顯然是選random primer更好,其實說明書是有寫的啦,原因是RT-PCR逆轉錄是要得到一個所有的RNA的cDNA庫,然后再P出你要的“幾個基因”,所以不是每個基因的mRNA都是有polyA的,很多都是沒有的,microRNA,piRNA,很多都沒有哦,所以如果你用oligo dT引物,就自然會miss掉很多(確實是很多)的RNA,而隨機引物不會有這個問題,用它反轉錄出來的cDNA豐度更高,結果更加準確!!......閱讀全文
目前發現的大多數lncRNA都帶有poly(A),可以通過Oligo(dT)、隨機引物進行反轉錄擴增合成cDNA
顯然是選random primer更好,其實說明書是有寫的啦,原因是RT-PCR逆轉錄是要得到一個所有的RNA的cDNA庫,然后再P出你要的“幾個基因”,所以不是每個基因的mRNA都是有polyA的,很多都是沒有的,microRNA,piRNA,很多都沒有哦,所以如果你用oligo dT引物,就自然
1. ?如何測定引物的OD值? 用紫外分光光度計在260nm波長測定溶液的吸光度來定量,請注意紫外分光光度計的使用,測定時溶液的吸光度最好稀釋到0.2~0.8之間(吸光度太高或太低會有較大的誤差)。DNA干粉用一定體積的水充分振蕩溶解以后,取部分溶液稀釋到1 ml 并在1 ml 標準比色皿中測定其
1. 如何測定引物的OD值?用紫外分光光度計在260nm波長測定溶液的吸光度來定量,請注意紫外分光光度計的使用,測定時溶液的吸光度最好稀釋到0.2~0.8之間(吸光度太高或太低會有較大的誤差)。DNA干粉用一定體積的水充分振蕩溶解以后,取部分溶液稀釋到1 ml 并在1 ml 標準比色皿中測定其吸光度
1、引物長度一般為15-30bp,常用的為18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般為40%-60%,以45-55%為宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所對應的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之間,Tm值曲線以選取72度附近為佳,5'到 3
?一、實驗器具與材料:1、移液槍:1ml、200μl、20μl、10μl、2μl2、吸頭:1ml、200μl、20μl3、勻漿管:5ml4、吸頭臺:放置1ml吸頭的一個,放置20μl吸頭的一個5、EP管:1.5ml、0.2ml、100μl6、試劑瓶:2個60ml的棕色試劑瓶(廣口,帶蓋);1個125
一、準備工作1、實驗器具與材料:(1)移液槍:200ul、10ul(2)吸頭:200ul、20ul(3)EP管1。5ml、100ul(4)水浴箱2、實驗器具的處理與準備塑料制品:(包括吸頭、EP管等)將塑料制品逐個浸泡于1‰DEPC水中(必要時小槍頭需要用吸管打入DEPC水)37℃過夜,然后送至高壓
一、準備工作1、實驗器具與材料:(1)移液槍:200ul、10ul(2)吸頭:200ul、20ul(3)EP管1。5ml、100ul(4)水浴箱2、實驗器具的處理與準備塑料制品:(包括吸頭、EP管等)將塑料制品逐個浸泡于1‰DEPC水中(必要時小槍頭需要用吸管打入DEPC水)37℃過夜,然后送至高壓
隨機引物是指當特定mRNA由于含有使逆轉錄酶終止的序列而難于拷貝其全長序列時,可采用隨機六聚體這一非特異的引物來拷貝全長mRNA。 1.特異性引物一般在增低豐度目的基因才選擇使用,用得比較少。一般都推薦用Oligo(dT)或隨機引物代替基因特異性引物。由于rna的二級結構破壞不完全,導致特異性
一 設計引物應遵循以下原則1 、引物長度: 15-30bp,常用為20bp左右。2 、引物擴增跨度: 以200-500bp為宜,特定條件下可擴增長至10kb的片段。3 、引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴增效果不佳,G+C過多易出現非特異條帶。ATGC最好隨機分布,避免5個以上