最新果蠅基因組測序，展現奇妙的進化
對真核生物進行全基因組測序在二十世紀還是一項了不起的大工程，直到2000年末人們還只完成了四項這樣的研究。不過自那以后，測序技術的飛速進步使全基因組測序對于許多研究團隊來說觸手可及，現在每隔不久就會涌現出一項新的測序成果。日前，維也納獸醫大學Christian Schl?tterer研究組的Viola Nolte發表了該校第一項真核生物全基因組測序成果，揭示了物種進化的奇妙之處，文章發表在近期的Genome Research雜志上。 研究中的果蠅Drosophila mauritiana與著名的黑腹果蠅Drosophila melanogaster是近親，而此前黑腹果蠅的全基因組測序已經完成。現在研究人員通過Illumina GAIIx平臺得到了果蠅Drosophila mauritiana的全基因組序列，并對其中的各種基因進行了注釋。這對于果蠅研究者們來說無疑大有裨益。 此外，這項研究還揭示了果......閱讀全文
RNA測序技術如何繪制全基因組轉錄終止？
近日，南方科技大學生命科學學院翟繼先團隊利用納米孔單分子RNA測序技術繪制了擬南芥全基因組水平轉錄終止圖譜。該方法能同時捕獲包括已轉錄過polyA位點的 readthrough轉錄本、完成3’末端切割的5’或3’切割產物、以及已完成或正在進行多腺苷酸化（polyadenylation）的轉錄本在
全基因組測序揭示蒙古族遺傳結構
內蒙古民族大學生命科學學院白海花團隊對175名蒙古人進行了全基因組測序，從而揭示了蒙古族的遺傳結構。11月6日，相關成果發表于《自然—遺傳學》。 歷史上，蒙古族的統治疆域曾北至俄羅斯的西伯利亞，南至中國南海，東北至黑龍江，西南至緬甸泰國境內，蒙古族民眾也因此四散各地。不過，對于蒙古族人如何影響
基因是否表達：cfDNA全基因組測序可揭曉
《Nature Genetics》雜志上的研究表明，血循環游離DNA（cfDNA）可提供線索來預測基因的表達。 全基因組測序就能知道基因是否表達 基因表達(gene expression)是指細胞在生命過程中，把儲存在DNA順序中的遺傳信息經過轉錄和翻譯，最后轉變成具有生物活性的蛋白質分子的
全基因組重測序的生物信息分析內容
1．數據量產出總堿基數量、Totally mapped reads、Uniquely mapped reads統計，測序深度分析。2．一致性序列組裝與參考基因組序列（Reference genome sequence）的比對分析，利用貝葉斯統計模型檢測出每個堿基位點的最大可能性基因型，并組裝出該個體
關于全基因組測序的基本信息介紹
全基因組測序是對未知基因組序列的物種進行個體的基因組測序。 1986年， Renato Dulbecco是最早提出人類基因組測序的科學家之一。他認為如果能夠知道所有人類基因的序列，對癌癥的研究將會很有幫助。美國能源部（DOE）與美國國家衛生研究院（NIH），分別在1986年與1987年加入人類基
通過全基因組測序進入輸血的新時代
一項發表在Lancet子刊《The Lancet Haematology》，依托于全球首個健康成年人全基因組隨機試驗“MedSeq 項目（MedSeq Project）”的研究開發并驗證了一款電腦程序，將全面和經濟地測定血型個體差異，準確率為99%以上。A、B、O和AB型是我們比較了解的血型，實際上
Science：三項鳥類全基因組測序研究
目前，一個國際科學家小組完成了一項迄今為止最大的動物全基因組研究。為了構建鳥類的生命樹，研究小組測定、組裝和比較了48種鳥類的全基因組，這些鳥包括鴕鳥、蜂鳥、烏鴉、鴨、獵鷹、鸚鵡、鶴、朱鷺、啄木鳥和鷹，囊括了現代鳥類的所有主要分支。作為鳥類系統基因組學財團（由來自20個國家80家機構的200多名
我國科學家完成柞蠶全基因組測序
由遼寧省蠶業科學研究所牽頭，遼寧省農科院大連生物技術研究所、吉林省蠶業科學研究院、沈陽農業大學生物科學技術學院、河南省蠶業科學研究院、黑龍江省蠶業研究所組成的柞蠶基因組研究聯合攻關項目組(簡稱柞蠶項目組)與深圳華大基因科技服務有限公司(簡稱華大科技)攜手，經過兩年的不懈努力，日前完成了柞蠶全基因
全基因組測序揭示肝癌相關基因突變
由亞洲癌癥研究組織(ACRG)、深圳華大基因研究院等多家單位合作完成的與肝細胞癌相關的基因突變研究成果于2013年6月20日在《基因組研究》(Genome Research)雜志上發表。這是繼2012年3月份在《自然-遺傳學》上發表的乙肝病毒整合機制研究之后，該研究團隊在肝癌研究中所取得的又
全基因組測序揭示蒙古族遺傳結構
內蒙古民族大學生命科學學院白海花團隊對175名蒙古人進行了全基因組測序，從而揭示了蒙古族的遺傳結構。11月6日，相關成果發表于《自然—遺傳學》。 歷史上，蒙古族的統治疆域曾北至俄羅斯的西伯利亞，南至中國南海，東北至黑龍江，西南至緬甸泰國境內，蒙古族民眾也因此四散各地。不過，對于蒙古族人如何影響其他
新突破！掌上測序儀首次完成人類全基因組測序
最近，英國牛津大學（Oxford University）Wellcome Trust人類遺傳學中心（Wellcome Trust Centre for Human Genetics）和在基因組分析領域領先的英國公司Genomics plc宣布，首次使用掌上納米孔測序儀完成了多個人類全基因組測序和
香港基因組計劃細節公布！將進行兩萬人全基因組測序
基因大數據是精準醫學的基礎，全世界已經啟動了眾多大規模基因組學計劃，朝著精準醫療的目標邁進。根據香港特區政府食物及衛生局本周提交的一份文件，作為香港基因組計劃（Hong Kong Genome Project，HKGP）的一部分，香港計劃對20,000名參與者進行基因組測序和分析。相關文件將于下
Science新聞：英國公布大型全基因組測序計劃
基因分析技術在快速發展，昨日英國首相宣布了一項大型計劃，將對患有癌癥及罕見疾病的十萬英國人進行全基因組測序。現在許多國家都在為治療疾病而努力解碼國民的DNA，而英國這一新項目的不同之處在于，其測序的是全基因組而非基因組個別區域。 英國首相David Cameron在聲明中稱，英國國民醫
謝曉亮：單細胞全基因組測序曙光初現
?謝曉亮 12月21日出版的美國《科學》雜志發表了題為《單細胞全基因組測序探索精子重組規律和遺傳缺陷》的論文。同時，該期《科學》雜志也將單細胞全基因測序列為2013年六大值得關注的科學領域之一。 該論文由美國科學院院士、哈佛大學教授謝曉亮課題組與北京大學生物動態光學成像中心（
JAMA：全基因組測序用于臨床仍存在技術挑
據3月12日發表在《美國醫學會雜志》上的一則研究報告披露，在一項有12名成年人參與的探索性研究中，應用全基因組測序(WGS)與不完整的遺傳性疾病基因的覆蓋、檢測具有最高潛在臨床影響的基因變異的低復驗性，以及臨床報告發現的不確定性有關，盡管在某些案例中，WGS會發現基因變異株從而引入早期的醫療干預
腦癌細胞系全基因組測序首次完成
其所揭示的新分子靶標將有助于開發出更具效力和更少毒性的藥物 美國加州大學洛杉磯分校瓊森綜合癌癥研究中心的科學家在1月29日的《公共科學圖書館·遺傳學》(PLoS Genetics)專刊上發表論文指出，他們首次完成了腦癌細胞系全基因組測序，這也是截至目前對單個癌癥細胞系所做的最為徹底的測序分析。
我國科學家率先完成棗全基因組測序
日前，河北農業大學教授劉孟軍團隊與深圳華大基因科技服務有限公司合作，在世界上率先完成棗樹的高質量全基因組測序，使棗樹成為世界鼠李科植物和我國干果樹種中第一個完成基因組測序的物種。《自然—通訊》10月29日在線發表了該成果。 劉孟軍說，其團隊自2010年啟動棗基因組計劃，從棗基因組大小
基因是否表達，做個cfDNA全基因組測序就可揭曉
8月29日，《Nature Genetics》雜志上的研究表明，血循環游離DNA（cfDNA）可提供線索來預測基因的表達。 全基因組測序就能知道基因是否表達 基因表達(gene expression)是指細胞在生命過程中，把儲存在DNA順序中的遺傳信息經過轉錄和翻譯，最后轉變成具有生物活性的
首個中國地區古人全基因組數據被測序
近日，《當代生物學》發表了首次針對中國地區古人類的全基因組研究成果。該項目由中國科學院古脊椎動物與古人類研究所和德國馬普進化人類研究所等團隊合作完成，研究分析了距今4萬年前出土于北京房山田園洞的一具男性個體基因組，發現東亞早期人群組成十分復雜。 雖然歐洲和西伯利亞地區都有古人類樣本基因組被測序
Genome－Res：全基因組測序追蹤耐藥細菌傳播機制
耐甲氧西林金黃色葡萄球菌（MRSA）是一種常見的引發院內感染的致病菌，其也是資源不足醫院感染的一大負擔，此前當資源較好的臨床機構運用全基因組測序來追蹤MRSA的擴散時，針對有限的感染控制的傳播動力學常常并不清楚，近日，來自劍橋大學的研究人員就利用全基因組測序的技術揭示了高傳播率的資源受限醫院中M
《PLoS生物學》：老鼠全基因組測序圖公布
最新一期的開放存取的《公共科學圖書館·生物學》(PLoS Biology)雜志上，美國、英國和瑞典的研究人員公布了老鼠的全基因組測序圖。老鼠成為繼人類之后第二個完成全基因組測序的哺乳動物。 在對人類和老鼠的基因測序圖進行綜合性比較后，研究人員發現兩者之間的遺傳差異要比人們預想的大得多。老鼠
Illumina推出Nextera－DNA－Flex全基因組測序制備產品
近日，Illumina宣布推出一款全新的全基因組測序(WGS)文庫制備產品——Nextera DNA Flex，它讓全血和唾液樣本省去了樣本制備，也讓文庫制備流程跳過了一些繁瑣步驟，比如DNA的機械片段化、定量和歸一化。Nextera DNA Flex提供了一個快速、整合的流程，適合廣泛的應用，
全基因組測序可作為一線診斷工具
近日，一項涉及54個國家1000個家庭的研究表明，全基因組測序對未確診疾病的診斷率比經典遺傳診斷方法還高。科學家們呼吁將全基因組測序作為未確診疾病的一線診斷工具，以給患者帶來更好的醫療護理。相關結果以《Clinical exome sequencing: results from 2819 sa
震驚！全基因組測序還能這樣用在癌癥治療上？
近年來，隨著全基因組測序所需時間和成本的降低，個體化治療將造福更多的癌癥患者。近日發表于《Nature Medicine》的一項研究表明，開發新的機器學習算法對腫瘤全基因組序列信息進行分析，有助于預測患者的預后，幫助患者選擇最佳的治療方案。 全基因組測序（Whole-genome seque
世界首個梅花全基因組重測序研究完成
日前，北京林業大學張啟翔教授領銜的國家花卉工程技術研究中心，與青島華大基因研究院、深圳華大生命科學研究院以及賓夕法尼亞州立大學等單位通力合作完成了首個梅花全基因組重測序研究，構建完成了世界首張梅花全基因組變異圖譜，“梅花花部性狀的遺傳結構”（The genetic architecture of
全基因組測序是癌癥診斷的強有力工具
? 一位沒有明顯癌癥家族史的婦女卻罹患了早發性乳腺癌和卵巢癌，以及與治療有關的急性髓細胞樣白血病。研究人員對這名婦女進行了全基因組測序，所用的是從該患者的皮膚和骨髓中獲取的DNA。在許多被懷疑患癌癥可能性增加了的病人中，常規性的候選基因測試（如BRCA1??和??BRCA2突變檢測）無法顯示出有用的
全基因組測序解決虎亞種紛爭：6亞種體系
研究人員運用群體基因組學方法描繪了迄今為止最完整的虎演化史，解析了其自然選擇和生態適應性的遺傳基礎，確認了現存虎應劃分為孟加拉虎、馬來虎等6亞種，由此解決了數十年以來關于虎亞種劃分的爭議，奠定了世界虎保護單元策略制定的科學基礎。 虎的物種形成時間大約在2-3百萬年前，群體基因組學分析將現代虎的
近期全基因組測序研究進展一覽
【1】Cell：全基因組測序揭示出自閉癥新的基因變異doi：10.1016/j.cell.2017.08.047自閉癥有遺傳的根源，但是大多數病例并不能夠通過當前的遺傳測試加以解釋。如今，在自閉癥兒童中發現的基因組模式---細胞內完整的一套遺傳指令---揭示這種出這種疾病的一種新的遺傳特征。這種特征
關于全基因組測序的研究結果分析介紹
① 全基因組測序的研究結果— NCI-H209細胞系基因組中，共檢測到22,910個堿基替換、65個插入缺失（Indels）、58個結構變異；在基因組的編碼區，除了發現RB1 和TP53基因發生點突變和MLL2基因由于發生了G>T的顛換，從而產生了pre-stop codon外，有94個點突變直
中國科學家PNAS發布辣椒全基因組測序
辣椒(Capsicum annuum)是一種重要的經濟作物，它在滿足人們口腹之欲的同時，還是世界上廣為使用的藥物。辣椒富含維生素和營養，可以用來生產許多藥物、天然染色劑和化妝品。 為了更好的理解辣椒屬的進化、馴化和特化，四川農業大學玉米研究所、遵義農科院辣椒研究所、華南農業大學園藝學院