堿基編輯研究獲進展,為工業菌株改造提供新思路
鏈霉菌是許多重要天然產物的生產者,其基因組蘊含著大量未被開發的次級代謝生物合成基因簇。傳統的基于雙鏈斷裂的CRISPR/Cas9技術雖然已應用于鏈霉菌的基因組編輯,但需提供外源修復模板,且在多位點同時編輯的應用上仍有局限性。近年來,單堿基編輯技術已應用于天藍色鏈霉菌等一些模式菌株中,相較于傳統CRISPR技術更為方便快捷。堿基編輯的效率與底盤菌株尿嘧啶DNA糖苷酶(UDG)的功能密切相關,前期研究多用枯草芽孢桿菌噬菌體來源的尿嘧啶DNA糖苷酶抑制因子UGI來提升堿基編輯效率,但在某些情況下,其抑制效果并不理想。 中國科學院天津工業生物技術研究所研究員王猛帶領的高通量編輯與篩選平臺實驗室,與天津科技大學教授花而并團隊合作,在模式菌株變鉛青鏈霉菌Streptomyces lividans 66中研究了UDG與堿基編輯效率的關系,開發出新一代堿基編輯器asRNA-BE(antisense RNA interference-enh......閱讀全文
方興未艾:單堿基基因編輯技術
近一年多來,全世界范圍內多個實驗室圍繞“單堿基基因編輯技術”發表了大量的研究成果,而我國科學在此領域也取得了一系列重要進展。特別是近日,來自中山大學松陽洲和黃軍就實驗室在Protein & Cell雜志上發表了題為“Effective gene editing by high-fidelity
DNA堿基編輯:基因編輯工具“升級版”
美國哈佛大學14日宣布,將授予光束療法(Beam Therapeutics,下稱BT)公司全球ZL許可,對可用于治療人類疾病的一套革命性DNA堿基編輯技術進行開發和商業化。 BT公司同日宣布,已經籌集了高達8700萬美元由F-Prime資本和ARCH風投牽頭的A輪融資。BT公司由基因編輯技術領
DNA堿基編輯:基因編輯工具“升級版”
美國哈佛大學14日宣布,將授予光束療法(Beam Therapeutics,下稱BT)公司全球ZL許可,對可用于治療人類疾病的一套革命性DNA堿基編輯技術進行開發和商業化。 BT公司同日宣布,已經籌集了高達8700萬美元由F-Prime資本和ARCH風投牽頭的A輪融資。BT公司由基因編輯技
單堿基基因編輯技術之工具篇
今年5月,David R. Liu教授與張鋒教授等人聯合創立Beam Therapeutics公司,再一次將“單堿基編輯技術”送上了熱搜榜,趁著熱度還未散去,我們繼上一期“單堿基編輯技術淺談”后,又為大家準備了一篇超級實用性的深度分析,帶你一起看看單堿基編輯的前世今生及如何一步步發展壯大的歷程!
單堿基基因編輯技術之工具篇
前言 今年5月,David R. Liu教授與張鋒教授等人聯合創立Beam Therapeutics公司,再一次將“單堿基編輯技術”送上了熱搜榜,趁著熱度還未散去,我們繼上一期“單堿基編輯技術淺談”后,又為大家準備了一篇超級實用性的深度分析,帶你一起看看單堿基編輯的前世今生及如何一步步發展
單堿基基因編輯技術之工具篇
前言今年5月,David R. Liu教授與張鋒教授等人聯合創立Beam Therapeutics公司,再一次將“單堿基編輯技術”送上了熱搜榜,趁著熱度還未散去,我們繼上一期“單堿基編輯技術淺談”后,又為大家準備了一篇超級實用性的深度分析,帶你一起看看單堿基編輯的前世今生及如何一步步發展壯大的歷程!
基因編輯大牛Nature子刊發文:CRISPR單堿基編輯準確!
來自韓國基礎科學研究所IBS的研究人員發表了題為“Genome-wide target specificities of CRISPR RNA-guided programmable deaminases”的文章,證實了最近研發的基因編輯方法的準確性。這一研究成果公布在4月10日的Nature
全新「堿基編輯器」:不用「切割」也能精準編輯基因
原標題:不用「切割」也能精準編輯基因了,華人學者開發全新「堿基編輯器」摘要:CRISPR 基因編輯技術之外的新工具。基因編輯技術有了重大進展。Broad 研究所的華人學者 David Liu 教授的團隊開發出了一種「堿基編輯器」,可以讓細胞內 DNA 的一種堿基通過簡單的化學反應,變成另一種
單堿基基因編輯研究進展速覽
本文中,小編整理了近年來科學家們在單堿基基因編輯研究領域取得的新進展,分享給大家! 【1】Nat Commun:科學家首次在豬身上實現多位點單堿基編輯 doi:10.1038/s41467-019-10421-8 近日,中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院賴良學課題組利用單堿基編輯器首次在豬
單堿基基因編輯系統,基因治療又一利器
TaC9-ABE單堿基編輯技術原理。黃博純 供圖近日,中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員賴良學與五邑大學副教授鄒慶劍團隊合作首次將腺苷脫氨酶與轉錄激活因子樣效應子(TALE)融合,開發了一種不會產生Cas9依賴性脫靶的新型堿基編輯系統TaC9-ABE。相關研究3月24日在線發表于《細胞發現》(
從同源重組到堿基編輯器-看基因編輯72變
基因編輯尤其是“基因魔剪”CRISPR的新聞報道幾乎每天都能見到。僅在3月份,就有兩篇引起廣泛關注的重磅成果,其一,曾與張峰合作開創“基因魔剪”CRISPR的科技大牛劉如謙(David Liu),利用基因編輯技術研發出給細胞活動拍照的“細胞記錄儀”(CAMERA)。正如黑匣子能記錄事故發生時的
天藍色鏈霉菌的基因特征
天藍色鏈霉菌(Streptomyces coelicolor)基因組,也是迄今最大的微生物基因組的測序工作,該基因組中蘊藏著令人驚奇而又大有前途的基因組特征。科學家們力圖將該細菌轉化成更佳的藥物開發工具。 天藍色鏈霉菌是生產三分之二用于醫藥的天然抗生素以及共9000余種具生物活性物質的鏈霉菌大
新基因編輯法可成功逆轉單個堿基變異
最近一期英國《自然》雜志刊登一則基因編輯改進方法,可定位和修改DNA單個堿基,并且不在基因組中引入隨機插入或缺失的基因。這種新的“堿基編輯”法使用一種修飾過的CRISPR/Cas9蛋白質,使它和另外兩種蛋白一同工作,比現有改正單堿基變異的方法更高效。 大多數遺傳疾病源于單核苷酸的突變(點突變
作物基因組單堿基編輯方法研究取得進展
單核苷酸點突變是作物許多重要農藝性狀發生變異的遺傳基礎。單堿基的變異會導致氨基酸替換或蛋白質翻譯終止,使基因功能發生改變,從而有可能產生優良的等位基因與優異性狀。傳統誘變及單堿基突變篩選技術(如TILLING)需要進行基因組規模的篩選,耗時、耗力且鑒定到的點突變數目和種類有限。基因組編輯技術,特
世界首次證實單堿基基因編輯存在脫靶效應
基因編輯技術越來越火,然而針對基因編輯工具最大的風險——脫靶效應,一直以來缺乏良好的檢測工具。記者從中科院神經科學研究所獲悉,其團隊與多家機構合作完成的研究,建立了一種在精度、廣度和準確性上遠超越之前的基因編輯脫靶檢測技術,這一技術首次證實:近年來興起的單堿基編輯技術有可能導致大量無法預測的脫靶
CRISPRCas系統無需斷鏈編輯基因
英國《自然》雜志6月12日在線發表的論文稱,美國科學家團隊開發出一種完全可編輯的CRISPR-Cas基因組編輯系統,其可以介導DNA精準插入基因組。該方法無需在靶DNA中產生雙鏈斷裂,避免了由此導致的遺傳編碼的非預期改變。 CRISPR-Cas系統又稱“基因魔剪”,自問世以來迅速成為生物科學領
堿基編輯研究獲進展,為工業菌株改造提供新思路
鏈霉菌是許多重要天然產物的生產者,其基因組蘊含著大量未被開發的次級代謝生物合成基因簇。傳統的基于雙鏈斷裂的CRISPR/Cas9技術雖然已應用于鏈霉菌的基因組編輯,但需提供外源修復模板,且在多位點同時編輯的應用上仍有局限性。近年來,單堿基編輯技術已應用于天藍色鏈霉菌等一些模式菌株中,相較于傳統C
新型雙堿基編輯器助力基因飽和突變文庫構建
近日,中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員賴良學課題組在新型堿基編輯器開發方面取得重要進展,獲得了可同時兼具當前多種單堿基編輯器及CRISPR/Cas9基因編輯功能的多功能堿基編輯器,可廣泛地誘導產生多種模式的突變,對于飽和突變文庫構建、基因突變功能研究等方面具有重要促進作用。相關研究在線發表于
利用單堿基編輯器實現多位點單堿基編輯DMD及HGPS豬模型
6月28日,中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院賴良學課題組在國際學術期刊Nature Communications(《自然-通訊》)發表了題為Efficient base editing for multiple genes and loci in pigs using base editors
鏈霉菌,你了解多少?
簡介 鏈霉菌(Streptomycetaceae)是最高等的放線菌。放線菌目的一科。 有發育良好的分枝菌絲,菌絲無橫隔,分化為營養菌絲、氣生菌絲、65孢子絲。孢子絲再形成分生孢子。 孢子絲和孢子的形態、顏色因種而異,是分種的主要識別性狀之一。已報道的有千余種,主要分布于土壤中。愛醫培
鏈霉菌,你了解多少?
放線菌目的一科。基內菌絲不斷裂,氣生菌絲通常發育良好,形成長(有時短)的孢子絲。孢子不能運動,外鞘上常有疣、刺或毛發等狀飾物。簡介鏈霉菌(Streptomycetaceae)是最高等的放線菌。放線菌目的一科。有發育良好的分枝菌絲,菌絲無橫隔,分化為營養菌絲、氣生菌絲、65孢子絲。孢子絲再形成分生孢子
什么是鏈霉菌屬?
鏈霉菌屬(Streptomyces)共約1000多種,其中包括和很多不同的種別和變種。它們具有發育良好的菌絲體,菌絲體分枝,無隔膜,直徑約0.4~1微米,長短不一,多核。菌絲體有營養菌絲、氣生菌絲和孢子絲之分,孢子絲再形成分生孢子。孢子絲和孢子的形態因種而異,這是鏈霉菌屬分種的主要識別性狀之一。
鏈霉菌,你了解多少?
簡介 鏈霉菌(Streptomycetaceae)是最高等的放線菌。放線菌目的一科。 有發育良好的分枝菌絲,菌絲無橫隔,分化為營養菌絲、氣生菌絲、65孢子絲。孢子絲再形成分生孢子。 孢子絲和孢子的形態、顏色因種而異,是分種的主要識別性狀之一。已報道的有千余種,主要分布于土壤中。愛醫培
藍色鏈霉菌中篩選出活性基因簇
荷蘭格羅寧根大學的研究人員利用基因挖掘法從藍色鏈霉菌中發現了一組活性基因簇,通過該基因簇可制造出無耐藥性的新型抗生素,該研究有望為鏈霉菌的藥用開發提供一條新思路。相關研究發表在最新一期《微生物學》雜志上。 鏈霉菌是生活在土壤中的一種常見細菌,其家族包含多種細菌。不同于其他細
中國科學家運用堿基編輯技術修正胚胎基因突變
廣州中山大學的研究人員運用堿基編輯技術(base editing)糾正了組成人類基因 30 億個密碼排列中的一個錯誤。 他們用這種方法對胚胎的基因進行改變處理,排除了可以導致 β -地中海貧血疾病的錯誤。但該胚胎并沒有被植入人體,它只供試驗室使用。研究人員說這項技術將來可以用于治
單堿基修復基因編輯公司Beam獲8700萬美元A輪支持
新聞事件 今天幾位華人基因編輯科學家創建的單堿基修復基因編輯公司Beam獲得8700萬美元A輪支持。Editas的三位創始人MIT的張鋒、哈佛的David Liu、和Mass General的Keith Young聯手創立了Beam,CEO為Agios的原高管John Evans。本輪投
基于堿基編輯的全基因組擾動文庫構建與篩選技術
通過全基因組規模擾動文庫的構建與篩選,從宏觀基因組層面系統研究基因型與表型的對應關系,是微生物功能基因組學研究的重要方法。相較于單個基因擾動文庫的構建與篩選,混合文庫的構建與篩選可通過一次實驗實現特定條件下對上千個基因的同時篩選,顯著提高通量。近年來,CRISPR/Cas技術憑借著精簡高效、可編
一種堿基編輯器成功修改活小鼠腸道細菌基因
科學家設計了一種基因編輯工具,可以改變活小鼠腸道微生物組中的細菌。7月10日,相關研究成果發表于《自然》。 該工具是一種堿基編輯器,可以修改小鼠腸道內90%以上大腸桿菌菌落的靶基因。“我們一直夢想能夠做到這一點。”法國巴黎生物技術公司Eligo Bioscience的聯合創始人、合成生物學家X
我國科學家開發更高精度的單堿基基因編輯工具
單堿基編輯技術是一種是自2012年CRISPR/Cas9技術被發現以來最寄予厚望的高精度基因編輯技術,其中一種單堿基編輯技術BE3可以在不切斷DNA雙鏈的情況下精確地引入由C/G到T/A的點突變,另外一項單堿基編輯技術ABE7.10可以由T/A突變成C/G的技術,對于基因突變導致的遺傳疾病的治療
鏈霉菌屬的分類介紹
中科院微生物研究所根據氣生菌絲(孢子堆)的顏色、基內菌絲的顏色、可溶性色素、孢子絲的形狀、孢子的形狀和表面結構等特征,將本屬分為14個種組,每個種組又包括許多不同的種,以此做為鏈霉菌屬各種的鑒定和尋找新的抗生素產生菌的依據。主要代表如產生鏈霉素的灰色鏈霉菌。