新進展！構建新型雙堿基編輯器
堿基編輯器是基于CRISPR/Cas9發展的新一代基因組編輯技術，可誘導單個堿基的突變，而鮮有關于特異性介導A-to-G和C-to-G雙突變的堿基編輯工具的研究。此外，關于堿基編輯系統與染色質環境之間的聯系也少見報道。 近日，中國科學院天津工業生物技術研究所研究員畢昌昊帶領的合成生物學技術研究團隊，聯合研究員張學禮帶領的微生物代謝工程研究團隊，在構建新型雙堿基編輯器方面取得新進展。 為了探索染色質環境對堿基編輯效率的影響，科研人員系統性篩選了多個類型的染色質調控因子。該研究發現了新型的染色質相關蛋白-HMGN1可進一步提升堿基編輯工具GBE及ABE的編輯效率，在此基礎上，構建了多個高效的新型堿基編輯器HMGN1-miniCGBE、HMGN1-GBE-Udgx、HMGN1-A8e-M。為進一步擴充堿基編輯器的工具庫，研究將HMGN1、GBE、ABE進行融合，構建了新型的雙堿基編輯工具-GGBE，可特異性誘導C-to-G及A......閱讀全文
天津工生所在構建新型雙堿基編輯器方面取得進展
堿基編輯器是基于CRISPR/Cas9發展的新一代基因組編輯技術，可誘導單個堿基的突變，而鮮有關于特異性介導A-to-G和C-to-G雙突變的堿基編輯工具的研究。此外，關于堿基編輯系統與染色質環境之間的聯系也少見報道。 近日，中國科學院天津工業生物技術研究所研究員畢昌昊帶領的合成生物學技術研究
新進展！構建新型雙堿基編輯器
堿基編輯器是基于CRISPR/Cas9發展的新一代基因組編輯技術，可誘導單個堿基的突變，而鮮有關于特異性介導A-to-G和C-to-G雙突變的堿基編輯工具的研究。此外，關于堿基編輯系統與染色質環境之間的聯系也少見報道。 近日，中國科學院天津工業生物技術研究所研究員畢昌昊帶領的合成生物學技術研究
新型“堿基編輯器”有助治療遺傳疾病
一個美國團隊２５日在英國《自然》雜志發表報告說，它在基因編輯技術方面取得新進展，可通過一種新型“堿基編輯器”在基因中替換堿基，有助科學家增強對遺傳疾病的理解和開發新療法。 基因是脫氧核糖核酸（ＤＮＡ）上的片段，而ＤＮＡ雙鏈螺旋結構由４種化學堿基組成，即腺嘌呤（Ａ）、鳥嘌呤（Ｇ）、胞嘧啶（Ｃ）和
DNA堿基中產生靶向變化的堿基編輯器－誘導廣泛的脫靶
在一項新的研究中，來自美國麻省總醫院、哈佛醫學院和哈佛大學陳曾熙公共衛生學院的研究人員報道近期開發的幾種在單個DNA堿基中產生靶向變化的堿基編輯器能夠在RNA中誘導廣泛的脫靶效應。他們還描述了對堿基編輯器變體進行基因改造可顯著降低RNA編輯的發生率，這同時也會增加在靶DNA編輯的精確度。相關研究
DNA堿基編輯器或能誘導大量脫靶RNA突變！
DNA堿基編輯方法能夠直接在基因組DNA中進行點突變的校正，同時并不會產生任何雙鏈的斷裂（DSBs，double-strand breaks），但潛在的脫靶效應常常限制了這些方法的應用，腺相關病毒（AAV）是DNA編輯基因療法中最常用的傳遞系統，由于這些病毒能夠在體內持續維持基因表達的功能，因此
利用單堿基編輯器實現多位點單堿基編輯DMD及HGPS豬模型
6月28日，中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院賴良學課題組在國際學術期刊Nature Communications(《自然-通訊》)發表了題為Efficient base editing for multiple genes and loci in pigs using base editors
廣州生物院開發出新型雙堿基編輯器
近日，中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院賴良學課題組在新型堿基編輯器開發方面取得重要進展，獲得了可同時兼具當前多種單堿基編輯器及CRISPR/Cas9基因編輯功能的多功能堿基編輯器，可廣泛地誘導產生多種模式的突變，對于飽和突變文庫構建、基因突變功能研究等方面具有促進作用。相關研究成果以AGBE: a
新型雙堿基編輯器助力基因飽和突變文庫構建
近日，中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員賴良學課題組在新型堿基編輯器開發方面取得重要進展，獲得了可同時兼具當前多種單堿基編輯器及CRISPR/Cas9基因編輯功能的多功能堿基編輯器，可廣泛地誘導產生多種模式的突變，對于飽和突變文庫構建、基因突變功能研究等方面具有重要促進作用。相關研究在線發表于
Nature－Biotechnology：新研究拓寬堿基編輯器的靶向范圍
基因組編輯技術CRISPR/Cas9被《科學》雜志列為2013年年度十大科技進展之一，受到人們的高度重視。CRISPR是規律間隔性成簇短回文重復序列的簡稱，Cas是CRISPR相關蛋白的簡稱。CRISPR/Cas9是由一種原始的細菌免疫系統改編而成的，它的作用方式是首先在基因組的一個靶位點上切割
多樣化C－to－T植物堿基編輯器被開發
近日，電子科技大學張勇教授、馬里蘭大學YiPing Qi博士、揚州大學張韜教授課題組合作于《Plant Biotechnology Journal》發表了題名《Improved plant cytosine base editors with high editing activity, pur
全新「堿基編輯器」：不用「切割」也能精準編輯基因
原標題:不用「切割」也能精準編輯基因了，華人學者開發全新「堿基編輯器」摘要：CRISPR 基因編輯技術之外的新工具。基因編輯技術有了重大進展。Broad 研究所的華人學者 David Liu 教授的團隊開發出了一種「堿基編輯器」，可以讓細胞內 DNA 的一種堿基通過簡單的化學反應，變成另一種
從同源重組到堿基編輯器－看基因編輯72變
基因編輯尤其是“基因魔剪”CRISPR的新聞報道幾乎每天都能見到。僅在3月份，就有兩篇引起廣泛關注的重磅成果，其一，曾與張峰合作開創“基因魔剪”CRISPR的科技大牛劉如謙（David Liu），利用基因編輯技術研發出給細胞活動拍照的“細胞記錄儀”（CAMERA）。正如黑匣子能記錄事故發生時的
新型腺嘌呤堿基編輯器可讓細胞RNA編輯最小化
在一項新的研究中，來自美國布羅德研究所和哈佛大學的研究人員發現有證據表明使用堿基編輯器會導致細胞中出現意想不到的RNA編輯。相關研究結果發表在2019年5月8日的Science Advances期刊上，論文標題為“Analysis and minimization of cellular RNA
我國科研人員開發新型普適高效的堿基編輯器
?? 在國家自然科學基金項目（項目編號：31730111、91540115、31600654 、31600619、31471241）等資助下，中國科學院上海生命科學研究院楊力研究組與上海科技大學生命學院陳佳研究組和黃行許研究組合作，成功開發出可高效介導甲基化胞嘧啶mC到胸腺嘧啶T的編輯堿基編
糖基化酶堿基編輯器的機器學習研究進展
堿基編輯技術可實現精確的堿基轉換，當前，有三類堿基編輯器被廣泛應用，包括胞嘧啶堿基編輯器（cytosine base editor，CBE）、腺嘌呤堿基編輯器（adenine base editor，ABE）、糖基化酶堿基編輯器（glycosylase base editor，GBE）。 20
科學家首次證實線粒體堿基編輯器的脫靶效應
?脫靶檢測技術工作流程。中國農科院供圖? ? 日前，中國農業科學院深圳農業基因組研究所左二偉團隊與國內其他科研單位合作，首次證實線粒體堿基編輯器（DdCBE）會導致核基因組嚴重的脫靶效應，因而醫學應用存在嚴重的安全風險。該研究對研發高效安全的線粒體堿基編輯器具有指導意義。相關研究成果在線發表在《
不依賴脫氨酶的堿基編輯器開發成功
記者1月14日從中國科學院天津工業生物技術研究所獲悉，該所研究員畢昌昊團隊和研究員張學禮團隊合作開發了不依賴脫氨酶（DAF）的新型堿基編輯器。該成果擴展了堿基編輯器的類型，為工業菌株改造和生物醫藥等領域研究提供了新的技術工具。相關研究成果近日發表于國際期刊《自然-生物技術》。 堿基對是形成DN
優化糖基化酶堿基編輯器研究取得新進展
GBE編輯器可實現堿基C-to-G的編輯，但其仍存在堿基編輯效率偏低、靶向位點范圍受限等問題，這大大限制了GBE堿基編輯器的應用。因此，亟需對現有糖基化酶堿基編輯器進行優化，開發出堿基編輯效率高、靶向位點范圍廣的GBE突變體。近日，中國科學院天津工業生物技術研究所畢昌昊研究員帶領的合成生物技術研究團
能預測堿基編輯效果的新模型開發成功
近日，中國農業科學院深圳農業基因組研究所（嶺南現代農業科學與技術廣東省實驗室深圳分中心）動物表觀基因組學創新團隊研發出一種預測堿基編輯效果的新模型，該模型大幅提升了預測堿基編輯器在基因組內源靶位點編輯效果的準確性。相關研究成果發表在《細胞發現》（Cell Discovery）上。堿基編輯技術是一
上海科技大學等研制出“超級細菌”堿基編輯器
上海科技大學物質學院教授季泉江課題組與中科院北京基因組所研究員韓大力課題組合作，首次在金黃色葡萄球菌中建立單堿基編輯技術。相關研究成果近日在線發表于英國皇家化學會旗艦期刊《化學科學》。 圖片來源于網絡 季泉江課題組此前已成功開發出金黃色葡萄球菌中基于CRISPR/Cas9的基因組
糖基化酶堿基編輯器的機器學習研究中獲進展
堿基編輯技術可實現精確的堿基轉換，當前，有三類堿基編輯器被廣泛應用，包括胞嘧啶堿基編輯器（cytosine base editor，CBE）、腺嘌呤堿基編輯器（adenine base editor，ABE）、糖基化酶堿基編輯器（glycosylase base editor，GBE）。 20
Nat－Med：在體內利用新型堿基編輯器有望治療遺傳疾病
2018年10月9日/生物谷BIOON/---新生兒的父母可能都了解一種稱為苯丙酮尿癥（phenylketonuria）的代謝障礙。在瑞士，所有新生兒都會接受這種遺傳疾病的篩查。經發現患有苯丙酮尿癥的兒童需要吃特殊飲食，這樣苯丙氨酸就不會在體內堆積。過量的苯丙氨酸會遲滯精神和運動發育。如果這種遺
上海科技大學等研制出“超級細菌”堿基編輯器
本報訊 上海科技大學物質學院教授季泉江課題組與中科院北京基因組所研究員韓大力課題組合作，首次在金黃色葡萄球菌中建立單堿基編輯技術。相關研究成果近日在線發表于英國皇家化學會旗艦期刊《化學科學》。 季泉江課題組此前已成功開發出金黃色葡萄球菌中基于CRISPR/Cas9的基因組編輯技術，簡化了該細菌
人工智能的蛋白結構聚類分析，發現新的堿基編輯器
在一項新的研究中，中國科學院遺傳與發育生物學研究所的高彩霞（Gao Caixia）課題組率先使用人工智能（AI）輔助的方法，通過結構預測和分類發現具有獨特功能的新型脫氨酶蛋白。這種方法為發現和構建理想的植物遺傳性狀開辟了一系列的應用。相關研究結果于2023年6月27日在線發表在Cell期刊上，論
科學家提出基因編輯領域發展新方向
4月18日，中國科學院上海營養與健康研究所研究員楊力與上海科技大學生命技術學院教授陳佳、上海科技大學免疫化學研究所副研究員楊貝，應邀在國際學術期刊《自然-生物技術》（Nat Biotechnol）上發表題為To BE or not to BE, that is the question 的新聞與
David－Liu首次通過AAV病毒載體在動物體內進行堿基編輯作用
堿基編輯器用于研究和治療遺傳性疾病的成功取決于將其體內傳遞給相關細胞類型的能力。通過腺相關病毒（AAV）的傳送受AAV打包能力的限制（AAV的基因組包裝大小限制為≤5kb），因此無法使用全長堿基編輯器。 2020年1月14日，博德研究所David Liu團隊在Nature Biomedical
在糖基化酶堿基編輯器的機器學習研究中獲進展
堿基編輯技術可實現精確的堿基轉換，當前，有三類堿基編輯器被廣泛應用，包括胞嘧啶堿基編輯器（cytosine base editor，CBE）、腺嘌呤堿基編輯器（adenine base editor，ABE）、糖基化酶堿基編輯器（glycosylase base editor，GBE）。 2020
新研究開發出靶向能力和編輯效率得到改善的堿基編輯器
在一項新的研究中，來自美國布羅德研究所、哈佛大學和波士頓兒童醫院的研究人員利用一種稱為“噬菌體輔助的堿基編輯器連續進化（phage assisted continuous evolution of base editors, BE-PACE）”的系統開發出一種改進堿基編輯器的編輯效率的新方法。相
我國學者成功開發基于脫氨酶APOBEC的新型普適堿基編輯器
中國科學院上海生命科學研究院（營養與健康院）中國科學院－馬普計算生物學研究所楊力研究組與上海科技大學生命學院陳佳研究組和黃行許研究組合作，成功開發出一系列基于人胞嘧啶脫氨酶APOBEC的新型普適堿基編輯器，其中基于人APOBEC3A（hA3A）的堿基編輯器可高效介導甲基化胞嘧啶mC到胸腺嘧啶T的
新一代堿基編輯技術開發方面取得重大突破
堿基編輯（BE）作為一種前沿的基因組編輯技術，能夠在基因組水平上實現精確、高效的單堿基編輯。常用的DNA堿基編輯器主要是通過將可編程的DNA結合蛋白（如Cas9）與堿基脫氨酶融合實現的。然而，這些堿基編輯器主要針對C和A堿基的直接編輯，并且它們所包含的脫氨酶可能導致非Cas9依賴的DNA或RNA