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    華大基因同期Nature,Science解析關鍵基因事件

    一般認為基因組熱點在不同物種之間差別很大,但是最新一期(11月19日)Science雜志公布的兩項研究成果表明,至少在鳥類和酵母中,一些基因組熱點區域在很大程度上是重合的,而且即使在幾代之后,這種一致性也沒有變。這項研究同時也公布了一種分析基因組熱點產生的新技術。 隨著DNA信息一代傳給下一代,個體細胞經歷了分裂和復制,DNA也會發生雙鏈斷裂DSBs,這些過程都導致了遺傳序列的混合,也就是重組。在基因組中重組頻率發生的相對來說高的位點就被稱為熱點hotspots。理論上,熱點在不同物種中跨度很大,比如小鼠和猿類,DNA結合蛋白 PRDM9在啟動DSBs事件中扮演了重要的角色,因此被作為熱點。 為了更好的了解更多物種中的基因關鍵事件,來自哥倫比亞大學,深圳華大基因等處的研究人員分析了澳大利亞兩種缺少PRDM9蛋白的物種。 通過繪制遺傳圖譜,比對基因組序列,研究人員發現這兩個物種具有高達70%以上的相同基因組熱點,但這兩個......閱讀全文

    用化學常識解釋轉基因

      河南日報退休高級編輯,大河健康報退休總編,河南農大兼職教授,中國新聞獎獲得者。  各位女士、各位先生:  大家好。大家都是經常來圖書館借書、看書的讀者,如今喜歡看書的人真是難能可貴。看年齡,大家多數是60后、50后,少數是70后、40后。大家可能都不是生物專業的大學生,但是大家在中學階段都學過化

    Cell Res重點論文:單細胞表觀多組學測序技術最新突破

      2017年6月16日,北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬課題組在《Cell Research》雜志在線發表了題為“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研

    Cell Res重點論文:單細胞表觀多組學測序技術最新突破

      2017年6月16日,北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬課題組在《Cell Research》雜志在線發表了題為“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研

    外源基因在真核細胞中的表達系統

    1. 真核生物表達的優越性和必要性① 真核生物具有轉錄后加工系統,可識別并刪除基因中的內含子,剪切加工為成熟mRNA.②具備完善的翻譯后加工系統,可進行糖基化、乙酰化等修飾,使蛋白形成正確的天然構型,因而真核生物表達系統產生的蛋白更接近天然狀態,有利于其功能、生物活性的研究。③某些真核細胞可將基因表

    桿狀病毒-昆蟲細胞表達系統

    實驗步驟 一、桿狀病毒表達載體 最簡單的經典桿狀病毒表達載體是一個重組的桿狀病毒,其基因組含有一段外源核酸序列,通常為編碼目標蛋白質的dDNA,在多角體蛋白啟動子控制下進行轉錄。這個嵌合的基因由多角體蛋白啟動子和外源蛋白編碼序列組成

    基因代謝速度決定哺乳動物進化

    通常認為人類和黑猩猩之間僅有1%~2%的基因差異,但事實上,區分人類和黑猩猩的基因比科學家預料的要多。一項新的研究表明,把人類和近親——黑猩猩區分開的是人類獲得新基因、拋棄舊基因的速率。   人類比黑猩猩和其他哺乳動物基因代謝速度快。(圖片提供:《科學》雜志網站)  人

    人類基因組的軍備競賽 不斷自我進化

      北京時間9月30日消息,科學日報報道,近日美國加州大學圣克魯斯分校的科學家們進行的最新發現表明,靈長類動物的基因組內競爭元素的進化軍備競賽驅動了復雜調控網絡的進化,這一網絡協調了人類內每個細胞的基因活動。  人類基因組的軍備競賽  這場軍備競賽是在名為逆轉錄轉座子(retrotransposon

    克隆基因的表達(expression of cloned gene)-3

    (3)原核生物的基因組基本上是單倍體,而真核基因組是二倍體。(4)如前所述,細菌多數基因按功能相關成串排列,組成操縱元的基因表達調控的單元,共同開啟或關閉,轉錄出多順反子(polycistron)的mRNA;真核生物則是一個結構基因轉錄生成一條mRNA,即mRNA是單順反子(monocistron)

    哺乳動物細胞中進行RNA干擾:設計,實驗和分析siRNA效應

     轉錄后基因沉默,也稱為RNA干擾,是指雙鏈RNA分子阻斷或者降低同源基因的表達的現象。這種現象可能是作為一種抑制病毒感染和轉座子跳躍的細胞防御機制(Ketting et. al., 1999; Tabara et. al., 1999; Jensenet. al., 1999; Ratc

    研究發現夜行和穴居哺乳動物擁有更多V1R基因

      通過位于犁鼻器中的信息素一型受體,哺乳動物可以感受來自物種內其他個體所傳遞的信息,從而引起種內不同成員之間社會和性的行為。信息素一型受體是由V1R基因超家族編碼的。過去幾年中,中國科學院昆明動物研究所張亞平院士和“百人計劃”入選者施鵬研究員等研究人員通過進化基因組學的方法對該基因超

    基因編輯進展梳理 Part II 基于CRISPR-Cas9的技術應用篇(下)

      上一期為大家介紹了過去一年里CRISPR技術在動物造模及單堿基技術方面取得的重大突破。本期繼續為大家從功能基因組篩選、細胞譜系示蹤及疾病診斷方面談談CRISPR-Cas系統的技術運用。   一、大規模基因功能的篩選   盡管測序和基因組編輯技術取得了重大進展,但是解析復雜的基

    基因編輯進展梳理 Part II 基于CRISPR-Cas9的技術應用篇(下)

      上一期為大家介紹了過去一年里CRISPR技術在動物造模及單堿基技術方面取得的重大突破。本期繼續為大家從功能基因組篩選、細胞譜系示蹤及疾病診斷方面談談CRISPR-Cas系統的技術運用。   一、大規模基因功能的篩選   盡管測序和基因組編輯技術取得了重大進展,但是解析復雜的基因型-表型關系仍

    西北農大張涌團隊利用CRISPR技術培育出抵抗結核病的奶牛

      在一項新的研究中,來自中國西北農林科技大學動物醫學院的研究人員首次利用CRISPR/Cas9基因編輯技術成功地培育出具有增加抵抗牛結核病能力的奶牛。相關研究結果于2017年2月1日發表在Genome Biology期刊上,論文標題為“Single Cas9 nickase induced gen

    北京鴨基因組研究或助力抗擊“禽流感”

      2013年6月10日,由中國農業大學、深圳華大基因研究院和英國愛丁堡大學等多家單位合作完成的北京鴨基因組研究成果在《自然·遺傳學》(Nature Genetics)雜志上在線發表。這項研究鑒定了鴨子對禽流感產生免疫反應的相關遺傳基因,將有助于進一步了解鳥類的免疫機制,同時為深入解析禽流感病毒

    近期最熱門的基因組測序成果

      大千世界無奇不有,這都是進化的功勞。大航海時代,科學家們揚帆遠航去探索大自然的神奇造化。如今,科學家們正在測序技術的幫助下進一步揭示生命的奧秘。The scientist雜志對近期最熱門的一些基因組測序成果進行了盤點,華大基因參與的兩項測序研究格外引人矚目。  種屬:長頸鹿和okapi  基因組

    973首席科學家發現基因功能新起源

    來自中科院昆明動物所的研究人員發現在哺乳動物的一個重要轉錄抑制因子CDYL基因中,新外顯子反復在不同哺乳動物譜系中發生,而且這些新外顯子能給該基因帶來很大的功能改變,這說明基因中新外顯子的出現也是增加蛋白多樣性和新功能起源的一種重要方式。這一研究成果公布在國際著名遺傳學刊物《Trends in Ge

    2016熱門基因組測序,華大基因風頭勁

      大千世界無奇不有,這都是進化的功勞。大航海時代,科學家們揚帆遠航去探索大自然的神奇造化。如今,科學家們正在測序技術的幫助下進一步揭示生命的奧秘。The scientist雜志對近期最熱門的一些基因組測序成果進行了盤點,華大基因參與的兩項測序研究格外引人矚目。  種屬:大西洋鮭  基因組:2.97

    基因技術專題-1

    專題一:RNA干擾技術(RNAi)1995年,康奈爾大學的Su Guo博士用反義RNA阻斷線蟲基因表達的試驗中發現,反義和正義RNA都阻斷了基因的表達,他們對這個結果百思不得其解。直到1998年, Andrew Fire的研究證明,在正義RNA也阻斷了基因表達的試驗中,真正起作用的是雙鏈RNA。這些

    真核細胞表達系統的類型與常用真核細胞表達載體

    原核表達系統是常被用來研究基因功能的成熟系統,由于原核表達系統具有包涵體蛋白不易純化、蛋白修飾不完整等缺陷,人們也開始利用真核細胞表達系統來研究基因。自上世紀70年代基因工程 技術誕生以來,基因表達技術已滲透到生命科學研究的各個領域。并隨著人類基因組計劃實施的進行,在技術方法上得到了很大發展,時至今

    Nature文章:驚人的基因組相似性

      蝙蝠和海豚獨立地進化出各自的回聲定位系統。盡管它們的聲吶感官系統起源及機制不同,但似乎有一些相似的基因參與其中。現在發表于9月4日《自然》(Nature)雜志上的一項新研究證實蝙蝠和海豚基因組有一些相似的序列改變,表明這樣的遺傳趨同(genetic convergence)其范圍遠比原以為的

    Natureasia聚焦:CRISPR/Cas研究進展Top20

      CRISPR/Cas系統是目前發現存在于大多數細菌與所有的古菌中的一種后天免疫系統,其以消滅外來的質體或者噬菌體并在自身基因組中留下外來基因片段作為“記憶”。  CRISPR/Cas系統全名為常間回文重復序列叢集/常間回文重復序列叢集關聯蛋白系統(clustered regularly inte

    權威期刊:Y染色體基因丟失新見解

      根據國際權威期刊《Genome Biology》近期發表的一項研究表明,一些基因已從人類和其他哺乳動物的Y染色體上丟失。這項研究表明,必需的Y基因被營救并轉移到其他染色體上,該研究還確定了男性不育一個潛在的重要遺傳因素。  Y染色體要比X染色體小很多,已經失去了幾乎所有的640個基因,它曾與X染

    權威期刊:Y染色體基因丟失新見解

      根據國際權威期刊《Genome Biology》近期發表的一項研究表明,一些基因已從人類和其他哺乳動物的Y染色體上丟失。這項研究表明,必需的Y基因被營救并轉移到其他染色體上,該研究還確定了男性不育一個潛在的重要遺傳因素。  Y染色體要比X染色體小很多,已經失去了幾乎所有的640個基因,它曾與X染

    最新基因組測序成果盤點

      近來,各大雜志上陸續發表了不少重要的基因組測序成果。the scientist雜志對此進行了盤點,以饗讀者。   種屬:野鴨,綠頭鴨(Anas platyrhynchos)   基因組:約13 billion bp   鴨子是幾乎所有甲型流感病毒的天然宿主(包括H5N1)。日前,研究人員測

    系統化生物芯片技術在功能基因組研究中的應用簡介

     三、生物芯片技術研究應用點滴     人類基因組計劃推動了各種生物基因組測序工作的進展,越來越多的生物全基因組序列被測定并公布,可是這才是解讀“天書”的開始。掌握了基因組序列,卻不知道基因序列背后所隱藏的秘密——即基因組的功能,就不能真正理解“天書”更

    研究發現僅8.2%人類DNA“有用”:余為進化殘余物質

      研究人員運用計算方法,比較了從老鼠、豚鼠、兔子到狗、馬和人類的各種哺乳動物的完整DNA序列。  研究報告資深作者之一、英國牛津大學韋爾科姆基金會人類遺傳學中心的格頓·倫特博士說:“這些擁有共同祖先的物種在進化過程中,DNA出現變異,而自然選擇抵制了這些變化,以確保有用的DNA序列完好無損。”  

    人類DNA僅8.2%“有用”

      研究人員運用計算方法,比較了從老鼠、豚鼠、兔子到狗、馬和人類的各種哺乳動物的完整DNA序列。  研究報告資深作者之一、英國牛津大學韋爾科姆基金會人類遺傳學中心的格頓·倫特博士說:“這些擁有共同祖先的物種在進化過程中,DNA出現變異,而自然選擇抵制了這些變化,以確保有用的DNA

    中科院Science公布最新基因組

      繼2012年中國科學院昆明動物研究所、深圳華大基因研究院等單位合作完成了首個山羊全基因組圖譜之后,6月昆明動物研究所,華大基因等處的研究人員又公布了綿羊基因組序列,并且將這一基因組與其它哺乳動物基因組進行了比對,構建了相關的系統發育樹。這一研究成果公布在6月6日Science雜志上。  參與這項

    真核生物基因組-1

    真核生物的基因組比較龐大,并且不同生物種間差異很大,例如人的單倍體基因組由3.16×109 bp組成。在人細胞的整個基因組中實際上只有很少一部份(約占2%~3%)的DNA序列用以編碼蛋白質。 第一節 真核生物基因組特點 真核生物體細胞內的基因組分細胞核基因組與細胞質基因組,

    Nature封面:兩篇文章解讀至關重要的Y染色體

      科學家們對多種哺乳動物的Y染色體進行了比較。他們發現,Y染色體進化初期的確出現了大量的基因流失,不過在現存物種中Y染色體上的基因相當穩定。   哺乳動物的XY染色體被認為來自于同一個祖先,只是Y染色體出現了快速的基因流失。這一Y染色體退化理論得到了一些果蠅研究的支持。在本周的Nature雜志上

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