《Cell》探討“垃圾”DNA的新功能
美國國立衛生研究院下屬國家關節肌肉骨骼及皮膚病研究所(NIAMS)的科學家們在新研究中證實，過去被認為是“垃圾”的DNA在免疫系統反應中發揮了關鍵性的作用。研究結果發表在近期的《細胞》(Cell)雜志上，有可能促成發現治療免疫相關疾病的新靶點。 人類基因組中有32億DNA堿基對，但只有2%的區域能夠編碼蛋白質。其他的大量冗余DNA，和基因一樣都是遺傳材料，但卻不能編碼用于建造動物身體、加速細胞內化學反應的蛋白質。到目前為止，這些基因組DNA的功能大多未知且遭到忽視。 采用全基因組DNA測序技術，美國國立衛生研究院的研究人員對基因組DNA進行了檢測，以確定哪部分積極參與支持了各種細胞功能。研究人員發現信號傳導及轉錄激活因子(STAT)蛋白家族成員在形成免疫系統輔助性T細胞(T helper cell)特性中發揮主要作用。重要的是，當研究“垃圾”DNA的影響時，他們看到STAT蛋白對于增強子活性的調控有可能導......閱讀全文
研究人員繪出蘋果基因組草圖
一個國際科研小組8月29日在英國《自然—遺傳學》（Nature Genetics）雜志上報告說，他們繪出了蘋果的基因組草圖，這將有助于從基因水平上分析蘋果性狀，培育更多蘋果新品種。 意大利、美國、新西蘭等國研究人員報告說，他們繪出的是廣受人們喜愛的“金冠蘋果”的基因組草圖。結果
癌癥研究人員聯手匯集腫瘤基因組數據
研究人員希望，數據分享將為利用諸如這些腦部腺癌細胞等腫瘤的基因組信息帶來更好的方法。 這是為大型癌癥研究中心的很多病人提供的最新希望：“讓我們測序你的腫瘤，或許我們能將其同擊敗這種惡性疾病的藥物匹配。”不過，現實是基因組分析仍然僅為癌癥病人提供了一小部分幫助。“我們多半時候不知道如何處理這些
研究人員破譯香蕉“美食蕉”品種香蕉基因組
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/512730.shtm廣東省農業科學院研究員易干軍領銜的香蕉遺傳改良團隊與廣西大學教授陳玲玲團隊合作，破譯了香蕉“美食蕉”品種香蕉基因組，首次在國際上組裝染色體級別的異源三倍體香蕉栽培種（AAB）參考基因
研究人員成功構建首個圭亞那柱花草基因組
在國家自然科學基金等項目的資助下，華南農業大學副教授陳曙團隊成功完成首個圭亞那柱花草染色體水平基因組組裝，從基因組、轉錄組及表觀遺傳組多維度解析其抗逆分子機制，為熱帶牧草分子育種與抗逆研究提供關鍵理論支撐與基因資源。相關成果近日發表于《植物雜志》（The Plant Journal）。圭亞那柱花草比
法研究人員發現分辨聲音的蛋白質
據路透社報道，法國研究人員日前發現，一種內耳蛋白質能幫助人們分辨聲音，理解談話內容。這項研究成果有助于解決聽覺障礙問題。 法國研究人員保羅·阿旺說，這一發現不能用來治療耳聾，但有助于解釋為何一些人會出現聽力障礙，尤其是在嘈雜的環境中。 研究人員在轉基因老鼠身上進行試驗，研究內耳耳蝸。耳蝸中包括兩
研究人員發現：霍亂正改變人類基因組
生命演化到今天，人類似乎已經進入最完美的狀態。我們的基因組是否已經穩定?改變是否還在發生?科學家們一直在尋找答案。一項新研究表明，當代人類也在進化，而引發這種進化的，竟然是霍亂。研究人員發現的證據證明：在霍亂流行的孟加拉國，人們的基因已經找到了對抗霍亂的辦法。這是發生在當代的人類進化案
研究人員發布最新版樹鼩基因組注釋
樹鼩是一種與實驗大鼠差不多大小的小型哺乳動物，是靈長類的近親。由于其繁殖周期短（約6周），飼養成本低，單胎產仔數較高（每胎2-5只）等特點，在某些方面有望替代非人靈長類用于生物醫學研究和應用。目前，樹鼩已被用于多種感染性疾病模型創建，是研究視覺系統與功能的很好的動物。中國科學院昆明動物研究所研究
研究人員首次破譯艾滋病病毒完整基因組
新華網華盛頓8月6日電 美國北卡羅來納大學6日報告說，該校的一個科研小組成功破譯了艾滋病病毒的完整基因組。這對于人類理解艾滋病病毒感染人體的機制，尋找抗“艾”新療法提供了有力幫助。 相關論文發表在6日出版的英國《自然》雜志上。研究小組負責人凱文·威克斯介紹說，艾滋病病毒的遺傳信息由單鏈核糖
研究人員構建人類陰道微生物基因組庫
6月21日，深圳市寶安中醫院（集團）副院長黃鏈莎、轉化醫學中心助理研究員孫文與大連醫科大學副教授鄢秋龍等課題組的最新合作成果發表于《自然—微生物學》。人類女性陰道是一個包括細菌、真菌和病毒在內的復雜微生態系統，各微生物之間是相互制約、相互作用、相互依賴、對立統一的關系，其間的平衡關乎女性生殖健康及胎
研究人員發現蛋白質如何保護細胞免于死亡
休斯敦大學醫學院的研究人員發現，體內的蛋白質如何減少高滲，細胞內水和溶質不平衡的不良影響。高滲性導致細胞收縮并終導致細胞死亡。該發現可能對包括腦腫瘤水腫，自身免疫性疾病和腎臟損害在內的多種疾病產生影響UH醫學院的生物化學臨床教授Raj Kumar說：“我們發現了一種稱為活化T細胞5(NFAT 5)核
安捷倫授予臨床基因組研究人員Peter－Robinson“思想領袖獎”
分析測試百科網訊 2016年11月29日，安捷倫科技宣布將安捷倫思想領袖獎授予給Peter Robinson, M.D., MSC，以表彰其對臨床基因組學和計算生物學的貢獻。在今年早些時候，中國中醫科學院中藥研究所所長陳士林（詳見本網報道：中藥研究所所長陳士林獲得“安捷倫思想領袖獎”）和癌癥研究
日本研究人員首次成功繪制日本人基因組圖譜
據日本共同社報道，日本理化學研究所基因組醫科學研究中心日前通過新一代DNA測序儀成功繪制出首份日本人基因組圖譜。該成果10月24日發表在美國《自然—遺傳學》雜志網絡版上。 DNA一共有4種堿基排列組合，人類大約有30億對堿基對。新一代測序儀可將DNA進行極其精細的切片，對大量切片同時
研究人員完成棗和酸棗單倍型基因組組裝
近日，西北農林科技大學林學院紅棗團隊黃建研究員課題組以我國制干棗主栽品種‘駿棗’和著名“秦藥”代表清澗酸棗為研究材料，整合了PacBio HiFi、ONT ultra-long和Hi-C等多種先進測序技術以及多種組裝策略完成了棗和酸棗T2T gap-free和T2T gap-free單倍型基因組的組
研究人員成功測序蒙特莫朗西酸櫻桃基因組
密歇根州的酸櫻桃產量在全美名列前茅，密歇根州立大學的一個研究小組啟動了一個項目，旨在確定與酸櫻桃樹晚開有關的基因，以滿足不斷變化的氣候的需要。他們首先將晚開的櫻桃樹的DNA序列與一個相關物種--桃子的基因組測序進行了比較。他們首先將開花遲緩的酸櫻桃樹的DNA序列與它們的親戚桃子的基因組序列進行比較。
研究人員觀測到人類基因組新的“暗物質”
人類對基因組變異的認識又向前推進一大步：西安交通大學日前傳出消息，該校葉凱青年科學家工作室團隊與荷蘭、美國、德國的20個科研機構，通過開發新的計算機算法和分析處理流程，分析并報道了在250個健康家庭的基因組中的所有類型變異，其中包括以前從未觀測到的大量復雜型變異，即基因組中的“暗物質”。 據介
研究人員解析人類基因組計劃的贏利奧秘
人類基因組計劃(genome project)為美帶來1萬億美元經濟增長。 美國巴特爾紀念研究所6月12日發布的一份頗具爭議的報告指出，解碼人類基因組項目的經濟收益持續增長。該項目結束10年后，目前其帶來的收益已接近1萬億美元。 1988~2003 年進行的人類基因組計劃(genom
美研究人員：先吃蔬菜蛋白質后吃米面益處多
美國韋爾·康奈爾醫學院的研究人員在《糖尿病護理》期刊發表報告說，用餐時先吃蔬菜和蛋白質，最后吃碳水化合物，有助延長飽腹感，防止餐后血糖飆升。研究人員征募１１名肥胖或超重的Ⅱ型糖尿病患者，讓他們夜間禁食１２小時，隨后攝入包含蛋白質、碳水化合物和脂肪的６２８卡路里食物。第一周，研究對象先吃碳水化合物
研究人員創建精準N糖蛋白質組學分析方法
復旦大學化學系教授楊芃原團隊、中科院計算技術研究所研究員賀思敏團隊、國家蛋白質科學中心（上海）研究員黃超蘭團隊合作，創建了基于質譜的高通量糖基化肽段分析方法，為精準N糖蛋白質組學提供了新技術。9月5日，相關研究成果發表于《自然—通訊》。 糖基化是最復雜的蛋白后修飾之一。與其他蛋白后修飾相比
我國研究人員開發了蛋白質瞬時原位激活新技術
近日，北京大學陳鵬課題組與王初課題組發展了一種在活體細胞或動物內瞬時激活蛋白質的普適性新技術，具體成果發表在Nature上，題為Time-resolved protein activation by proximal decaging in living systems。 在復雜的生命體系中原
PNAS：特殊蛋白質可控制機體“基因組衛士”
近日，發表在國際雜志PNAS上的一篇研究報告中，來自蒙特利爾臨床研究學院的科學家通過研究鑒別出了免疫反應已知機制的一種新的作用亮點，研究人員發現了一種新型特殊蛋白，其可以控制“基因組衛士”—p53腫瘤抑制蛋白的活性。 文章中，研究者對T細胞和B細胞的發育也進行了深入研究，這兩種細胞均是保護機體
研究人員提出基因組結構變異檢測和分型新方法
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519653.shtm
全球研究人員致力于創造首個合成真核生物基因組
10年前，當遺傳學家Ronald Davis首次提出，他的同事正在嘗試創造人工酵母染色體，并將其放入活細胞時，Jef Boeke并沒有太多想法。Davis就職于美國加州斯坦福大學醫學院，是一個有遠見的人。他提出，實驗室酵母是當時合成生物學領域的下一個發展方向。不過，Boeke并不理
研究人員開發定量蛋白質組學數據的下游分析工具
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/507985.shtm
比利時研究人員發現與腦積水有關的蛋白質
比利時研究人員日前發現，兩種特殊蛋白質的缺乏會使大腦腦液流動異常，從而可能引發腦積水等腦部疾病。 保護人腦的腦液通常在大腦細小的孔洞里流動，一日更新數次，一旦流動不暢就會引起大腦孔洞的擴張，顱壓升高，從而造成腦積水。 比利時魯汶天主教大學研究人員2日發布公告說，腦液的流
蛋白質、基因組與人類疾病有了關聯圖
據《科學》雜志近日發表的一項最新研究，研究人員將人體血液中的數千種蛋白質數據與遺傳數據相結合，繪出了蛋白質、基因組與人類疾病的網絡關系圖，顯示了影響這些蛋白質的遺傳差異如何將多種多樣的相關疾病聯系在一起。通過創建基因組蛋白質組圖，科學家們發現了不同人類疾病之間的數百種新聯系。 蛋白質故障會導
蛋白質組學之逆襲，深度注釋基因組
申請課題缺創新點？撰寫論文沒思路？急著畢業時間緊？別怕，對于吉凱，一切都是套路！更有甚者，對于宇宙終極難題：“屌絲如何逆襲白富美？”老司機黃博也有一套經典案例分享給大家。 從前，在生物學研究領域，有一個白富美叫基因組學（Genomics），她有一項強大的技能：DNA測序，憑借這項技能，她完
Nat－Rev－Cancer綜述：腫瘤蛋白質基因組學
導 讀? ? ? ?腫瘤蛋白質基因組學（Cancer proteogenomics）是將基于質譜（MS）的蛋白質豐度和翻譯后修飾（PTM）信息與臨床前腫瘤模型和腫瘤樣本的基因組、表觀基因組和轉錄組數據相結合的組學技術。基因組學和表觀基因組學為解釋可能發生的生物過程提供了基礎知識，蛋白質組學是對已經發
蛋白質、基因組與人類疾病有了關聯圖
據《科學》雜志近日發表的一項最新研究，研究人員將人體血液中的數千種蛋白質數據與遺傳數據相結合，繪出了蛋白質、基因組與人類疾病的網絡關系圖，顯示了影響這些蛋白質的遺傳差異如何將多種多樣的相關疾病聯系在一起。 通過創建基因組蛋白質組圖，科學家們發現了不同人類疾病之間的數百種新聯系。 蛋白質故障會
研究人員發布全基因組單核苷酸變異數據庫
10月22日，國際學術期刊Genome Biology 以PGG.SNV： understanding the evolutionary and medical implications of human single nucleotide variations in diverse popul
研究人員從從基因組水平揭示食肉目染色體進化規律
染色體進化是物種形成和演化的重要驅動因素。具有顯著核型差異的食肉目動物為染色體進化研究提供了很好的研究素材。雖然前人通過比較染色體涂色法建立了食肉目內許多物種的染色體比較圖譜，但這些研究的分辨率比較低，尚沒有深入到精細的核苷酸水平，也不能在核苷酸水平研究不同食肉目物種間的共線性區塊、染色體重排以