做realtimepcr，逆轉錄引物怎么選擇
顯然是選random primer更好，其實說明書是有寫的啦，原因是RT-PCR逆轉錄是要得到一個所有的RNA的cDNA庫，然后再P出你要的“幾個基因”，所以不是每個基因的mRNA都是有polyA的，很多都是沒有的，microRNA，piRNA，很多都沒有哦，所以如果你用oligo dT引物，就自然會miss掉很多（確實是很多）的RNA，而隨機引物不會有這個問題，用它反轉錄出來的cDNA豐度更高，結果更加準確！！......閱讀全文
mRNA差異顯示技術的原理
差異基因表達是細胞分化的基礎。正是這些基因在細胞中的特異表達與否，決定了生命歷程中細胞的發育和分化、細胞周期的調節、細胞衰老和死亡等。mRNA DD-PCR技術正是對組織特異性表達基因進行分離的一種快速而行之有效的方法。不同的組織/細胞或遺傳背景相同的同一組織/細胞經過不同的處理后，提取各自的總
增加RTPCR特異性
第一鏈cDNA合成的起始可以使用三種不同的方法，各種方法的相對特異性影響了所合成cDNA的量和種類。隨機引物法是三種方法中特異性最低的。引物在整個轉錄本的多個位點退火，產生短的，部分長度的cDNA。這種方法經常用于獲取5'末端序列及從帶有二級結構區域或帶有逆轉錄酶不能復制的終止位點的RNA模
如何增加RTPCR特異性？
?起始cDNA合成? ? 第一鏈cDNA合成的起始可以使用三種不同的方法，各種方法的相對特異性影響了所合成cDNA的量和種類。? ? 隨機引物法是三種方法中特異性最低的。引物在整個轉錄本的多個位點退火，產生短的，部分長度的cDNA。這種方法經常用于獲取5'末端序列及從帶有二級結構區域或帶有逆
增加RTPCR特異性的辦法（提高逆轉錄保溫溫度和減少基...
第一鏈cDNA合成的起始可以使用三種不同的方法，各種方法的相對特異性影響了所合成cDNA的量和種類。隨機引物法是三種方法中特異性最低的。引物在整個轉錄本的多個位點退火，產生短的，部分長度的cDNA。這種方法經常用于獲取5'末端序列及從帶有二級結構區域或帶有逆轉錄酶不能復制的終止位點的RNA模
提高RTPCR特異性的方法總結
第一鏈cDNA合成的起始可以使用三種不同的方法，各種方法的相對特異性影響了所合成cDNA的量和種類。????? 隨機引物法是三種方法中特異性最低的。引物在整個轉錄本的多個位點退火，產生短的，部分長度的cDNA。這種方法經常用于獲取5'末端序列及從帶有二級結構區域或帶有逆轉錄酶不能復制的終止位
引物延伸反應
Primer extension analysis is used to determine the location and quantitate the amount of the 5′-end of specific RNAs. An end-labeled oligonucleotide i
引物延伸實驗
實驗材料 RNA試劑、試劑盒 T4多核苷酸激酶dATP醋酸鈉乙醇EDTARNaseA苯酚氯仿儀器、耗材 恒溫培養箱NAP-5柱-70°C冰箱低溫離心機實驗步驟 1. ?依次加入下列試劑，建立用以標記引物的反應混合液（終體積10 μl）（1）2.5 μl ?H2O（2）1 μl ?10×T4多核苷酸激
引物延伸實驗
? ? ? ? ? ? 實驗材料 RNA 試劑、試劑盒 T4多核苷酸激酶 dATP 醋酸鈉 乙醇
隨機引物法
此法系可用于從低熔點瓊脂糖凝膠中回收 DNA 的放射性標記 ( Feinberg 和 Vogelstein 1983，1984)。本實驗來源「分子克隆實驗指南第三版」黃培堂等譯。實驗方法原理此法系可用于從低熔點瓊脂糖凝膠中回收 DNA 的放射性標記 ( Feinberg 和 Vogelstein 1
引物參數計算
Simple javascript Oligo CalculatorOligo CalculatorEnter Oligo Sequence in BoxLength?Melting Temperature (Tm)??°C%GC contentMolecular Weight:??daltons
引物延伸實驗
引物延伸分析用于確定位置和定量特定RNA的5'-端的數量。結束標記的寡核苷酸雜交，RNA和利用中存在的脫氧核苷酸逆轉錄作為底漆。因此RNA的反轉錄成cDNA，變性聚丙烯酰胺凝膠電泳分析。cDNA的長度反映了基地之間的標記引物和RNA的5'-端核苷酸的數量，基因產品的數量是針對性的RN
引物退火溫度
一般低4、5度就好了。如果你用軟件設計的引物，比如oligo6什么的，它會在tm之外給你一個operate t，就是操作溫度，用這個就好了。
什么是引物？
引物，是指在核苷酸聚合作用起始時，刺激合成的，一種具有特定核苷酸序列的大分子，與反應物以氫鍵形式連接，這樣的分子稱為引物。引物通常是人工合成的兩段寡核苷酸序列，一個引物與靶區域一端的一條DNA模板鏈互補，另一個引物與靶區域另一端的另一條DNA模板鏈互補，其功能是作為核苷酸聚合作用的起始點，核酸聚合酶
怎么設計引物
選擇引物的一般規則設計和選擇引物時有5個要素必需注意。1 引物的3′末端不互補 引物的3′末端一定不能有很大的互補性，因為它們的互補會形成引物二聚體，這就會帶來很大的問題，例如合成出非專一的產物，極大地減少所期望產物的得量。有實驗表明，3′末端雙鏈的ΔG是0～－2 kcal/mol時，PCR產量幾乎
怎樣設計引物
一般是通過設計軟件，例如oligo6，primer5等，你可以在網上搜一下引物設計軟件下載和使用說明，是比較容易的。至于設計引物的一般原則如下：* 序列選取應在基因的保守區段* 避免引物自身或與引物之間形成4個或4個以上連續配對，避免引物自身形成環狀發卡結構* 典型的引物18到24個核苷長。引物需要
PCR的引物
特異性的引物決定了所擴增的DNA片段，引物（primer）本質上是人工合成的小片段寡聚核苷酸片段，一般不超過50個堿基（通常18－25個），它們與所要擴增的DNA片段的正鏈與負鏈的末端完全互補。在“退火”時引物結合于DNA模板的起始和終止點，DNA聚合酶結合到這兩個位置，開始合成新的DNA鏈。
怎樣溶解引物？
生工的合成報告單給出了每OD引物稀釋為100 μmoL/L（即100 pmol/ul）濃度的加水量，您可以根椐您的實驗需要加入適量的無核酸酶的雙蒸水（PH>6.0）或TE緩沖液（PH7.5~8.0），開啟瓶蓋溶解之前最好在3000~4000轉/分鐘的轉速下離心1分鐘，防止開蓋時引物散失。
如何溶解引物？
干燥后的引物質地非常疏松，開蓋前最好離心一下，或管垂直向上在桌面上敲敲，將引物粉末收集到管底。根據計算出的體積加入去離子無菌水或10mM Tris pH7.5緩沖液，室溫放置幾分鐘，振蕩助溶，離心將溶液收集到管底。溶解引物用的水一般不要用蒸餾水，因為有些蒸餾水的pH值比較低（pH4-5）,引物在這種
如何保存引物？
引物合成后，經過一系列處理和純化步驟，旋轉干燥而成無色或白色絮狀干粉。干 粉：運輸時常溫運輸，-20℃可以保存一年。儲存液：配好后分裝成幾管，避免反復凍融，-20℃可以保存半年。工作液：常規使用，4℃保存，也可-20℃保存，但應避免反復凍融。修飾熒光引物：需要避光保存，盡快使用為宜。
引物合成詳解
1. 引物是如何合成的？ 目前引物合成基本采用固相亞磷酰胺三酯法。DNA合成儀有很多種, 主要都是由ABI/PE 公司生產，而Bioneer自行研制的ZL384并行高通量DNA合成儀，可實現99%的高合成率。無論采用什么機器合成，合成的原理都相同，主要差別在于合成產率的高低，試劑消耗量的不
引物合成詳解
1. 引物是如何合成的？ 目前引物合成基本采用固相亞磷酰胺三酯法。DNA合成儀有很多種, 主要都是由ABI/PE 公司生產，而Bioneer自行研制的ZL384并行高通量DNA合成儀，可實現99%的高合成率。無論采用什么機器合成，合成的原理都相同，主要差別在于合成產率的高低，試劑消耗量的不
引物如何保存？
拿到手的引物一般已分裝為兩管。我們建議先溶解其中一管用于實驗，另一管干粉保存備用，以備不時之需。干粉狀態的引物非常穩定。-20℃可保存2年以上。常見的做法是將引物溶解至10倍的存儲度，-20℃長期保存。使用時取出稀釋至1倍的工作液。工作液保存于4℃即可。在4℃下引物溶液是比較穩定的，保存一周以上仍可
RNA提取與RTPCR(3)
2.3 RT-PCR的引物設計 RT-PCR引物設計和一般PCR引物設計可以遵循同樣的原則。細心地進行引物設計是PCR中最重要的一步。理想的引物對只同目的序列兩側的單一序列而非其他序列退火。設計糟糕的引物可能會同擴增其他的非目的序列。設計理想的引物都有以下共同的特點，而設計失敗的引物則各有各的缺
microRNA檢測的引物設計中頸環法同polyA加尾法有何區別？
行使功能的microRNA成熟形式一般僅18——25nt，因此在逆轉錄環節通過特定引物增加其長度，以便于qPCR過程正常進行。頸環法中的逆轉錄引物由自身可形成頸環結構的通用序列加上目的microRNA 3’端堿基的反向互補序列；polyA加尾法即在逆轉錄前先加polyA尾，然后通過oligo(dT)
PCR疑難問題粉碎機：逆轉錄PCR的操作要點與方法
? ? ? ?逆轉錄 PCR（Reverse TranscriptionPCR, RT-PCR）是一種以 RNA 為樣本，RNA鏈被逆轉錄成為互補 DNA（cDNA），再以此為模板通過 PCR 進行 DNA 擴增。在實際應用中，RT-PCR 分為一步法 RT-PCR 和兩步法 RT-PCR。
做miRNA的PCR的方法介紹
加尾法和莖環法加尾法，是指把miRNA再人工加一個polyA的尾巴，這樣它的結構就變長，有點象是典型的mRNA結構。很多公司提供有現成的miRNA加尾法逆轉錄試劑盒。按常規方法提取總RNA，用于逆轉錄。做完逆轉錄后，可參考的方法去做PCR。注意，這時的PCR需要的上下游引物，一般是上游引物就直接用m
RNA提取與RTPCR(4)
2.8 小量RNA檢測方法的提高 當僅有小量RNA時，RT-PCR尤其具有挑戰性。在RNA分離過程中加入的作為載體的糖元有助于增加小量樣品的產量。可以在加入Trizol的同時加入無RNase的糖元。糖元是水溶性的，可以同RNA保持在水相中以輔助隨后的沉淀。對于小于50mg的組織或106個培養細胞
逆轉錄－PCR的定義和主要影響因素介紹
逆轉錄 PCR（Reverse TranscriptionPCR, RT-PCR）是一種以 RNA 為樣本，RNA鏈被逆轉錄成為互補 DNA（cDNA），再以此為模板通過 PCR 進行 DNA 擴增。在實際應用中，RT-PCR 分為一步法 RT-PCR 和兩步法 RT-PCR。整個反轉錄實驗過程有三
如何利用LAMP引物設計平臺設計IMSA引物？2
6. 更改ParameterCondition中默認的Normal至AT rich。默認顯示Normal說明我們所上傳VP1 gene的序列中GC含量位于40%-65%的正常范圍內。高于65%屬于GC rich；低于40%屬于AT rich。7. 再次點擊Generate時平臺顯示有1000或高于1
如何利用LAMP引物設計平臺設計IMSA引物？1
IMSA，全稱為isothermal multiple-self-matching-initiated amplification，中文名為等溫多自配引發擴增。該技術的詳細介紹可見本公眾號歷史文章：“分子診斷萬花筒” 開篇——等溫多自配引發擴增技術簡介。在這里隆地熊為大家介紹一種如何利用LAMP引物