葉明亮:位點特異性糖型的蛋白質組分析方法研究
分析測試百科網訊 2020年9月14日,由中國質譜學會(中國物理學會質譜分會)主辦,分析測試百科網和中國質譜學會網承辦的2020年中國質譜學會質譜網絡研討會(2020 CMSS)正式開幕。本屆質譜網絡研討會正值中國質譜學會成立40周年,按報告內容涉及領域包括生命科學與組學、藥物藥理毒理分析、元素分析與金屬組學、離子化及成像技術、環境與食品、臨床質譜等。本屆大會第一天共有近3000人參與。分析測試百科網為您帶來全程跟蹤報道。中國科學院大連化學物理研究所 葉明亮研究員報告題目:位點特異性糖型的蛋白質組分析方法研究 由中國科學院大連化學物理研究所葉明亮研究員為大家介紹位點特異性糖型的蛋白質組分析方法研究。葉明亮表示,傳統臨床上使用的標志物基本都是檢測蛋白質的濃度差異,或是糖鏈抗原的濃度差異。不同于傳統方法,團隊通過將糖基化蛋白質組和糖組學結合,形成糖基化蛋白質組的全景式分析,將去N的糖鏈用親水色譜富集,最后用束狀CID質譜分析,......閱讀全文
葉明亮:位點特異性糖型的蛋白質組分析方法研究
分析測試百科網訊 2020年9月14日,由中國質譜學會(中國物理學會質譜分會)主辦,分析測試百科網和中國質譜學會網承辦的2020年中國質譜學會質譜網絡研討會(2020 CMSS)正式開幕。本屆質譜網絡研討會正值中國質譜學會成立40周年,按報告內容涉及領域包括生命科學與組學、藥物藥理毒理分析、元素
葉明亮研究員:蛋白質組修飾譜分析新方法
中國科學院大連化學物理研究所 葉明亮研究員? ? ? ? 2014年4月26日,首屆全國質譜分析學術研討會在北京西郊賓館盛大開幕。來自中國科學院大連化學物理研究所的葉明亮研究員為大家帶來題為《蛋白質組修飾譜分析新方法》的報告。翻譯后修飾大多發生在具有重要生理調控功能的低豐度蛋白質
位點特異性重組的簡介
位點特異性重組(site-specific recombination)是遺傳重組的一類。這類重組依賴于小范圍同源序列的聯會,重組也只發生在同源的短序列的范圍之內,需要位點特異性的蛋白質分子參與催化,重組的蛋白不是rec 系統而是int 等,如噬菌體l 的定點插入。重組時發生精確的切割、連接反應
方案7-位點特異性蛋白質DNA-光交聯法實驗
實驗材料DNA 聚合酶 I Klenow 片段限制性內切酶A 和 B單鏈 DNA 結合蛋白單鏈 DNA 模板T4 DNA 連接酶T4 DNA 聚合酶T4 多聚核苷酸激酶T7 DNA 聚合酶上游引物試劑、試劑盒10 X 退火緩沖液ATP對疊氮化苯甲酰甲溴生物素-11-dATP生物素-11-dCTP生物
位點特異性核酸內切酶的蛋白質工程實驗
實驗材料pMQ402試劑、試劑盒阿拉伯糖苯甲基磺酰氟Ni-NTA 瓊脂糖結合緩沖液清洗緩沖液洗脫緩沖液透析緩沖液儀器、耗材超聲破碎器冷凍離心機實驗步驟3. 方法此處列出的方法概括了為定點突變而做的氨基酸位點選擇(見 3.1)、為在細菌細胞中表達而做的 MutH 蛋白突變 ( 見 3.2 ) 和 Mu
位點特異性核酸內切酶的蛋白質工程實驗
位點特異性核酸內切酶的蛋白質工程 ? ? ? ? ? ? 實驗材料 pMQ402 試劑、試劑盒
位點特異性核酸內切酶的蛋白質工程實驗
實驗材料 pMQ402試劑、試劑盒 阿拉伯糖苯甲基磺酰氟Ni-NTA 瓊脂糖結合緩沖液清洗緩沖液洗脫緩沖液透析緩沖液儀器、耗材 超聲破碎器冷凍離心機實驗步驟 3. 方法此處列出的方法概括了為定點突變而做的氨基酸位點選擇(見 3.1)、為在細菌細胞中表達而做的 MutH 蛋白突變 ( 見 3.2 )
用蛋白質組學方法繪制磷酸化位點圖譜
方案1 用帶有 Fe(Ⅲ) 和 Ga(Ⅲ)的 IMAC 純化磷酸化多肽 方案2 在 MALDI 分析之前或之后對磷酸化多肽進行堿性磷酸酶處理 方案3 結合固定化金屬離子親和介質和 MALDI-TOF-MS 直接分析方法對磷酸化多肽進行特征分析實驗 方
關于位點特異性重組的特點介紹
①這種交換是可逆的,原先存在的DNA順序全部被保存下來,并無丟失; ②噬菌體和細菌的DNA之間有一段很短的同源序列,重組交換必須通過其中的一個特定的核苷酸。這兩個特點也就是位點特異性重組的共同特點。
關于位點特異性重組的整合介紹
λ噬菌體編碼λ整合酶(integrase)。這個酶能指導噬菌體DNA插入E.coli染色體中。這種插入作用是通過兩個DNA分子的特異位點進行重組,將兩個環狀DNA分子變成一個大環。在噬菌體感染的早期即有大量整合酶產生,故幾乎所有被感染的細胞都發生整合作用。這種作用可用體外模型來進行實驗。用四種成
蛋白質結合位點的定義
分子中能與配體形成穩定相互作用的特定部位。蛋白質的結合位點通常是由多肽鏈上的一些相互分離的氨基酸殘基通過肽鏈折疊在空間上聚集到一起,形成特定的空間排布方式。
簡述位點特異性重組的最終結果
其結果是G(+)和G(-)噬菌體對不同株E.coli有不同的特異性。在G(+)方向,基因S和U表達,其產物使噬菌體可吸附在E.coliK12上,但不能吸附在E.coliC上,反之,在G(-)方向,基因S’和U’表達,噬菌體可吸附在E.coliC上,而不能吸附在E.coliK12上。各蛋白質的分子
葉明亮:發展高效藥物靶標鑒定新方法
近日,大連化物所生物分離分析新材料與技術研究組(1809組)葉明亮研究員團隊和吉林大學胡良海教授團隊、我所分子模擬與設計研究組(1106組)李國輝研究員團隊合作,利用蛋白質結合藥物以后對變性引起的沉淀具有更高的耐受性原理,發展了一種新型的藥物靶標蛋白質鑒定方法。 靶標蛋白的發現對藥物作用機制的
15專項督查組檢查216點位
8月2日,6個督查組共檢查81家企業(單位),發現22家涉氣企業存在環境問題。存在問題的企業中,屬于涉氣“散亂污”問題的9家,超標排放的2家,未安裝污染治理設施的2家,治污設施不正常運行的2家,揮發性有機物(VOCs)治理問題的7家。 8月2日,駐河北省的8個督查組下沉至13個區縣,共對河北省
為什么蛋白質保守絲氨酸位點是其磷酸化位點
磷酸化位點一般有絲氨酸,蘇氨酸,酪氨酸。其中,絲氨酸和蘇氨酸是最常見的磷酸化位點,因為其結構末端含有羥基,羥基很活潑,可以與磷酸基團結合。磷酸化的過程就是傳遞磷酸基團。所以說,蛋白質中如果某個絲氨酸很保守的話,很大程度上就是磷酸化位點。
為什么蛋白質保守絲氨酸位點是其磷酸化位點
磷酸化位點一般有絲氨酸,蘇氨酸,酪氨酸。其中,絲氨酸和蘇氨酸是最常見的磷酸化位點,因為其結構末端含有羥基,羥基很活潑,可以與磷酸基團結合。磷酸化的過程就是傳遞磷酸基團。所以說,蛋白質中如果某個絲氨酸很保守的話,很大程度上就是磷酸化位點。
蛋白質磷酸化位點怎么確定
鑒定了磷酸化肽后,還要進一步確定磷酸化肽中修飾了磷酸化位點的哪個殘基.用于確定磷酸化肽中磷酸化位點的質譜方法基于兩種不同原理,第一種方法取決于磷酸酯鍵的化學穩定性,如在ESI質譜儀的碰撞室或離子源中,或在MALDI-MS的PSD過程中.磷酸化肽可通過磷酸酯鍵斷裂產生的碎片離子鑒定.第二種方法基于肽段
蛋白質磷酸化位點怎么確定
鑒定了磷酸化肽后,還要進一步確定磷酸化肽中修飾了磷酸化位點的哪個殘基.用于確定磷酸化肽中磷酸化位點的質譜方法基于兩種不同原理,第一種方法取決于磷酸酯鍵的化學穩定性,如在ESI質譜儀的碰撞室或離子源中,或在MALDI-MS的PSD過程中.磷酸化肽可通過磷酸酯鍵斷裂產生的碎片離子鑒定.第二種方法基于肽段
蛋白質磷酸化位點怎么確定
鑒定了磷酸化肽后,還要進一步確定磷酸化肽中修飾了磷酸化位點的哪個殘基.用于確定磷酸化肽中磷酸化位點的質譜方法基于兩種不同原理,第一種方法取決于磷酸酯鍵的化學穩定性,如在ESI質譜儀的碰撞室或離子源中,或在MALDI-MS的PSD過程中.磷酸化肽可通過磷酸酯鍵斷裂產生的碎片離子鑒定.第二種方法基于肽段
位點特異性重組的整合酶和IHF的介紹
在att上都有特定的結合位點,體外實驗也證明這兩種蛋白質結合在attDNA的特定位點上。每一次重組過程需要20-40個整合酶分子及約70個IHF分子。故可能這兩種蛋白質不僅是作為酶(發揮催化作用),而且在每次重組中都要形成某種復合物結構。通過缺失實驗,證明attP至少要約250bp長,太短將使其
關于位點特異性重組的基因的表達調控介紹
如果一個DNA分子上兩個特異位點之間發生重組,其后果有兩種可能性:兩個位點之間的節段或被丟失,或被顛倒。有些生物能夠利用這種重組倒置來控制基因的表達。因為DNA的一正一倒兩種排列法可以相應地表達兩種不同的蛋白質,細胞就可根據需要作出選擇。奇怪的是,利用這種機制所調節的蛋白質往往都位于生物的體表。
特異性位點的DNA甲基化的檢測方法
相關專題1 甲基化敏感性限制性內切酶 (methylation-sensitive restriction Endonuclease,MS-RE)-PCR/Southern法這種方法利用甲基化敏感性限制性內切酶 對甲基化區的不切割的特性,將DNA消化為不同大小的片段后再進行分析。常使用的甲基化敏感的
關于位點特異性重組的整合和切出的介紹
attB由稱為BOB’的序列組成,而attP由POP'組成。O是核心序列,是attB和attP所共同的。而其兩側的序列是B,B’和P,P’,被稱為臂。噬菌體DNA是環狀的,重組時被整合入細菌染色體中,成為線性序列。前病毒的兩側是兩個新的雜種att位點,左側稱為attL,由BOP’組成,而
蛋白質組學揭示油菜卷葉機理(一)
題目:Histological, Physiological, and Comparative Proteomic Analyses Provide Insights into Leaf Rolling in Brassica napus期刊:Journal of Proteome Research
蛋白質組學揭示油菜卷葉機理(二)
?????圖4. 差異表達蛋白的COG注釋分析????????????????????????????? 圖5. 差異表達蛋白的KEGG富集分析5. 為了進一步對這些差異蛋白的功能進行分類分析,作者進行了功能富集分析。通過對差異蛋白的富集分析結果發現,這些發生上調的蛋白能夠改善Bndcl1株的光合性
以量子點對包膜病毒進行位點特異性標記用于單病毒示蹤
對于單病毒的示蹤,是研究病毒感染路徑和表征病毒與靶細胞動態相互作用的有力工具,有助于闡明病毒侵入細胞并播散的關鍵步驟,揭示病毒流行和發病的機理,從而有利于形成具有針對性的新的治療策略。為了實現對單病毒的持續示蹤,熒光標記物必須具備良好的熒光穩定性,配備應用高放大倍數的物鏡,從而實現對微小病毒顆粒
以量子點對包膜病毒進行位點特異性標記用于單病毒示蹤
對于單病毒的示蹤,是研究病毒感染路徑和表征病毒與靶細胞動態相互作用的有力工具,有助于闡明病毒侵入細胞并播散的關鍵步驟,揭示病毒流行和發病的機理,從而有利于形成具有針對性的新的治療策略。為了實現對單病毒的持續示蹤,熒光標記物必須具備良好的熒光穩定性,配備應用高放大倍數的物鏡,從而實現對微小病毒顆粒
以量子點對包膜病毒進行位點特異性標記用于單病毒示蹤
對于單病毒的示蹤,是研究病毒感染路徑和表征病毒與靶細胞動態相互作用的有力工具,有助于闡明病毒侵入細胞并播散的關鍵步驟,揭示病毒流行和發病的機理,從而有利于形成具有針對性的新的治療策略。為了實現對單病毒的持續示蹤,熒光標記物必須具備良好的熒光穩定性,配備應用高放大倍數的物鏡,從而實現對微小病毒顆粒(2
核糖體結合位點的蛋白質構成
核糖體是細胞內一種核糖核蛋白顆粒(ribonucleoproteinparticle),主要由rRNA和蛋白質構成,其唯一功能是按照mRNA的指令將氨基酸合成蛋白質多肽鏈,所以核糖體是細胞內蛋白質合成的分子機器。 構成核糖體的蛋白質。大腸桿菌核糖體蛋白的初級結構均被確定。大腸桿菌核糖體的30S
核糖體結合位點的蛋白質構成
核糖體是細胞內一種核糖核蛋白顆粒(ribonucleoproteinparticle),主要由rRNA和蛋白質構成,其唯一功能是按照mRNA的指令將氨基酸合成蛋白質多肽鏈,所以核糖體是細胞內蛋白質合成的分子機器。構成核糖體的蛋白質。大腸桿菌核糖體蛋白的初級結構均被確定。大腸桿菌核糖體的30S亞基含S