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    Nature子刊:首次實現活細胞RNA標記與無背景成像

    生物大分子標記技術是生物分子成像的關鍵。在科學歷史上,人們利用熒光蛋白“點亮”細胞內蛋白質, 實現了生命動態過程中蛋白質分子的可視化。熒光蛋白技術是當代生物科學研究中最重要的研究工具之一;在短短十余年內,其研究即被授予諾貝爾獎。RNA同樣具有獨特的結構、種類繁多的生物學功能以及復雜的時間空間分布。 與蛋白質相比,RNA種類更多,大部分種類結構功能尚未鑒定,被稱為基因組中的“暗物質”。不同種類的RNA及其修飾形式的鑒定、功能與調控研究現已經成為了國際前沿。RNA研究也迫切需要一種類似于熒光蛋白這樣的顛覆性標記技術,這是深入研究RNA功能機制極為有用的工具。 國際權威學術期刊《Nature Biotechnology》雜志以“Visualizing RNA dynamics in live cells with bright and stable fluorescent RNAs”為題,在線報道了華東理工大學生物反應器工程......閱讀全文

    活體生物發光成像技術的最新進展

    活體動物體內光學成像(Optical in vivo Imaging)主要采用生物發光(bioluminescence)與熒光(fluorescence)兩種技術。生物發光是用熒光素酶(Luciferase)基因標記細胞或DNA,而熒光技術則采用熒光報告基團(GFP、RFP, Cyt及dyes等)進

    生物物理所在RNA定點特異標記研究中獲得新進展

      2月18日,Angewandte Chemie International Edition 在線發表了中國科學院生物物理研究所王江云研究組題為A Covalent Approach for Site-Specific RNA Labeling in Mammalian Cells 的最新研究成果

    量子點活細胞成像應用的實驗方案建議

       量子點(Quantum dot, QD)是一種新型熒光納米材料,又稱半導體納米晶,呈近似球形,三維尺寸在2-10nm,具有明顯的量子效應,其物理、光學、電學特性優于傳統有機熒光染料,是新一代熒光標記探針的優質選擇。    Chan等將量子點與傳統有機熒光染料進行了光學特性的比較,發現量子點的

    基因技術專題-1

    專題一:RNA干擾技術(RNAi)1995年,康奈爾大學的Su Guo博士用反義RNA阻斷線蟲基因表達的試驗中發現,反義和正義RNA都阻斷了基因的表達,他們對這個結果百思不得其解。直到1998年, Andrew Fire的研究證明,在正義RNA也阻斷了基因表達的試驗中,真正起作用的是雙鏈RNA。這些

    量子點活細胞成像應用的實驗方案

    量子點(Quantum dot, QD)是一種新型熒光納米材料,又稱半導體納米晶,呈近似球形,三維尺寸在2-10nm,具有明顯的量子效應,其物理、光學、電學特性優于傳統有機熒光染料,是新一代熒光標記探針的優質選擇。Chan等將量子點與傳統有機熒光染料進行了光學特性的比較,發現量子點的熒光亮度是傳統熒

    Nat Rev Genetics | 環狀RNA的合成與功能

      環狀RNA(circular RNA,circRNA)是一種新興的內源性非編碼RNA(noncoding RNA,ncRNA),是繼microRNA (miRNA)以及long noncoding RNA (IncRNA)后非編碼RNA家族中極具研究潛力的新成員。越來越多的研究表明,環狀RNA具

    流式細胞術在血液學中的應用

      DNA倍體分析及細胞周期分析    在細胞周期內,DNA含量隨細胞內時相發生周期性變化,正常情況下,大多數細胞處于休止期(Go), G1期細胞雖有DNA合成,但DNA含量仍為2N,為二倍體細胞,;處于活躍的DNA合成期(S期)的細胞DNA含量為2N-4N;正經歷細胞分裂(G2/M期)的細胞

    RNAi——雙鏈RNA引起的基因敲除(1)

    1995年,康奈爾大學的Su Guo博士用反義RNA阻斷線蟲基因表達的試驗中發現,反義和正義RNA都阻斷了基因的表達,他們對這個結果百思不得其解。直到1998年, Andrew Fire的研究證明,在正義RNA也阻斷了基因表達的試驗中,真正起作用的是雙鏈RNA[1]。這些雙鏈RNA是體外

    Nature | 轉移灶示蹤新方法發現具有干細胞特性實質細胞

      腫瘤微環境(tumor microenvironment, TME)不但為腫瘤細胞提供了生存和增殖的土壤,還可以改變腫瘤細胞的增殖和侵襲行為,二者之間的相互作用促進著腫瘤生成、遷移轉移、血管生成、免疫抑制及靶器官選擇等過程發生。以往的多項研究表明,微環境中如激活的成纖維細胞、周細胞、內皮細胞、炎

    研究蛋白質-RNA相互作用的新工具

      近日,賽默飛世爾科技全新推出了一款Pierce Magnetic RNA-Protein Pull-Down Kit,讓研究人員能夠以末端標記的RNA作為誘餌,輕松富集蛋白質-RNA的相互作用。與抗體捕獲相比,這種方法的優勢在于脫硫生物素化的目標RNA能夠直接富集RBP(或復合物)。  蛋白

    鄒鵬/王建斌合作發展空間特異性RNA標記技術

      真核細胞轉錄組在三維空間中的分布特征對于基因表達具有重要調節作用。在記憶形成、胚胎發育、細胞增殖等一系列生理學過程中,細胞通過將特定RNA分子選擇性富集在亞細胞區域,能夠實現對蛋白質翻譯過程的精準調控,或幫助建立和維持染色體三維結構。因此,發展一種能在轉錄組層面解析細胞中RNA三維空間定位的方法

    Cell子刊論文解答細胞生物學謎題

      在任何教科書的簡圖中,一組紅血細胞、皮膚細胞或神經細胞,通常大小都是相同的。但是,正如沒有哪兩個人的身高和體重是完全相同,在一個真正的細胞群體中,細胞的尺寸是有大有小的。  最近,賓夕法尼亞大學的一個研究小組表明,在大多數細胞染色體中的核DNA的兩個拷貝,可以使細胞具有任何的尺寸大小。相關研究結

    流式檢測細胞凋亡還有哪些方法?

      前面講到利用流式細胞術進行細胞凋亡檢測的annexinV/PI雙染色法,今天主要簡要介紹SYTO/PI雙染色法、細胞DNA含量分析法、TUNEL法。  SYTO/PI雙染色法  SYTO系列染料是一種細胞膜通透性的核酸染料,可以自由進入活細胞與細胞內的DNA或者RNA結合,未結合時發射熒光信號的

    細胞RNA實時成像或將“成為可能”?!

      結合并激活熒光染料的適體熒光 RNA(FR)已用于對豐富的細胞 RNA 種類進行成像。然而,諸如低亮度和具有不同光譜特性的染料 / 適體組合的有限可用性的局限性,限制了這些工具在活的哺乳動物細胞和體內的使用。  2019 年 9 月 23 日,華東理工大學朱麟勇及楊弋共同通訊在 Nature B

    microRNA的實時定量莖環RT-PCR技術

      microRNA的實時定量莖環RT-PCR技術   摘要:   已開發出一種新型的microRNA(miRNA)的定量方法,即利用莖環反轉錄,Taqman PCR分析。莖環RT引物在RT 效率和特異性方面比傳統的更好。TaqMan miRNA的檢測是很具體的,可以檢測成熟miRNA和區分

    凝膠遷移實驗(EMSA)——凝膠遷移

    凝膠遷移或電泳遷移率實驗(EMSA)可以:(1)研究DNA結合蛋白和其相關的DNA結合序列相互作用;(2)可用于DNA定性和定量分析;(3)用于研究RNA結合蛋白和特定的RNA序列的相互作用。實驗方法原理一種研究DNA結合蛋白和其相關的DNA結合序列相互作用的技術,可用于定性和定量分析。這一技術最初

    Nature論述:單細胞基因組學揭開“免疫新世界”

      人類對生命的好奇,從來沒有減退。一個多世紀以來,科學家們一直試圖解析構成我們機體的成千上萬億個細胞,從一米長的神經元到8微米寬的紅細胞。他們希望從中找到解析重要生理、病理過程,挖掘重要的細胞類型和信號通路。  但是,過去幾十年,包括熒光抗體標記技術、DNA和RNA測序技術等在內的研究工具卻不能解

    環狀RNA結合功能蛋白!找對方向20分文章水到渠成

      環狀RNA作為研究持續火熱的明星分子,不同于對其豐富的表達譜研究,環狀RNA功能機制研究還僅僅處在起步階段。環狀RNA研究多為miRNA海綿機制,部分circRNA可競爭性結合miRNA,解除miRNA對靶基因的抑制作用,上調靶基因的表達。其實,環狀RNA可以通過結合不同種類的功能蛋白,分別在轉

    科學家首次實現活細胞RNA標記與無背景成像

    圖為《自然—生物技術》11月期封面圖片。它顯示了利用熒光RNA可對單細胞中mRNA的翻譯過程進行定量研究。癌細胞中mRNA水平與其編碼蛋白質水平之間存在較低相關性,提示癌細胞的翻譯調控顯著失調,這為癌癥的診療提供一種全新的思路。  華東理工大學生物反應器工程國家重點實驗室的楊弋、朱麟勇等教授歷經7年

    國際首次|我國學者實現活細胞RNA標記與無背景成像

      華東理工大學生物反應器工程國家重點實驗室的楊弋、朱麟勇等教授歷經7年合作研究,在熒光RNA及活細胞RNA成像領域獲突破性進展。他們原創的系列高性能熒光RNA,在國際上首次實現了不同種類RNA在動物細胞內的熒光標記與無背景成像。11月5日,該成果以封面論文形式發表于《自然—生物技術》。  熒光蛋白

    酵母三雜交系統檢測和分析RNA-蛋白相互作用實驗

    酵母三雜交系統(yeast three-hybrid system)可用于分析蛋白質與 RNA 間的相互作用。在酵母三雜交系統中,RNA 蛋白質相互作用導致報道基因的轉錄,可以通過細胞生長、克隆顏色或特異的酶活性檢測蛋白質與 RNA 的相互作用。本實驗來源「RNA 實驗指導手冊」主編:鄭曉飛。實驗方

    流式細胞儀在生物學中的應用

    流式細胞儀在生物學中的應用 耿慧霞 ,王 來 ,王 強 (河南大學生命科學學院 ,河南開封 475001) 摘 要 :簡要論述了流式細胞儀(flow cytometry ,FCM) 的工作原理 ,并對其在生物學基礎科學研究中的應用進行闡述 ,包括 對細胞凋亡、細胞周期、免疫細胞、細胞受體的研

    組織學研究方法

    (一)一般光學顯微鏡術應用一般光學顯微鏡(簡稱光鏡)觀察組織切片是組織學研究的最基本方法。取動物或人體的新鮮組織塊,先用固定劑(fixative)固定(fixation),使組織中的蛋白質迅速凝固,防止細胞自溶和組織腐敗。常用的固定劑如灑精、甲醛、醋酸、苦味酸、四氧化鋨等,一般常將幾種固定劑配制成混

    凝膠遷移實驗(EMSA)

    實驗方法原理 凝膠遷移或電泳遷移率實驗(EMSA-electrophoretic mobility shift assay)是一種研究DNA結合蛋白和其相關的DNA結合序列相互作用的技術,可用于定性和定量分析。這一技術最初用于研究DNA結合蛋白,目前已用于研究RNA結合蛋白和特定的RNA序列

    解讀單細胞RNA-seq技術

      多年來,跟蹤一個單細胞的轉錄組,超出了我們的能力。但是現在,時代已經變了,新的單細胞RNA-seq方法,可以分析大量的細胞及它們的命運。  我們都參加過大型生日派對:在擁擠的房間里,與許多人聊天、吃飯和慶祝。但是,試想你并不知道壽星是誰,只是像一個局外者看待這個派對。你可能會覺得整個事件看起來與

    解讀單細胞RNA-seq技術

    多年來,跟蹤一個單細胞的轉錄組,超出了我們的能力。但是現在,時代已經變了,新的單細胞RNA-seq方法,可以分析大量的細胞及它們的命運  多年來,跟蹤一個單細胞的轉錄組,超出了我們的能力。但是現在,時代已經變了,新的單細胞RNA-seq方法,可以分析大量的細胞及它們的命運。  我們都參加過大型生日派

    細胞凋亡及其檢測技術-3

    2、RT-PCR法檢測細胞bcl-2 mRNA的表達:(1)總RNA提取:為了獲得高質量的真核細胞mRNA,必須使用RNA酶抑制劑。操作過程中應避免RNA酶污染器材和試劑,因此所有剝離、塑料器材先用0.1%DEPC水溶液浸泡12h,然后用無菌的新鮮蒸餾水淋洗數次,塑料器材應采用高壓蒸汽滅菌。玻璃器材

    酵母三雜交系統檢測和分析RNA-蛋白相互作用實驗

    實驗方法原理 酵母三雜交系統(yeast three-hybrid system)可用于分析蛋白質與 RNA 間的相互作用。在酵母三雜交系統中,RNA 蛋白質相互作用導致報道基因的轉錄,可以通過細胞生長、克隆顏色或特異的酶活性檢測蛋白質與 RNA 的相互作用。試劑、試劑盒 YPD 和 SD 培養基鮭

    流式細胞儀技術概述

    流式細胞儀技術,主要是測量群體中單個細胞經適當染色后其成分所發出的散射光和熒光,經染色的細胞在懸液中以單行流過高強度光源的焦點,當每個細胞經過焦點時,發出一束散射光/或熒光。它們經過過濾及光鏡系統收集到達一個光電檢測器(光電倍增管或一個固態裝置),光檢測器把散射光定量轉化成電信號,經數字轉換器進行數

    流式細胞儀技術概述

    流式細胞儀技術,主要是測量群體中單個細胞經適當染色后其成分所發出的散射光和熒光,經染色的細胞在懸液中以單行流過高強度光源的焦點,當每個細胞經過焦點時,發出一束散射光/或熒光。它們經過過濾及光鏡系統收集到達一個光電檢測器(光電倍增管或一個固態裝置),光檢測器把散射光定量轉化成電信號,經數字轉換器進行數

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