質譜技術在蛋白質組研究中的分析方法
2003年人類基因組精細圖繪制完成,是人類科學史上一個里程碑式的事件。后基因組時代的研究重點自然落在了蛋白質頭上。為啥?因為中心法則告訴我們,基因的產物——蛋白質,是生命活動的最終執行者。與基因組類比,研究生物體內全套蛋白質的科學,就是蛋白質組學。基因組計劃完成的同年,人類蛋白質組計劃啟動,令人激動的是,2014年人類蛋白質組的草圖也完成了。而蛋白質組學能夠飛速發展的最大功臣非質譜莫屬。質譜的應用范圍非常廣泛,但這里只討論蛋白質組學中的質譜。簡單地說,質譜法(mass spectrometry)就是對肽段離子的重量(質荷比,m/z)進行測量的分析方法。樣品經質譜儀(mass spectrometer)檢測得到質譜圖(mass spectrum),通過對質譜圖的分析就可以對樣品中的蛋白進行鑒定、定量。親,圖1的這種典型的蛋白質組學流程都很熟悉吧。蛋白首先都要被特異性的酶(通常為Trypsin)切割為肽段,再進行后續分析,這......閱讀全文
質譜技術在蛋白質組研究中的分析方法
2003年人類基因組精細圖繪制完成,是人類科學史上一個里程碑式的事件。后基因組時代的研究重點自然落在了蛋白質頭上。為啥?因為中心法則告訴我們,基因的產物——蛋白質,是生命活動的最終執行者。與基因組類比,研究生物體內全套蛋白質的科學,就是蛋白質組學。基因組計劃完成的同年,人類蛋白質組計劃啟動,令人激動
質譜技術在蛋白質組研究中的分析方法介紹
2003年人類基因組精細圖繪制完成,是人類科學史上一個里程碑式的事件。后基因組時代的研究重點自然落在了蛋白質頭上。為啥?因為中心法則告訴我們,基因的產物——蛋白質,是生命活動的最終執行者。與基因組類比,研究生物體內全套蛋白質的科學,就是蛋白質組學。基因組計劃完成的同年,人類蛋白質組計劃啟動,令人
質譜技術在食品組學分析中的應用
民以食為天,但隨著社會發展,食品生產中以假亂真、以次充好的水平和手段卻越來越高明,仿真度極高的偽劣產品給分析工作帶來了巨大困難,使許多傳統的鑒別方法失效,如何運用新型的技術手段來進行鑒定食品的真實性,已成為當下食品科技的研究前沿——食品組學。 食品組學(
質譜技術在食品組學分析中的應用
食品組學(Foodomics)將蛋白組學和代謝組學等組學的分析思路和方法,運用到食品分析和營養學分析范疇的一種研究方式,常用于鑒別食品的物種、產地和品質。“掛羊頭,賣狗肉”是日常用的一個熟語。自從2013年歐盟“馬肉風波”之后,中國肉類摻假的現象也屢見報道,進一步加深了人們對肉類真實性的擔憂。目前最
質譜技術在蛋白組研究中的應用(二)
6 質譜儀的最新進展?用質譜檢測蛋白,首先考慮到用PMF與 MALDI-TOF聯用,如果無法檢測,下一步就用ESI-MS/MS創建序列標簽。在PMF分析中,MALDI的平板中只需一小部分樣本就足以檢測,剩下的樣本就可以用來創建序列標簽。并且,在MALDI-TOF儀器上,用一種叫做“源后延遲”
質譜技術在蛋白組研究中的應用(一)
[摘要] 質譜對于現代蛋白質化學研究是一項重要的技術。也可用于蛋白組分析,在同一時間監控上千種蛋白的表達情況。首先蛋白質混合物可以用雙向凝膠電泳分開,再用質譜及隨后的蛋白質數據庫檢索對單個蛋白進行鑒定和分析。最近幾年,質譜領域取得了令人鼓舞的進展,使得全自動、高通量的蛋白檢測成為可能。質譜也
第三屆質譜論壇:質譜技術在組學研究中的應用
技術講座 沃特世科技(上海)有限公司技術專家 賈偉博士 來自沃特世科技(上海)有限公司技術專家賈偉博士帶來了題為《蛋白質結構質譜分析技術進行》的報告。賈博士在報告中重點介紹了蛋白質修飾分析、蛋白高級結構分析和蛋白差異構象分析這三方面內容。 蛋白質修飾分析 蛋白質
質譜技術在中草藥研究中的應用
敞開式離子化質譜(ambient ionization mass spectrometry,AIMS)是近年來興起的一種無需(或稍許)樣品前處理步驟,在敞開的大氣環境下實現離子化的質譜分析技術。近年來,各種AIMS技術的研制與應用成為質譜領域備受關注的焦點之一。本工作綜述了AIMS技術在中草
質譜流式技術在TIL研究中的應用
免疫細胞經常會出現在腫瘤組織中。它們也被稱為腫瘤浸潤性白細胞(Tumor Infiltrating Leukocyte)。這些細胞組成復雜、多變,在腫瘤發生過程中發揮著巨大的作用。目前已經成為了腫瘤免疫治療領域研究的熱點。由于免疫細胞的異質性,需要對其進行單細胞分析才能獲得真實、全面的信息。單細胞測
質譜技術在抗體藥物分析中的應用
質譜技術是抗體藥物分析最重要的技術手段之一。本文簡述了抗體藥物的發展和質譜技術的原理。對于質譜技術在抗體藥物的分析中應用進行了歸類整理,主要分為在一級結構和高級結構分析中的應用。抗體類藥物是指含有抗體片段的蛋白類藥物,所以在惡性腫瘤、自身免疫性疾病、心血管疾病、感染和器官移植排斥等重大疾病上得到了快
質譜技術在抗體藥物分析中的應用
質譜技術是抗體藥物分析最重要的技術手段之一。本文簡述了抗體藥物的發展和質譜技術的原理。對于質譜技術在抗體藥物的分析中應用進行了歸類整理,主要分為在一級結構和高級結構分析中的應用。抗體類藥物是指含有抗體片段的蛋白類藥物,所以在惡性腫瘤、自身免疫性疾病、心血管疾病、感染和器官移植排斥等重大疾病上得到了快
串聯質譜及液質聯用技術在藥物分析研究中的應用
近年來,隨著質譜技術以及聯用接口技術特別是包括電噴霧電離和大氣壓化學電離在內的大氣壓電離接口技術的突破,串聯質譜及液質聯用技術在藥物及其代謝物的定量和定性研究中發揮了極其重要的作用。對于藥物的定量研究而言,常用的質譜為串聯四極桿質譜,利用其多級離子選擇的特殊性質,在多級離子選擇監測掃描方式下,在保證
生物質譜技術在蛋白質組學中的應用
? 一、 前言[1,2] 基因工程已令人難以置信的擴展了我們關于有機體DNA序列的認識。但是仍有許多新識別的基因的功能還不知道,也不知道基因產物是如何相互作用從而產生活的有機體的。功能基因組試圖通過大規模實驗方法來回答這些問題。但由于僅從DNA序列尚不能回答某基因的表達時間、表達量、蛋白質翻
質譜技術在腫瘤蛋白質標志物研究中的應用與發展
20世紀基因組學研究取得的巨大成就為蛋白質組學的發展奠定了基礎。蛋白質組學是從整體水平上分析生命體、組織或細胞的蛋白質組成及其活動規律的科學,以基因表達產物為研究對象,延伸了基因組學研究深度,更深層次地揭示了生命活動規律。蛋白質組學的研究內容主要包括蛋白質表達存在方式(修飾形式)的鑒定、結構與功能分
基于質譜的空間蛋白質組學系統研究方法
蛋白質亞細胞定位及其動態變化過程對于蛋白質功能至關重要。隨著鳥槍法蛋白質組學的發展,通過亞細胞分離及質譜技術同時測定數千個蛋白質穩態定位的“蛋白質組學顯微鏡(proteomic microscope)”出現了。然而,表征因擾動導致的亞細胞定位變化的工具卻一直局限在光學顯微鏡,每次僅能成像一個或幾
質譜技術在臨床中的應用
來自SDi的最新報告指出,未來五年臨床質譜市場將以7.6%的速度增長。根據美國臨床實驗室協會的數據,美國臨床實驗室每年對血液、尿液和其他患者樣品檢測次數超過70億次。免疫分析一直是臨床診斷中應用最廣泛的技術,但出于對檢測結果精準性等需求,越來越多的實驗室開始將質譜作為首選的檢測工具。另外,相比于測序
質譜技術在臨床中的應用
來自SDi的最新報告指出,未來五年臨床質譜市場將以7.6%的速度增長。根據美國臨床實驗室協會的數據,美國臨床實驗室每年對血液、尿液和其他患者樣品檢測次數超過70億次。免疫分析一直是臨床診斷中應用最廣泛的技術,但出于對檢測結果精準性等需求,越來越多的實驗室開始將質譜作為首選的檢測工具。另外,相比于測序
質譜技術在肝臟疾病檢測中的研究進展
肝臟疾病是嚴重危害人類健康的疾病,其病因復雜多樣,既包括感染、腫瘤等常見因素,也包括自身免疫性、先天性疾病等特殊因素。臨床最常見的慢性肝病為乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)和丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)感染所致,在世界范圍內分別有3.7億和
質譜技術在肝臟疾病檢測中的研究進展
肝臟疾病是嚴重危害人類健康的疾病,其病因復雜多樣,既包括感染、腫瘤等常見因素,也包括自身免疫性、先天性疾病等特殊因素。臨床最常見的慢性肝病為乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)和丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)感染所致,在世界范圍內分別有3.7
綜述:基于質譜技術的糖蛋白質組學與糖組學研究進展
糖是組成生命體的四大類重要分子之一,糖蛋白質是由糖鏈與肽鏈中的特定氨基酸殘基以糖苷鍵共價連接而成的蛋白質。糖蛋白質普遍存在于生物體內,在很多生命過程中起著重要作用,如蛋白質的折疊、細胞之間的相互識別、炎癥反應等。同時,糖基化修飾在疾病中,特別是腫瘤的發生、發展和轉移過程中也起到重要作用,許多疾
分子泵在質譜技術中的應用
分流渦輪分子泵示意圖。 分析儀器需要清潔、干燥的高真空系統,真空度范圍為10-10~10-3mbar,渦輪分子泵技術為質譜儀等分析儀器的廣泛應用奠定了基礎。本文簡單介紹了德國普發真空公司的分子泵在便攜質譜、在線質譜、GC-MS、LC-MS、ICP-MS、TOF-MS以及其他質譜儀器上
液質聯用技術在化學藥雜質譜研究中的應用
藥品中雜質的存在影響著藥品質量安全,雜質譜的研究對優化藥品的合成工藝、處方工藝、包裝及儲藏條件具有重要指導意義。如何全面、合理、正確的確證及限量藥品中存在的雜質是雜質譜研究的關鍵。而采用液質聯用技術可以推導藥品中雜質的結構,為制定科學合理的質量標準及藥品生產提供依據與指導。本文探討了液質聯用技術
酵母雙雜交技術及其在蛋白質組研究中的應用
?? ? 作為后基因組時代出現的新興研究領域之一, 蛋白質組學(proteomics)正受到越來越多的關注。 蛋白質組學的研究目標是對機體或細胞的所有蛋白質進行鑒定和結構功能分析。 蛋白質組學的研究不局限任何特定的方法。 高分辨率的蛋白質分離技術如二維凝膠電泳和高效液相層析, 經典的蛋白質鑒定方法如
酵母雙雜交技術及其在蛋白質組研究中的應用
作為后基因組時代出現的新興研究領域之一, 蛋白質組學(proteomics)正受到越來越多的關注。 蛋白質組學的研究目標是對機體或細胞的所有蛋白質進行鑒定和結構功能分析。 蛋白質組學的研究不局限任何特定的方法。 高分辨率的蛋白質分離技術如二維凝膠電泳和高效液相層析, 經典的蛋白質鑒定方法如氨
酵母雙雜交技術及其在蛋白質組研究中的應用
摘要 蛋白質組學是在后基因組時代出現的一個新興的研究領域,?它的主要任務是識別鑒定細胞、組織或機體的全部蛋白質,?并分析蛋白質的功能及其模式。 因此,?揭示蛋白質組中蛋白質間的相互作用關系也是蛋白質組學的重要內容之一。 酵母雙雜交技術是用來檢測蛋白質間是否相互作用的一個非常有效的手段。 該技術在酵
《自然》子刊專題:蛋白質組學中的質譜
涉及到蛋白質組學分析的研究人員都知道蛋白質組學研究的技術路線有兩條,一條是以雙向電泳加生物質譜的方法鑒定生物體系中各種蛋白的表達譜以及各蛋白表達程度的相對變化,另一條路線就是多維色譜與生物質譜相結合的稱之為鳥槍法的技術路線。其中質譜分析技術(Mass spectrometry,MS)是蛋白質組學常用
定量蛋白質組學質譜采集技術進展(四)
無論是相對定量還是絕對定量方法,DIA很好地克服了DDA鳥槍法和SRM目標監測的種種不足, 在定量蛋白質組學中具有良好的應用前景。然而,目前DIA 方法的循環時間仍然較長,只能與納流液相聯用,并使用較長的梯度以獲得足夠的色譜峰寬,限制了DIA 的應用范圍。這也是DIA 技術下一步需要解決
定量蛋白質組學質譜采集技術進展(一)
摘要 質譜是定量蛋白組學的主要工具。近年來隨著定量蛋白質組學研究的深入,傳統質譜定量技術面臨著復雜基質干擾、分析通量限制等諸多問題。而最近一系列質譜新技術的發展,包括同步母離子選擇(SPS)、質量虧損標記、平行反應監測(PRM)、多重累積(MSX)和多種全新數據非依賴性采集(DIA)等,為解決目前蛋
定量蛋白質組學質譜采集技術進展(三)
然而PRM 的分析通量不如SRM。PRM 能同時監測最多10 ~15 個母離子,而SRM 能同時監測上百個離子對,因為高分辨質譜的有效掃描速度通常只有10 ~15 Hz,遠慢于SRM 的有效掃描速度。但是這一問題正逐步得到解決,多重累積(Multiplexing, MSX)技術的發展和使用有
定量蛋白質組學質譜采集技術進展(二)
同步母離子選擇(Synchronous precursor selection, SPS)技術的出現徹底解決了MS3 響應弱的問題。SPS 技術利用多頻切跡的選擇波形電壓(MultiNotch) [27] ,在線性離子阱中實現一次選擇同時獲得多個離子,最多可同時選擇15 個(圖2A)。利用這一原理,