分子克隆技術(質粒DNA和DNA插入片段的制備、連接反應...2
PCR引物決定PCR的特異性,引物的設計就顯得尤為重要。下面以已知DNA序列設計引物為例介紹設計引物應考慮的幾個方面:1、GC比值:眾所周知,堿基對中的GC之間有三條氫鍵,AT之間有兩條氫鍵,GC和AT在引物序列中的合理比例是設定PCR中退火溫度的重要依據。通常在一個引物中GC和AT各半即可。2、長度:通常15-20bp即可。由于目的不同,有時引物長些,但太短會影響引物的特異性。3、方向:設計出的引物永遠是5'-3'方向,所以正向引物是與一股模板DNA序列相一致的,而反向引物則與這股模板DNA序列相互補。4、酶切位點:如果想克隆所放大的DNA片段,通常在引物的5'端設計適當的限制性酶切位點,使進一步的克隆工作更容易。一對引物可用一種或兩種酶切位點,這取決于設計者,兩種不同的酶切位點使克隆具有方向性。5、啟始和終止密碼:如果想表達所放大的DNA片段,所用的克隆載體又不含啟始密碼和終止密碼,應將其設計在引物的......閱讀全文
分子克隆技術(質粒DNA和DNA插入片段的制備、連接反應...2
PCR引物決定PCR的特異性,引物的設計就顯得尤為重要。下面以已知DNA序列設計引物為例介紹設計引物應考慮的幾個方面:1、GC比值:眾所周知,堿基對中的GC之間有三條氫鍵,AT之間有兩條氫鍵,GC和AT在引物序列中的合理比例是設定PCR中退火溫度的重要依據。通常在一個引物中GC和AT各半即可。2、長
分子克隆技術(質粒DNA和DNA插入片段的制備、連接反應...1
克隆(Clone)是指通過無性繁殖過程所產生的與親代完全相同的子代群體。分子克隆(Molecular Cloning)是指由一個祖先分子復制生成的和祖先分子完全相同的分子群,發生在基因水平上的分子克隆稱基因克隆(DNA克隆)。其基本原理是:將編碼某一多肽或蛋白質的基因(外源基因)組裝到細菌質粒(
外源DNA和質粒載體的連接反應
外源DNA片段和線狀質粒載體的連接,也就是在雙鏈DNA5'磷酸和相鄰的3'羥基之間 形成的新的共價鏈。如質粒載體的兩條鏈都帶5'磷酸,可生成4個新的磷酸二酯鏈。但如果質粒DNA已去磷酸化,則吸能形成2個新的磷酸二酯鏈。在這種情況下產生的兩個雜交體分子帶有2個單鏈切口,當雜本導
外源DNA和質粒載體的連接反應
外源DNA片段和線狀質粒載體的連接,也就是在雙鏈DNA5'磷酸和相鄰的3'羥基之間 形成的新的共價鏈。如質粒載體的兩條鏈都帶5'磷酸,可生成4個新的磷酸二酯鏈。但如果質粒DNA已去磷酸化,則吸能形成2個新的磷酸二酯鏈。在這種情況下產生的兩個雜交體分子帶有2個單鏈切口,當雜本導
質粒載體和外源DNA的連接反應
實驗概要掌握DNA體外連接的基本技能,了解連接反應的注意事項。實驗原理DNA片段之間的連接是通過DNA連接酶的催化實現的。DNA連接酶催化具有平末端或互補粘性末端的DNA片段間相鄰堿基通過3’,5’磷酸二酯鍵連接起來,該反為需能反應,通常需要加入ATP或NADH,DNA連接酶對粘性末端的連接效率要遠
質粒載體和外源DNA的連接反應
實驗原理DNA片段之間的連接是通過DNA連接酶的催化實現的。DNA連接酶催化具有平末端或互補粘性末端的DNA片段間相鄰堿基通過3’,5’磷酸二酯鍵連接起來,該反為需能反應,通常需要加入ATP或NADH,DNA連接酶對粘性末端的連接效率要遠高于對平末端的連接效率。在基因基因工程實驗中,最常用的來源于T
分子克隆化DNA片段的制備介紹
常用以下方法獲得DNA片段: ①用限制性核酸內切酶將高分子量DNA切成一定大小的DNA片段; ②用物理方法(如超聲波)取得DNA隨機片段; ③在已知蛋白質的氨基酸順序情況下,用人工方法合成對應的基因片段; ④從mRNA反轉錄產生cDNA。
質粒DNA的制備和純化
實驗概要質粒(plasmid)是一種染色體外的穩定遺傳因子,大小從1~200kb不等,為雙鏈、閉環的DNA分子,并以超螺旋狀態存在于宿主細胞中。質粒主要發現于細菌、放線菌和真菌細胞中,它具有自主復制和轉錄能力,能在子代細胞中保持恒定的拷貝數,并表達所攜帶的遺傳信息。質粒在細胞內的復制一般有兩種類型:
外源DNA和質粒載體的連接反應原理及實驗步驟2
10xT4噬菌體DNA連接酶緩沖液200mmol/L同Tris.Cl(pH7.6)50mmol/K MgCl250mmol/L二硫蘇糖醇500μg/ml 牛血清白蛋白(組分V.Sigma產品)(可用可不用)該緩訓液應分裝成小份,貯存于-20℃。另外,再設立兩個對照反應,其中含有(1)只有質粒載體;(
DNA片段的制備方法
常用以下方法獲得DNA片段:①用限制性核酸內切酶將高分子量DNA切成一定大小的DNA片段;②用物理方法(如超聲波)取得DNA隨機片段;③在已知蛋白質的氨基酸順序情況下,用人工方法合成對應的基因片段;④從mRNA反轉錄產生cDNA。
怎么通過反向pcr技術在質粒中插入一個dna片段
怎么通過反向pcr技術在質粒中插入一個dna片段質粒在你插入的片段上游是有啟動子區域的,在插入的時候有時由于是單酶切或者TA克隆或者平末端克隆,你是無法確定基因插入的方向的.如果你插入序列的ATG起始密碼子是跟在啟動子后面,你就是正向插入,如果你插入序列的終止密碼子是在啟動子后面,那你就是反向插入了
將大片段插入-DNA-導入哺乳動物細胞和胚胎實驗2
基本方案2 將細菌人工染色體(BAC或PAC)引入到哺乳動物細胞和小鼠胚胎中實驗材料純化的 BAC DNA試劑、試劑盒RNase A原核的注射緩沖液透析緩沖液I乙醇小鼠胚胎哺乳動物細胞滅菌素儀器、耗材含有合適的抗生素的LB培養基Qiagen Midi-prep 試劑盒培養箱高速離心機高速離心管玻璃離
質粒DNA的制備方法
有多種分離質粒的方法,如堿裂解法、煮沸裂解法、層析柱過濾法等。
質粒DNA的大量制備
實驗概要本方法用于從細菌中提純大量質粒DNA。主要試劑1. STE 0.1mol/L NaCl 10mmol/L Tris.Cl(pH8.0) 1mmol/L EDTA(pH8.0) 2. 溶液I 50mmol/L葡萄糖 25mmol/L Tris.Cl(pH8.0) 10mmol/L EDTA(
質粒DNA的小量制備
實驗概要本方法用于從細菌中制備提純少量質粒DNA。主要試劑1. 溶液I 50mmol/L葡萄糖 25mmol/L Tris.Cl(pH8.0) 10mmol/LEDTA(pH8.0) 溶液I可成批配制,每瓶約100ml,在6.895×104Pa高壓下蒸氣滅菌15分鐘,貯存于4℃。2. 溶液Ⅱ 0.2
質粒DNA大量制備實驗
堿裂解法 平衡離心法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 這一方案科能是最常用的質粒制備方法,該法不僅相當決捷可靠,而且可獲得相當純凈的粗制DNA。
質粒DNA大量制備實驗
實驗方法原理?這一方案科能是最常用的質粒制備方法,該法不僅相當決捷可靠,而且可獲得相當純凈的粗制DNA。實驗材料?大腸桿菌試劑、試劑盒?葡萄糖TrisEDTATENaOHSDS異丙醇乙醇乙酸甲儀器、耗材?離心機漩渦混合器水浴鍋實驗步驟?1.? 往2 ml 燒瓶中加入500 ml ,含有適當抗生素的L
IL2質粒DNA探針制備的操作步驟
實驗概要本實驗介紹了IL-2質粒DNA探針制備的詳細步驟。實驗步驟1. 含IL-2質粒DNA探針的提取?? 1) 取含IL-2質粒DNA的單個菌落置兩個25ml LB培養基(含100μg/ml Amp),37℃ 220r/min 振搖過液(約16h );?? 2) 取10ml菌液加200ml LB培
質粒DNA的大量制備實驗
實驗方法原理 大量堿裂解方法不僅相當快捷可靠,而且可獲得相當純凈的粗制DNA。煮沸法的大量制備也簡單易行,但得到的DNA比較粗制。高純度的質粒DNA可通過氯化銫/溴化乙錠平衡離心法或層析法進一步純化粗制DNA得到。實驗材料 培養基菌株試劑、試劑盒 EDTASDS乙醇乙酸鉀異丙醇儀器、耗材 離心管實驗
質粒DNA的小量制備實驗
實驗方法原理 當菌體在NaOH和 SDS溶液中裂解時,蛋白質與DNA發生變性,當加入中和液后,質粒DNA分子能夠迅速復性,呈溶解狀態,離心時留在上清中;蛋白質與染色體DNA不變性而呈絮狀,離心時可沉淀下來。堿裂解法是最常用的小量制備質粒DNA的方法。實驗材料 細菌克隆試劑、試劑盒 LB培養基抗生素葡
質粒DNA的小量制備實驗——
實驗采用國產的質粒小量抽提試劑盒。它是一種新型的離子交換柱,在特定的條件下,使質粒能在離心過柱的瞬間,結合到質粒純化柱上,在一定條件下又能將質粒充分洗脫,從而實現質粒的快速純化。實驗材料DNA試劑、試劑盒LB培養基卵清溶菌酶異丙醇TE儀器、耗材離心機漩渦混合器水浴鍋實驗步驟一、實驗步驟1. ?接種一
質粒DNA的小量制備實驗
堿裂解小量制備法 煮沸法 ? ? ? ? ? ? 實驗材料 DNA 試劑、試劑盒
質粒DNA的小量制備實驗
實驗方法原理 堿裂解法是最常用的小量制備質粒DNA的方法。實驗材料 培養基試劑、試劑盒 EDTASDS乙醇VTE儀器、耗材 平板實驗步驟 1. ?接種一個單菌落于5 ml無菌LB培養液中,在37°C培養至飽和狀態(過夜)。2. ?取1.5 ml培養液以最大轉速離心20 S。棄上清。3. ?沉淀用10
質粒DNA的大量制備實驗
堿裂解法 氯化銫/溴化乙錠平衡離心法 層析法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 大量堿裂解方法不僅相當快捷可靠,而且可獲得相當純凈的粗制DNA。煮沸法的大量制
細菌質粒-DNA-的小量制備
實驗方法原理 由于大腸桿菌染色體 DNA 比通常用作載體的質粒 DNA 分子大得多,因此在提取過程中,染色體 DNA 易斷裂成線型 DNA 分子,而大多數質粒 DNA 則是共價閉環型,根據這一差異便可以設計出各種分離、提純質粒 DNA 的方法。堿裂解法就是基于線型的大分子染色體 DNA 與小
DNA連接反應
(一)外源DNA和質粒載體的連接反應 外源DNA片段和線狀質粒載體的連接,也就是在雙鏈DNA5'磷酸和相鄰的3'羥基之間 形成的新的共價鏈。如質粒載體的兩條鏈都帶5'磷酸,可生成4個新的磷酸二酯鏈。但如果質粒DNA已去磷酸化,則吸能形成2個新的磷酸二酯鏈。在這種情況下產生的
NaCl離心法去除質粒DNA制備物中的小片段核酸實
實驗方法原理?常規的質粒 DNA 制備物中都會不同程度地污染有來自宿主菌基因組或質粒斷裂碎片的小分子 DNA 或 RNA。盡管它們的分子質量不大,但數量多,會對制備物中 DNA 片段 3' 和 5' 端的總量產生明顯影響。試劑、試劑盒?乙醇NaCl乙酸鈉TE胰 RNase儀器、耗材?
NaCl離心法去除質粒DNA制備物中的小片段核酸實驗
常規的質粒 DNA 制備物中都會不同程度地污染有來自宿主菌基因組或質粒斷裂碎片的小分子 DNA 或 RNA。盡管它們的分子質量不大,但數量多,會對制備物中 DNA 片段 3' 和 5' 端的總量產生明顯影響。本實驗來源「分子克隆實驗指南第三版」黃培堂等譯。實驗方法原理常規的質粒 DN
NaCl離心法去除質粒DNA制備物中的小片段核酸實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 常規的質粒 DNA 制備物中都會不同程度地污染有來自宿主菌基因組或質粒斷裂碎片的小分子 DNA 或 RNA。盡管它們的分子質量不大,但數量多,會對制備物中 DNA 片段 3' 和 5' 端的總量產生明顯影響。
小量制備質粒DNA(強堿法)
實驗概要本文介紹了強堿法小量制備質粒DNA的原理及操作流程。有助于了解基因工程操作中運載基因的載體,掌握最常用的提取質粒DNA的方法。實驗原理堿變性抽提質粒DNA是基于染色體DNA的變性與復性的差異而達到分離的目的。利用溶菌酶、強堿(NaOH)及表面活性劑(SDS)使細胞破壁、膜,釋放出胞內染色體D