科學家構建鷹嘴豆屬超級泛基因組
鷹嘴豆是世界第三大豆類作物,具有重要的經濟價值和營養價值,其固氮能力能改善土壤肥力,具有獨特的生態價值。但鷹嘴豆的遺傳背景相對狹窄、抵抗生物或非生物脅迫的能力不足,限制了它的育種改良。 5月29日,華大生命科學研究院聯合國際半干旱熱帶作物研究中心、西澳大學、莫道克大學等單位的研究成果發表于《自然—遺傳學》。研究團隊成功組裝了8個一年生鷹嘴豆屬野生種的基因組,并結合已發表的2個鷹嘴豆基因組,構建了超級泛基因組,為鷹嘴豆育種提供了重要數據資源和方向。 研究組裝的8個高質量野生種基因組,大小從435兆到895兆不等、基因數從23486到29642不等。研究分析發現可能存在古老的重排事件,且鷹嘴豆屬具有3個重要的基因池,并推斷了基因池之間的分歧時間。 該研究揭示,鷹嘴豆屬超級泛基因組由24827個基因家族組成。其中,14748個基因家族為核心基因,它們存在于鷹嘴豆屬的所有物種,主要參與生長、DNA修復、細胞通信等基本生物功能;......閱讀全文
科學家構建鷹嘴豆屬超級泛基因組
鷹嘴豆是世界第三大豆類作物,具有重要的經濟價值和營養價值,其固氮能力能改善土壤肥力,具有獨特的生態價值。但鷹嘴豆的遺傳背景相對狹窄、抵抗生物或非生物脅迫的能力不足,限制了它的育種改良。5月29日,華大生命科學研究院聯合國際半干旱熱帶作物研究中心、西澳大學、莫道克大學等單位的研究成果發表于《自然—遺傳
科學家構建鷹嘴豆屬超級泛基因組
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科學家繪制鷹嘴豆遺傳變異的完整圖譜
鷹嘴豆是世界上產量第三的豆類作物,全球范圍內有50多個國家將鷹嘴豆作為重要口糧。但是鷹嘴豆相關的基礎研究和育種實踐還相對滯后。近期,包括中國在內的來自11個國家的科學家通過基因組測序技術,繪制了包含3366份樣本信息的鷹嘴豆遺傳變異完整圖譜。研究成果發表在《Nature》期刊,標題為“A chi
科學家繪制鷹嘴豆遺傳變異的完整圖譜
鷹嘴豆是世界上產量第三的豆類作物,全球范圍內有50多個國家將鷹嘴豆作為重要口糧。但是鷹嘴豆相關的基礎研究和育種實踐還相對滯后。近期,包括中國在內的來自11個國家的科學家通過基因組測序技術,繪制了包含3366份樣本信息的鷹嘴豆遺傳變異完整圖譜。研究成果發表在《Nature》期刊,標題為“A chi
科學家完成90個鷹嘴豆基因組測序
1月28日,《自然—生物技術》雜志在線發表了國際鷹嘴豆基因組測序協作組(ICGSC)90個鷹嘴豆基因組測序及分析的成果。該協作組由來自10個國家、23個研究機構的49名科學家組成,深圳華大基因研究院也參與了該項研究。 據了解,鷹嘴豆是全球第二大豆類作物,營養價值高、耐旱性強,主要集中在熱帶
認識泛基因組測序
什么是泛基因組?2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念(pangenome,pan源自希臘語‘παν’,全部的意思),泛基因組即某一物種全部基因的總稱。2009 年,Li等人首次采用新全基因組組裝方法對多個人類個體基因組進行拼接,發現了個體獨有的DNA序列和功能基因,并首次提出了“
人類泛基因組首個草圖發布
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500424.shtm5月10日,《自然》發表了人類泛基因組參考的初稿,這一集合旨在最終代表整個人類物種中盡可能多的DNA序列。該項研究組合的人群遺傳物質來自47個遺傳多樣化個體,為人類基因組提供了更完整的
人類泛基因組首張草圖發布
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/515798.shtm (圖片來源:Gideon MendelCorbis via Getty)5月10日,《自然》雜志發表了人類泛基因組參考的“初稿”,在3篇論文的合集中,人類泛基因組參考聯盟(H
首個棉花泛基因組圖譜助力分子育種
近日,華中農業大學棉花遺傳改良團隊發表了題為“Cotton pan-genome retrieves the lost sequences and genes during domestication and selection”的研究論文,公布了目前為止變異類型最豐富的棉花遺傳變異數據集。文章
全球首個牧草圖形泛基因組發布
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495404.shtm?3月3日,四川農業大學(以下簡稱四川農大)草業科技學院教授黃琳凱團隊在國際權威學術期刊《自然—遺傳學》(Nature Genetics)在線發表了題為《美洲狼尾草泛基因組構建、結構變
《自然》發表首個人類泛基因組草圖
當地時間5月10日,人類泛基因組參考聯盟(Human Pangenome Reference Consortium)發表了首個人類泛基因組草圖。相關的四篇論文均已發布,其中三篇發布在《自然》(Nature)雜志,一篇發布在《自然-生物技術》(Nature Biotechnology)雜志。
我國率先構建野生大豆泛基因組
中國農業科學院作物科學研究所與諾禾致源等合作,在國際上率先構建和分析了一年生野生大豆的泛基因組,為作物種質資源研究和利用提供了新的方法和啟示。該研究成果9月14日在線發表于國際著名學術期刊《自然—生物技術》。 項目牽頭人、中國農科院作科所研究員邱麗娟介紹,大豆是重要的油料和高蛋白糧飼兼用作物。
高質量豌豆參考基因組和泛基因組解析完成
9月22日,中國農業科學院作物科學研究所特色農作物優異種質資源發掘與創新利用創新團隊聯合國內外多家合作單位,成功繪制了中國豌豆基因組高質量精細物理圖譜,構建了栽培和野生豌豆泛基因組,解析了豌豆基因組進化特征、群體遺傳結構,為揭示豌豆起源馴化,以及基因挖掘、種質創新、育種改良提供了寶貴資源及數據支撐。
鷹嘴豆新品種!新疆農業專家選育出高產可機采的鷹嘴豆
畝產374.97公斤,還能機采,新疆農業專家今年成功選育新品種鷹嘴豆——新鷹3號。 7月27日,由新疆農業大學、新疆農業科學院、奇臺縣農業技術推廣中心專家組成的專家組,對新疆農業科學院糧食作物研究所奇臺試驗示范基地三個品種的鷹嘴豆新品種示范田進行現場測產,其中新鷹3號畝產最高,達374.97公
我國科學家首提“人類泛基因組”
人類基因組存在著種群特異甚至個體獨有的DNA序列和功能基因 經過不懈研究和攻關,我國科研人員在人類基因組研究中獲得新的重大進展――發現人類基因組中存在著種群特異甚至個體獨有的DNA序列和功能基因。科研人員還首次提出了“人類泛基因組”的概念。 由深圳華大基因研究院領銜,華南理工大學參與的研
我國牽頭完成高質量豌豆參考基因組和泛基因組解析
9月22日,中國農業科學院作物科學研究所特色農作物優異種質資源發掘與創新利用創新團隊聯合國內外多家合作單位,成功繪制了中國豌豆基因組高質量精細物理圖譜,構建了栽培和野生豌豆泛基因組,解析了豌豆基因組進化特征、群體遺傳結構,為揭示豌豆起源馴化,以及基因挖掘、種質創新、育種改良提供了寶貴資源及數據支
我國完成世界首個番茄超泛基因組構建
4月6日,由新疆農科院加工番茄生物育種創新團隊牽頭,聯合中國農業科學院、新疆大學、新疆農業大學等多家單位,在國際學術期刊《自然·遺傳》在線發表了題為《超泛基因組研究揭示野生和栽培番茄物種基因組和結構變異多樣性》的科研成果。這是新疆農科院首次以第一單位在《自然·遺傳》發表論文。 新疆農科院余慶輝
泛基因組:賦能未來作物育種的基石
?繪圖:黃怡可 泛基因組(Pan-genome)是一個物種內所有基因組信息的總和,它比單一參考基因組涵蓋了更多的遺傳多樣性。 近年來,科學家已經獲得了多個作物的泛基因組。如何利用這些更為全面的基因組信息培育下一代良
泛基因組:賦能未來作物育種的基石
?繪圖:黃怡可 泛基因組(Pan-genome)是一個物種內所有基因組信息的總和,它比單一參考基因組涵蓋了更多的遺傳多樣性。 近年來,科學家已經獲得了多個作物的泛基因組。如何利用這些更為全面的基因組信息培育下一代良
水稻泛基因組研究方面取得突破性進展
近日,廣東省農業科學院水稻研究所分子育種團隊在水稻泛基因組研究方面取得突破性進展。相關研究發表于基因組學研究知名雜志Genome Biology。該論文第一單位為廣東省農業科學院水稻研究所,王健博士為第一作者,楊武副研究員為共同第一作者,胡海飛博士和趙均良副研究員為通訊作者,澳大利亞莫道克大學教
小麥泛基因組研究揭示我國重大品種演替規律
中國農業科學院作物科學研究所小麥基因挖掘與利用創新團隊聯合國內外科研院校,在基因組水平全面展示了20世紀50年代以來中國小麥育種歷史,揭示了不同層次的結構變異對小麥適應性和育種的影響,為全球種質資源的整合和利用,未來小麥智能設計育種提供了重要基因組支撐以及新的視角和策略。相關研究成果以研究長文的形式
“人類泛基因組項目”將極大促進疾病防治
科技日報北京4月21日電 (記者劉霞)一個國際科學家聯盟在20日出版的《自然》雜志上發表論文稱,十多家研究機構正在合作開展“人類泛基因組項目”,該項目旨在創建一個囊括全球各人種遺傳多樣性的參考基因組。研究人員表示,“這是人類遺傳學的未來”,有望應用于疾病預防與治療等多領域。這項工作由美國國家人類基因
首個玉蜀黍屬超級泛基因組助力玉米遺傳改良
?玉蜀黍屬超級泛基因組特征 ? ?受訪者供圖8月24日,《基因組生物學》(Genome Biology)在線發表華中農業大學作物遺傳改良全國重點實驗室和洪山實驗室玉米團隊最新研究成果。該團隊利用721份玉蜀黍屬材料的基因組數據,構建了首個玉蜀黍屬“超級泛基因組(super pan-genome)”圖
我國科研人員揭秘全球首個牧草領域圖形泛基因組
記者3日從四川農業大學獲悉,該校草業科技學院黃琳凱教授團隊構建了全球首個牧草領域圖形泛基因組——美洲狼尾草圖形泛基因組,并揭示了狼尾草耐熱的分子機制。 這一研究成果于北京時間3日以《Pangenomics identifies structural variation associated wi
中國科研人員揭秘全球首個牧草領域圖形泛基因組
記者3日從四川農業大學獲悉,該校草業科技學院黃琳凱教授團隊構建了全球首個牧草領域圖形泛基因組——美洲狼尾草圖形泛基因組,并揭示了狼尾草耐熱的分子機制。 這一研究成果于北京時間3日以《Pangenomics identifies structural variation associated w
版納植物園揭秘鷹嘴豆葉片分子機制
近日,中國科學院西雙版納熱帶植物園熱帶植物資源可持續利用重點實驗室陳江華研究組首次以鷹嘴豆為研究對象,解析了豆科植物中羽狀復葉的小葉原基時空起始模式調控的分子機制。相關研究發表于《自然-通訊》。 葉片是植物最重要的光合作用器官和抗病場所。從形態學上,葉片可以分為單葉和復葉,而最引人注意的就是千
“鷹嘴豆功能因子研究與開發”項目通過驗收
6月5日,新疆維吾爾自治區科技廳組織有關專家對中科院新疆理化技術研究所、中科院植物研究所等單位共同承擔的“鷹嘴豆功能因子研究與開發”項目進行了成果鑒定。 “鷹嘴豆功能因子研究與開發”項目主要以藥食同源植物鷹嘴豆為研究對象,采用超濾膜分離、高速逆流色譜、快速制備色譜等現代分離分
科學家繪就全球首張家蠶超級泛基因組圖譜
家蠶是重要的經濟昆蟲和新興模式生物,10月9日,西南大學發布最新科研成果:家蠶基因組生物學國家重點實驗室團隊完成家蠶大規模種質資源基因組解析,在全球首次繪就家蠶超級泛基因組圖譜,并率先創建“數字家蠶”基因庫,將我國家蠶基因研究推向設計育種階段。對于家蠶基因的研究,之前僅有單一參考基因組及部分重測序數
透過大規模基因組分析推出-泛癌癥圖譜-開啟癌癥治療
【Technews科技新報】美國國立衛生研究院(NIH)資助的研究團隊已經完成了一份詳細的基因組分析,這個被稱為泛癌癥圖譜(PanCancer Atlas)的研究結果收錄了 27 篇論文,并包含了 33 種癌癥、1 萬多個種不同腫瘤分子和臨床訊息的數據資料。 泛癌癥圖譜主要是針對癌癥基因組
我國科學家首次繪制出葡萄屬超級泛基因組圖譜
2月26日,記者從北京大學現代農業研究院獲悉,該院葉文秀研究員和郭立研究員團隊繪制了全球首個涵蓋葡萄屬的歐亞、北美和東亞世界三大種群的72個葡萄種質材料的單倍型超級泛基因組圖譜,從而揭示葡萄屬豐富遺傳多樣性和雜交歷史。相關成果發表在國際期刊《自然·遺傳學》上。葡萄樣品全球地理分布及其果實和葉片形態。