DNA序列測定技術(Sanger雙脫氧鏈終止法與Maxam-Gilbert...
選擇隨機定向測定策略的影響因素(1)計算設備 任何大規模的測序計劃將在很大程度上依賴計算機程序對原始序列資料進行分類、整理和排列(Staden,1986)。在權衡隨機法的利與弊之時,必須將與適當的計算機設備進行聯機的問題放到壓倒一切的位置上來考慮。如果這些設備尚無從適當的計算機設備進行聯機的問題放到壓倒一切的位置上來考慮。如果這些設備尚無從談起,就必須將采用隨機策略的想法束之高閣,轉而從前已述及的兩種定向方法中擇一而行。(2)靶DNA 的性質:如果靶DNA 很可能會有散在的重復序列,那么就應當組建嵌套的缺失體用于測序。計算機在區分重復序列方面可能束手無策,而寡核苷酸引物則會同多個位點發生退火。(3)完成測序計劃所需時間:完成一個測序計旬所需工作蜈可通過以下指示進行估計:1)從單套反應中平均可是300-400核苷酸的序列。2)一個人一天可以輕松自如地操作24-32套反應。3)因此一個測序工作周,可以測出15kb核苷酸序列,這一......閱讀全文
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選擇隨機定向測定策略的影響因素(1)計算設備 任何大規模的測序計劃將在很大程度上依賴計算機程序對原始序列資料進行分類、整理和排列(Staden,1986)。在權衡隨機法的利與弊之時,必須將與適當的計算機設備進行聯機的問題放到壓倒一切的位置上來考慮。如果這些設備尚無從適當的計算機設備進行聯機的問題
DNA序列測定技術(Sanger雙脫氧鏈終止法與Maxam-Gilbert...2
二、Maxam-Gilbert DNA 化學降解法與包括合成反應的鏈終止技術不同,Maxam-Gilbert法要對原DNA 進行化學降解。這一方法是在體外研究lac阻抑制與lac操縱基因相互作用時醞釀發展起來的。時至今日,可以探測DNA 構象的蛋白質-DNA 相到作用,仍然是Maxam- G
DNA序列測定技術(Sanger雙脫氧鏈終止法與Maxam-Gilbert...3
3.DNA 聚合酶通常用于雙脫氧法序列測定的有幾種不同的酶,其中包括大腸桿菌DNA 聚合酶I的Klenow片段(Sanger等,1977),反轉錄酶(見文獻,如Mieredorf和Prfeffer,1987)經過修飾消除了 3'→5'外節酶活性的T7噬菌體DNA 聚合酶(
DNA序列測定技術(Sanger雙脫氧鏈終止法與Maxam-Gilbert...4
序列測定的技術和策略Sanger雙脫氧鏈終止法Maxam-Gilbert DNA 化學降解法測序策略目前應用的兩種快速序列測定技術是Sanger等(1977)提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化學降解法。雖然其原理大相徑庭,但這兩種方法都是同樣生成互相獨立的若干組帶放射性標記的
雙脫氧鏈終止法測定DNA序列
[目的] 掌握雙脫氧鏈終止法測定DNA序列的原理與方法[原理]DNA聚合酶催化的DNA鏈延伸是在3’-OH末端上進行的。由于2’,3’-雙脫氧三磷酸核苷酸(ddNTP)的3’-位脫氧而失去游離-OH,當它參入到DNA鏈后,3’-OH末端消失,使DNA鏈的延伸終止。本實驗根據此原理,將待測DNA片段插
雙脫氧鏈終止法測定DNA序列實驗原理、操作步驟和儀器...2
3.制備電泳凝膠及電泳(1)制備膠模:取雙塊制膠玻板,先用泡沫海綿沾“洗潔凈”液仔細擦洗,用水徹底淋洗,干燥后繼用酒精清洗,晾干,再用硅烷劑(repel- silane)將玻板的—面擦一遍,蒸餾水淋洗,干燥 (注意:清洗時應戴一次性手套操作)。將其中一塊玻板平置臺上(硅烷處理過的—面朝上),兩側各放
雙脫氧鏈終止法測定DNA序列實驗原理、操作步驟和儀器...3
3.單鏈模板的分離(1)沉淀M13:在上述M13培養物上清中,加入0.2倍體積的3.5mol/L醋酸銨/20%多聚乙二醇溶液,顛倒混勻數次,置冰浴30分鐘。離心15-30分鐘(11000g)可見白色噬菌體沉淀。小心除去上清液,可將試管倒置并吸去多余液體。(2)分離純化模板:向沉淀中加入TE緩沖液10
雙脫氧鏈終止法測定DNA序列實驗原理、操作步驟和儀器...1
[目的]掌握雙脫氧鏈終止法測定DNA序列的原理與方法[原理]DNA聚合酶催化的DNA鏈延伸是在3’-OH末端上進行的。由于2’,3’-雙脫氧三磷酸核苷酸(ddNTP)的3’-位脫氧而失去游離-OH,當它參入到DNA鏈后,3’-OH末端消失,使DNA鏈的延伸終止。本實驗根據此原理,將待測DNA片段插入
DNA測序儀定義
DNA序列測定分手工測序和自動測序,手工測序包括sanger雙脫氧鏈終止法和maxam-gilbert化學降解法。自動化測序實際上已成為當今 dna序列分析的主流。美國pe abi公司已生產出373型、377型、310型、3700和3100型等dna測序儀,其中310型是臨床檢測實驗室中使用最多
DNA測序儀
DNA序列測定分手工測序和自動測序,手工測序包括sanger雙脫氧鏈終止法和maxam-gilbert化學降解法。自動化測序實際上已成為當今 dna序列分析的主流。美國pe abi公司已生產出373型、377型、310型、3700和3100型等dna測序儀,其中310型是臨床檢測實驗室中使用最多的一
DNA測序實驗怎么做
歷史是 Rober Holley,1965年發表于Science雜志上的文章報道了酵母丙氨酸tRNA序列,77堿基。 吳瑞博士(Dr. Ray Wu)提出引物-延伸的測序策略。1971年首次成功的測定了λ噬菌體的兩個粘性末端。 F.Sanger,1977年,發表在Nature和PNAS上的文章描述了
DNA序列測定技術
DNA序列測定技術序列測定的技術和策略Sanger雙脫氧鏈終止法Maxam-Gilbert DNA化學降解法測序策略 目前應用的兩種快速序列測定技術是Sanger等(1977)提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化學降解法。雖然其原理大相徑庭,但這兩種方法都是同樣生成互相獨立的
DNA測序儀
DNA序列測定分手工測序和自動測序,手工測序包括sanger雙脫氧鏈終止法和maxam-gilbert化學降解法。自動化測序實際上已成為當今dna序列分析的主流。美國peabi公司已生產出373型、377型、310型、3700和3100型等dna測序儀,其中310型是臨床檢測實驗室中使用最多的一種型
基因診斷技術的DNA測序的相關介紹
目前在實驗室手工測序常用Sanger雙脫氧鏈終止法。Sanger法就是使用DNA聚合酶和雙脫氧鏈終止物測定DNA核苷酸序列的方法。它要求使用一種單鏈的DNA模板或經變性的雙鏈DNA模板和一種恰當的DNA合成引物。其基本原理是DNA聚合酶利用單鏈的DNA模板,合成出準確互補鏈,在合成時,某種dNT
DNA重組(DNA-recombination)技術:DNA序列測定1
㈣ DNA聚合酶 如前所述,選用合適的DNA聚合酶進行測序反應也是保證測序質量的重要因素之一。常用于雙脫氧末端終止法測序的有幾種不同的酶: 1.大腸桿菌DNA聚合酶Ⅰ大片段(Klenow片段) 此酶是最早用于建立Sanger測序的酶。但通常會有兩個問題:①Klenow片段的持續合成能力較
第三代基因測序儀技術原理
在分子生物學研究中,基因的序列分析是進一步研究和改造目的基因的基礎。用于測序的技術主要有Sanger等。發明的雙脫氧鏈末端終止法。Sanger法是根據核苷酸在某一固定的點開始,隨機在某一個特定的堿基處終止,產生A,T,C,G四組不同長度的一系列核苷酸,然后在尿素變性的PAGE膠上電泳進行檢測,從
關于第三代基因測序儀的技術原理介紹
第三代基因測序儀的技術原理:在分子生物學研究中,基因的序列分析是進一步研究和改造目的基因的基礎。用于測序的技術主要有Sanger等。發明的雙脫氧鏈末端終止法。Sanger法是根據核苷酸在某一固定的點開始,隨機在某一個特定的堿基處終止,產生A,T,C,G四組不同長度的一系列核苷酸,然后在尿素變性的
DNA重組(DNA-recombination)技術:DNA序列測定2
目前應用的兩種快速序列測定技術是Sanger等(1977)提出的酶法(雙脫氧鏈終止法)和Maxam(1977)提出的化學降解法。雖然其原理大相徑庭,但這兩種方法都同樣生成相互獨立的若干組帶放射性標記的寡核苷酸,每組核苷酸都有共同的起點,卻隨機終止于一種(或多種)特定的殘基,形成一系列以某一特定核苷酸
第三代基因測序儀技術原理
在分子生物學研究中,基因的序列分析是進一步研究和改造目的基因的基礎。目前(2009年)用于測序的技術主要有Sanger等。發明的雙脫氧鏈末端終止法。Sanger法是根據核苷酸在某一固定的點開始,隨機在某一個特定的堿基處終止,產生A,T,C,G四組不同長度的一系列核苷酸,然后在尿素變性的PAGE膠上電
DNA序列測定的技術和策略
目前應用的兩種快速序列測定技術是Sanger等(1977)提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化學降解法。雖然其原理大相徑庭,但這兩種方法都是同樣生成互相獨立的若干組帶放射性標記的寡核苷酸,每組寡核苷酸都有固定的起點,但卻隨機終止于特定的一種或者多種殘基上。由于DNA上的每一個堿
DNA序列測定技術
DNA序列測定技術序列測定的技術和策略Sanger雙脫氧鏈終止法Maxam-Gilbert DNA化學降解法測序策略目前應用的兩種快速序列測定技術是Sanger等(1977)提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化學降解法。雖然其原理大相徑庭,但這兩種方法都是同樣生成互相獨立的若干
關于MaxamGilbert法研究進展介紹
核酸的一級結構的闡明,對于了解基因的結構、調控和表達有著重要的意義。sanger和Coulson建立的加減法和Maxam和Gilbert建立的化學斷裂法使DNA序列分析技術有了革命性的突破。以后sanger等人又發展了雙脫氧核苷酸末端終止法,M13單鏈噬菌體克隆技術的建立使利用該法測定DNa序列
第一代基因測序技術的發明人
基因測序是一種新型基因檢測技術,能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列,預測罹患多種疾病的可能性,個體的行為特征及行為合理。基因測序技術能鎖定個人病變基因,提前預防和治療。 該技術始于20世紀70年代中期,1977年Maxam Gilbert報道了通過化學降解測定基因序列的方法。同一時期,英國劍
功能基因cDNA序列的分析
(一) cDNA序列的測定一.原理DNA 序列測定技術,目前主要是根據Sanger 等提出的酶法和Maxam和Gilber 提出的化學降解法,這兩種方法的原理大致相同。這里主要介紹Sanger 的酶法——雙脫氧鏈終止法。雙脫氧鏈終止法是Sanger 等人于1977 年建立起來的。它是利用了2'
常用分子生物學和細胞生物學實驗技術介紹(二)
核酸原位雜交用特定標記的已知順序核酸作為探針與細胞級或組織切片中核酸進行復性雜交并對其實行檢測的方法,稱為核酸原位雜交(nucleic acid hybridization in situ)。用來檢測DNA在細胞核或染色休上的分布,與細胞內RNA進行雜交以研究該組織細胞中特定基因表達水閏;還
Sanger法測序原理
Sanger法是根據核苷酸在某一固定的點開始,隨機在某一個特定的堿基處終止,并且在每個堿基后面進行熒光標記,產生以A、T、C、G結束的四組不同長度的一系列核苷酸,然后在尿素變性的PAGE膠上電泳進行檢測,從而獲得可見DNA堿基序列的一種方法。 在分子生物學研究中,DNA的序列分析是進一步研究和
sanger和他的DNA測序方法
sanger是英國生物化學家,1918年8月13日生于英格蘭格洛斯特夏郡,在劍橋大學圣· 約翰學院獲哲學博士學位,畢業后到著名的劍橋醫學研究會分子生物學實驗室工作。Sanger的工作主要研究蛋白質的結構,特別是研究測定胰鳥素分子的結構,成功地測定了胰鳥素的精細結構,因而獲得了1958年的諾貝爾化
DNA重組(DNA-recombination)技術:DNA序列測定3
2.利用末端轉移酶和α-32P-ddNTP標記DNA的3ˊ-末端 在二價陽離子存在下,末端轉移酶催化dNTP加入DNA分子的3ˊ-羥基末端,如果作為底物的核苷酸經過修飾(如ddNTP),則可以在DNA的3ˊ-OH上僅加入一個核苷酸。對于雙鏈DNA片段,亦存在DNA的兩側均被標記問題,可通過上述同
sanger和他的DNA測序方法
Sanger酶學法sanger是英國生物化學家,1918年8月13日生于英格蘭格洛斯特夏郡,在劍橋大學圣· 約翰學院獲哲學博士學位,畢業后到著名的劍橋醫學研究會分子生物學實驗室工作。Sanger的工作主要研究蛋白質的結構,特別是研究測定胰鳥素分子的結構,成功地測定了胰鳥素的精細結構,因而獲得了195
蛋白上游研究之Sanger測序技術的發展史
DNA測序技術是分子生物學研究中最常用的技術,它的出現極大地推動了生物學的發展。成熟的DNA測序技術始于20世紀70年代中期。1977年Maxam和Gilbert報道了通過化學降解測定DNA序列的方法。同一時期,Sanger發明了雙脫氧鏈終止法。20世紀90年代初出現的熒光自動測序技術將DNA測序帶