與lncRNA：表觀遺傳學與轉錄組學研究的完美結合
2017年國自然申請的熱點什么？circRNA，lncRNA，外泌體。除了這些大家耳熟能詳的香饃饃之外，現在很多小伙伴們開始了新的玩法，通過多平臺聯用，將不同層面的東西結合起來，比如，表觀遺傳與非編碼RNA的結合，就是一個很好的例證。 研究背景 肺癌是一種常見的惡性腫瘤，特別在中國，
甲基化與lncRNA：表觀遺傳學與轉錄組學研究的完美結合
2017年國自然申請的熱點什么？circRNA，lncRNA，外泌體。除了這些大家耳熟能詳的香饃饃之外，現在很多小伙伴們開始了新的玩法，通過多平臺聯用，將不同層面的東西結合起來，比如，表觀遺傳與非編碼RNA的結合，就是一個很好的例證。研究背景肺癌是一種常見的惡性腫瘤，特別在中國，由于環境的污染，肺癌
表觀遺傳學分子生物學軟件——DNA甲基化分析工具
第一類：基于引物設計功能的軟件。此類軟件主要是針對重亞硫酸鹽序列進行甲基化特異性PCR（methylation-specific PCR, MS-PCR or MSP）和重亞硫酸鹽測序（bisulfite sequencing, BS）引物的設計。由于重亞酸鹽修飾的特殊性，使常規的分子生物學
Nature發表表觀遺傳學重要發現決定性別的RNA甲基化
N6-methyladenosine（m6A）是真核生物mRNA和長非編碼RNA上最普遍的一種RNA修飾，介導了超過80%的RNA堿基甲基化。人們已經陸續鑒定了m6A所需的“讀”、“寫”和“擦除”蛋白，但對其生物學功能還知之甚少。伯明翰大學的科學家們在Nature雜志上發表文章，揭示了m6A在Sxl
Nature發表表觀遺傳學重要發現－決定性別的RNA甲基化
N6-methyladenosine（m6A）是真核生物mRNA和長非編碼RNA上最普遍的一種RNA修飾，介導了超過80%的RNA堿基甲基化。人們已經陸續鑒定了m6A所需的“讀”、“寫”和“擦除”蛋白，但對其生物學功能還知之甚少。 伯明翰大學的科學家們在Nature雜志上發表文章，揭示了m6A
著名遺傳學家表觀遺傳學新成果
可卡因成癮性的一個主要挑戰在于，在戒斷期之后的高復發率。但新的研究表明，在藥物戒斷過程中，我們DNA的變化可能為更有效的成癮療法開發，提供了有希望的方法。 加拿大麥吉爾大學和以色列巴爾依蘭大學的研究人員，將這項研究結果發表在最近的《Journal of Neuroscience》。他們指出，戒
《科學》推出“表觀遺傳學”專題
10月29日出版的《科學》雜志刊登專題——《表觀遺傳學》（Epigenetics）。專題導言文章《什么是表觀遺傳學》（What Is Epigenetics?）說，多細胞有機體的細胞名義上擁有同樣的DNA序列（因而擁有同樣的遺傳指令系統），但是它們卻維持著不同的顯型。這種記錄了發育和環
表觀遺傳學和人類疾病
上個世紀50年代初，Watson和Crick建立了DNA分子結構模型，極大程度地促進了生命科學的發展。自此遺傳學便成為現代醫學研究領域中一個重要的分支。人類已經認識到基因突變可以導致疾病的發生，如慢性進行性舞蹈病(Huntington's chorea, Hc)和囊性纖維化等。近年來
表觀遺傳學名詞解釋
表觀遺傳學（英語：epigenetics）又譯為表征遺傳學、擬遺傳學、表遺傳學、外遺傳學以及后遺傳學，在生物學和特定的遺傳學領域，其研究的是在不改變DNA序列的前提下，通過某些機制引起可遺傳的基因表達或細胞表現型的變化。表征遺傳學是1980年代逐漸興起的一門學科，是在研究與經典的孟德爾遺傳學遺傳法則
ChIPChip技術的介紹與應用
人類基因組計劃的完成開啟了一個新的紀元——功能基因組時代來臨，與基因信息相比較，人們更關注于基因的功能、調控網絡與信號通路等信息。表觀遺傳學研究與核內蛋白因子的功能分析成為基因表達調控研究的重要組成部分。結合了染色質免疫共沉淀與基因芯片技術的ChIP-chip技術的浮現使得全基因組范圍內DNA與蛋白
表觀遺傳之DNA甲基化（二）
二 DNA甲基化?DNA甲基化：DNA甲基化是通過DNA甲基轉移酶在胞嘧啶環的第5個碳原子上共價加成甲基而產生的，從而產生5-甲基胞嘧啶（5-mC），在體細胞中，幾乎僅在二核苷酸CpG的對稱甲基化配對中發現了5-mC，而在胚胎干（ES）細胞中，在非CpG中也觀察到了大量的5-mC。5-mC作為表型和
表觀遺傳之DNA甲基化（一）
俗話說，龍生龍，鳳生鳳，老鼠的兒子會打洞。?這句話什么意思呢？想必很多人有不同的看法~~?從傳統的社會認知角度看，就是“出生決定論”，一個人的出生是什么樣的，以后就會有什么樣的作為和成就，家庭決定著個人的前途和發展方向。龍鳳階層的人自出生以來便是龍鳳，若是草根階層，也很難上升到龍鳳圈層，即使有這樣的
Cancer－Cell專題：癌癥表觀遺傳學
癌癥中的基因調控與反調控一直是人們關注的熱點，現在這一領域已經取得了很大的進展。Cell旗下的Cancer Cell雜志本月特別推出專題，推薦了四篇有代表性的癌癥表觀遺傳學文章。 Vulnerabilities of Mutant SWI/SNF Complexes in Cancer 癌癥
Cell發現表觀遺傳學肥胖開關
世界就是這么不公平，有些人喝涼水都發胖，有些人怎么吃也胖不了。近年來科學家們發現，個體的肥胖傾向是由基因決定的。然而Cell雜志發表的一項最新研究表明，表觀遺傳學調控也在其中起到了關鍵作用。 Max Planck研究所的J. Andrew Pospisilik領導團隊對遺傳背景完全相同的小鼠和
顛覆傳統認知，表觀遺傳學之謎
盡管大多數生物體都是利用基因組上的甲基標記來監控基因表達，淡水原生動物Oxytricha trifallax卻利用這些標記踢走了垃圾DNA(95%的基因組序列)。這一研究發現駁斥了以往研究做出的通常攜帶四個細胞核的單細胞纖毛蟲無甲基化DNA的結論。 論文的第一作者、普林斯頓大學的博士后
堅持鍛煉的表觀遺傳學意義
眾所周知，體育鍛煉能夠改善包括代謝、肺活量在內的多項身體機能。那么體育鍛煉是怎樣在分子水平上施加影響的呢？ 人們發現，鍛煉能促進肌肉重塑，改變肌肉的纖維結構和蛋白組成。“堅持體育鍛煉對健康很有幫助，能夠防治一系列常見疾病，比如心血管疾病和二型糖尿病。理解鍛煉有益健康的具體機制，可以幫助我們進一
Science：表觀遺傳學的“神秘花園”
許多研究者都在探尋各種復雜性狀背后的遺傳學基礎。然而，大家往往忽視了天然表觀遺傳學變化為表型帶來的多樣性。表觀遺傳學突變發生在DNA序列之外，將其與DNA序列突變區分開是一項富有挑戰性的工作。 在本期Science雜志上Cortijo等人向人們展示，表觀等位基因( epialleles
PNAS發布人類胎盤甲基化組
甲基化是控制基因表達的關鍵表觀遺傳學修飾。加州大學Davis分校和加拿大英屬哥倫比亞大學的研究人員對胎盤進行研究，揭示了人類胎盤的甲基化組，文章發表在本周的美國國家科學院院刊PNAS雜志上。他們發現，37%的胎盤基因組具有低甲基化區域(部分甲基化區域PMD)，這與大多數人體組織不同，在大多數人體
PNAS發布人類胎盤甲基化組
甲基化是控制基因表達的關鍵表觀遺傳學修飾。加州大學Davis分校和加拿大英屬哥倫比亞大學的研究人員對胎盤進行研究，揭示了人類胎盤的甲基化組，文章發表在本周的美國國家科學院院刊PNAS雜志上。他們發現，37%的胎盤基因組具有低甲基化區域(部分甲基化區域PMD)，這與大多數人體組織不同，在大多數人體
表觀遺傳學熱點酶的作用機制
加州大學圣芭芭拉分校的研究人員發現大腸桿菌的Dam酶在DNA上移動進行修飾時會發生“跳躍”，并對其物理特性和行為進行了分析，這一研究成果能為生物醫學研究和其他科學應用提供幫助。該文章發表在Journal of Biological Chemistry雜志上。 大腸桿菌的適應機制使其能依
Nature綜述：表觀遺傳學預測癌癥弱點
由Bellvitge生物醫學研究協會癌癥表觀遺傳與生物學研究組Manel Esteller領導的研究組，發表題為“DNA methylation profiling in the clinic: applications and challenges”的綜述文章，概況了近期在應用表觀遺傳
PerkinElmer發布表觀遺傳學和NGS新品
在上周舉行的實驗室自動化和篩查學會(SLAS)第二屆年會上，PerkinElmer公司展示了一系列新產品，包括表觀遺傳學生化工具箱、JANUS? NGS Express?液體處理工作站和Sciclone? NGSx Workstation?平臺。 表觀遺傳學新品 表觀遺傳學生化工
PNAS首次評估表觀遺傳學突變率
Groningen大學的科學家們在重要模式生物擬南芥中，精確評估了表觀遺傳學標志出現或消失的頻率，有助于深入理解表觀遺傳學改變在植物進化中的重要性。這項研究發表在五月十一日的美國國家科學院院刊PNAS雜志上。 表觀遺傳學修飾可以在不改變DNA序列的情況下影響基因的活性。大多數動物（包括人類）的
表觀遺傳學研究獲重大突破
同濟大學高紹榮團隊首次從全基因組水平上揭示了小鼠植入前胚胎發育過程中的組蛋白H3K4me3和HK27me3修飾建立過程，并發現寬的H3K4me3修飾在植入前胚胎發育過程中對基因表達發揮重要調控作用。相關成果9月15日在線發表于《自然》。 高紹榮研究組利用極少量的細胞檢測了小鼠植入前胚胎發育各個