加拿大建成首個人類小分子代謝物數據庫
加拿大阿爾伯塔大學的研究小組日前宣布，他們建成了世界上首個人類小分子代謝物組數據庫。專家認為，這將對許多傳染病、遺傳病或環境引發的疾病的診斷、預防和監測產生重大影響。 人類小分子代謝物組是所有人體內產生的小分子代謝物的總稱，是化學意義上的“人類基因組”。科學家認為，如果說人類基因組描繪了生命的藍圖，那么就可以講小分子代謝物組展示的是生命的成分。由于小分子代謝物對人體健康和生理的影響更為直接，研究小組認為該項目將比人類基因組計劃帶來更加直接的醫療影響。 小組發表在最新一期《核酸研究》雜志上的報告稱，目前，科學家已經在人體中分析識別出了2500多種小分子代謝物、1200種藥物分子和3500種食物成分。加拿大人類小分子代謝物組計劃起步于2004年。參與該計劃的50位科學家分別來自阿爾伯塔大學和卡爾加利大學。他們在2年半的時間里研究并收集了所有已知的人類代謝物及其與化學、生物和疾病有關的數據，將其編入了人類小分子代謝物組......閱讀全文
代謝組學常使用的數據庫
代謝組主要是對小分子代謝物（一般50-1500 Da）進行高通量定性和定量分析，代謝組分析產生了大量的生物信息數據。代謝組數據庫的開發對于歸納總結這些大數據，方便后續的代謝組學數據分析，揭示隱藏在大數據背后的生物學機理具有十分重要的作用。 目前常用的代謝組學數據庫有HMDB、NIST、LMSD
GCMS－HRAM－代謝組學數據庫－探索代謝組學的奧秘
鹽城4公分厚外墻巖棉板報價 巖棉制品是以精選的優質玄武巖為主要原料、經沖天爐熔化后，采用的四輥離心制棉工序，將玄武巖高溫熔體甩扭成4-7μm的非連續性纖維，再在巖棉纖維中加入一定量的粘結劑、防塵油、憎水劑，經過沉降、固化、切割等工藝，根據不同用途制成棉氈、半硬板、保溫帶、管殼等系列產品。
非靶向代謝組學更適宜選用哪些代謝組學通路數據庫？
據相關介紹表明非靶向代謝組學的研究成果為眾多的藥物靶學、疾病機理研究以及疾病診斷提供有力依據。它還推動了免疫組化以及免疫熒光等技術的發展，事實上長期供應非靶向代謝組學更是由此迅速推進了研究步伐，現在就非靶向代謝組學更適宜選用哪些代謝組學通路數據庫作簡要闡述：1.HMDB非靶向代謝組學的代謝通路必須借
Bruker在ASMS－2016上推出最新代謝組學數據庫
新型MetaboBASE Personal Library提高分析人員深入進行代謝物鑒定的信心 分析測試百科網訊 2016年6月6日—在ASMS 2016會議上，Bruker推出最新質譜數據庫，被稱為Bruker MetaboBASE Personal Library?，該數
脂肪代謝基因通路介紹
(Mouse)脂類主要包括脂肪、磷脂、鞘脂和膽固醇脂，其吸收代謝有兩種情況： 中鏈、短鏈脂肪酸構成的甘油三酯乳化后即可吸收——>腸粘膜細胞內水解為脂肪酸及甘油——>門靜脈入血。長鏈脂肪酸構成的甘油三酯在腸道分解為長鏈脂肪酸和甘油一酯，再吸收——>腸粘膜細胞內再合成甘油三酯，與載脂蛋白、膽固醇
基因組所完成開發RiceWiki數據庫
近日，中國科學院北京基因組研究所章張研究員課題組與北京理工大學、中國林業科學研究院及華中農業大學合作開發完成RiceWiki數據庫。該數據庫是基于維基百科的水稻基因信息平臺，是可編輯且內容公開的公眾注釋系統。研究成果在Nucleic Acids Research雜志發表。 水稻是人類重
全球最大癌癥基因數據庫發布
美國國家癌癥研究所(NCI)科學家發布了有史以來規模最大的癌癥相關基因變異數據庫，為研究者們提供了迄今為止最全面的方式，搞清楚如何將治療藥物靶向疾病。 周一NCI在一份聲明中稱，基于基因組學研究的新數據庫，將對全球開放獲取，預計將有助于研究人員加快新藥的開發，同時能夠更
各種模式生物必需基因在線數據庫
Essential Genes are the genes that are indispensable to sustain cellular life. The functions encoded by essential genes are considered as a foundation
眾包個體基因數據庫緩慢發展
Yaniv Erlich 計算遺傳學家Yaniv Erlich因其建立了世界最大“家譜”而引人注目。而目前，他的DNA.land又引發新一輪個體基因數據庫“眾包熱潮”。 早在2013 年，Erlich 團隊就發表了一篇論文，介紹了如何利用公共資源，通過交叉比對的方法確定遺傳學研究參與者的個人身
科學家搭建草莓基因組數據庫
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454861.shtm 草莓為薔薇科草莓屬，因芳香多汁、營養豐富受到喜愛，在全國各地均可種植。栽培草莓為異源多倍體，基因組復雜，雜合度高。 2019年，《自然—遺傳學》發表了利用三代測序數據組裝的高
科學家構建首個油菜基因轉錄數據庫
近日，中國農業科學院油料作物研究所油料作物基因組學與抗病性改良創新團隊破譯了油菜基因組的全轉錄信息密碼，構建了油菜十萬余個基因的轉錄全景圖，使得油菜基因功能研究第一次有了標準的可參考的基因轉錄數據庫，將有力支撐油菜功能基因的相關研究。該項研究成果在線發表在《植物學報（The Plant Jour
基因序列排序與整理、數據庫比對與意義
由于定序系統的定序方法都是將體細胞內的基因序列打斷成很多段落后，再利用DNA擴增的方式原理，在擴增的同時借由偵測螢光的方式（將不同堿基原料接上螢光訊號，只要這有接訊號的堿基被合成了，即會發出不同強度的螢光訊號）即能得到大量的片段式基因序列。經數字化后的基因序列需經整理將每段落的頭尾相接成一個完整的基
大型衰老相關基因表達譜數據庫建成
英國《自然·通訊》雜志30日發表的一項研究稱，包括人類在內的4個物種的大型衰老相關基因表達譜數據庫建成。德國科學家團隊分析數據后發現，衰老相關基因的表達變化與退行性慢性病相關基因的表達變化軌跡一致，但與癌癥的相反。 對衰老及衰老相關疾病的研究，一直是人類醫學的難題。但隨著“衰老基因”的確定，衰
全球藥典草藥基因組數據庫已上線
近期，中國中醫科學院中藥研究所團隊建立了全球藥典基因組數據庫(GPGD)。該數據庫是全球首個針對藥典收載草藥物種的大型基因組學數據庫。相關研究成果發表在《Science China-Life Sciences》雜志，標題為“Global Pharmacopoeia Genome Database
加拿大建成首個人類小分子代謝物數據庫
加拿大阿爾伯塔大學的研究小組日前宣布，他們建成了世界上首個人類小分子代謝物組數據庫。專家認為，這將對許多傳染病、遺傳病或環境引發的疾病的診斷、預防和監測產生重大影響。 人類小分子代謝物組是所有人體內產生的小分子代謝物的總稱，是化學意義上的“人類基因組”。科學家認為，如果說人類基因組描繪了生
北京基因組所發布表觀基因組數據庫MethBank－3.0
中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心發布表觀基因組數據庫MethBank 3.0，并將其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species為題，在線發表在Nucleic Acids Rese
解碼“基因寶藏”：最全海洋微生物基因數據庫出爐
9月4日晚，華大生命科學研究院（簡稱“華大”）聯合山東大學、英國東安格利亞大學、中國海洋大學、廈門大學、丹麥哥本哈根大學等機構，在《自然》上發表研究成果。他們通過對目前已公開的海洋微生物宏基因組數據進行分析和深度挖掘，構建了迄今為止最完整的海洋微生物基因數據庫，并從中發現了大量具有應用潛力的基因資源
基因檢測解碼“生命說明書”－全球競跑基因數據庫
隨著華大基因上市臨近，基因檢測概念再度被關注。 華大基因CEO尹燁曾在公開場合介紹，給基因學家一滴血，能查到生育、腫瘤、感染，從三檢合一到N檢合一，液體活檢可以做更多的事情。 相比于傳統的影像學檢測手段只能檢測出已經發生且長成一定大小的異物，基因檢測技術的優勢在于，在更早的發病初始期，從分子
北京基因組所發布表觀基因組數據庫MethBank－3.0
中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心發布表觀基因組數據庫MethBank 3.0，并將其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species為題，在線發表在Nucleic Acids Rese
細胞代謝信號通路相關的基因介紹CEBPA基因
這個無內含子基因編碼一個轉錄因子，該轉錄因子包含一個堿性亮氨酸拉鏈（bzip）結構域，并識別目標基因啟動子中的ccaat基序。編碼蛋白在具有CCAAT/增強子結合蛋白β和γ的同二聚體和異二聚體中起作用。這種蛋白的活性可以調節參與細胞周期調節和體重平衡的基因表達。該基因突變與急性髓系白血病有關。在非a
細胞代謝信號通路相關的基因介紹POLE基因
該基因編碼DNA聚合酶epsilon的催化亞單位。這種酶參與DNA修復和染色體DNA復制。該基因突變與結直腸癌12和面部畸形、免疫缺陷、利維多和身材矮小有關。This gene encodes the catalytic subunit of DNA polymerase epsilon. The
細胞代謝信號通路相關的基因介紹MYC基因
該基因編碼的蛋白質是一種多功能的核磷蛋白，在細胞周期進展、凋亡和細胞轉化中起到作用。作為調節特定靶基因轉錄的轉錄因子發揮作用。這種基因的突變、過度表達、重排和易位與多種造血腫瘤、白血病和淋巴瘤，包括伯基特淋巴瘤有關。有證據表明，來自上游、非aug（cug）幀和下游aug起始位點的選擇性翻譯起始導致兩
細胞代謝信號通路相關的基因介紹DPYD基因
該基因編碼的蛋白是嘧啶分解代謝酶，是尿嘧啶和胸腺嘧啶分解代謝途徑的起始和限速因子。該基因突變導致二氫嘧啶脫氫酶缺乏，嘧啶代謝錯誤與胸腺嘧啶尿嘧啶尿有關，癌癥患者接受5-氟尿嘧啶化療后毒性增加。兩個編碼不同亞型的轉錄變體已經被發現。The protein encoded by this gene is
細胞代謝信號通路相關的基因介紹SDHB基因
呼吸鏈的復合物II，特別參與琥珀酸的氧化，攜帶電子從FADH到COQ。復合物由四個核編碼亞單位組成，并定位于線粒體內膜。鐵硫亞單位高度保守，包含三個富含半胱氨酸的簇，這些簇可能包含酶的鐵硫中心。該基因的零星和家族性突變導致副神經節瘤和嗜鉻細胞瘤，并支持線粒體功能障礙和腫瘤發生之間的聯系。Comple
細胞代謝信號通路相關的基因介紹RPTOR基因
該基因編碼一個信號通路的組成部分，該信號通路調節細胞生長以響應營養素和胰島素水平。編碼蛋白與mtor激酶形成化學計量復合物，并與真核起始因子4e結合蛋白-1和核糖體蛋白s6激酶相關。該蛋白正調控下游效應核糖體蛋白s6激酶，負調控mtor激酶。已發現該基因編碼不同亞型的多個轉錄變體。[由RefSeq提
細胞代謝信號通路相關的基因介紹DHFR基因
二氫葉酸還原酶將二氫葉酸轉化為四氫葉酸，這是嘌呤、胸苷酸和某些氨基酸從頭合成所需的甲基穿梭劑。功能性二氫葉酸還原酶基因已被定位到5號染色體上，多個無內含子處理的假基因或類似二氫葉酸還原酶的基因已被鑒定在不同的染色體上。二氫葉酸還原酶缺乏與巨幼細胞性貧血有關。已經發現了一些編碼不同亞型的轉錄變體。[由
細胞代謝信號通路相關的基因介紹FH基因
該基因編碼的蛋白質是三羧酸循環（tca）或krebs循環的酶組分，催化富馬酸鹽生成L-蘋果酸。它以胞質形式和n-末端延伸形式存在，僅在所使用的翻譯起始位點不同。n-末端延伸形式的靶向是線粒體，在線粒體中，延伸的移除產生與細胞質中相同的形式。它類似于一些耐高溫的Ⅱ類延胡索酸酶，具有四聚體的功能。該基因
細胞代謝信號通路相關的基因介紹TPMT基因
該基因編碼通過S-腺苷-L-蛋氨酸作為S-甲基供體和S-腺苷-L-同型半胱氨酸作為副產物代謝硫嘌呤藥物的酶。硫嘌呤類藥物如6-巰基嘌呤被用作化療藥物。影響這種酶活性的遺傳多態性與個體內對此類藥物的敏感性和毒性的變化相關，從而導致硫嘌呤s-甲基轉移酶缺乏。相關假基因已在第3、18和X染色體上鑒定。[由
細胞代謝信號通路相關的基因介紹UMPS基因
這個基因編碼尿苷5'-單磷酸合酶。編碼的蛋白質是一種雙功能酶，對從頭嘧啶生物合成途徑的最后兩個步驟進行催化。第一個反應是由N-末端的酶-磷酸核糖基轉移酶進行的，該酶將乳清酸轉化為5'-單磷酸鹽。末端反應是由C末端酶OMP脫羧酶進行的，該酶能將5'-單磷酸列替丁轉化為單磷酸尿苷
細胞代謝信號通路相關的基因介紹GNAQ基因
GNAQ基因所編碼的蛋白屬于鳥嘌呤核苷酸結合蛋白（G蛋白）的家族，GNAQ與GNA11形成的復合物為G蛋白α亞基，這兩個基因調控細胞分裂，增強MEK（有絲分裂原活化蛋白激酶的激酶）蛋白活性，在80%的葡萄膜黑色素瘤病人中發現GNA11和GNAQ基因的突變，其機制為基因突變導致MEK的異常激活，目前正