重磅！科學家完成對66種癌癥類型中2.8萬份腫瘤樣本分析
近日，一項刊登在國際雜志Nature Reviews Cancer上題為“A compendium of mutational cancer driver genes”的研究報告中，來自巴塞羅那生物醫學研究所等機構的科學家們通過對來自66種癌癥類型的2.8萬份腫瘤樣本的基因組進行分析識別出了568個癌癥驅動基因；相關研究結果或能更新當前整合癌癥基因組平臺（IntOGen平臺）的數據，并有望幫助科學家們發現突變的癌癥驅動基因。 研究者表示，本文研究結果提供了迄今為止最完整的癌癥驅動基因圖譜，癌癥是一類特殊的疾病，其主要特點表現為因突變導致的失控的細胞生長以及細胞中基因組發生的其它突變，腫瘤可以展現出數百種乃至數千種基因突變，但僅有一部分突變對于腫瘤發生的能力至關重要，這些關鍵的突變會影響癌癥驅動基因的功能，而尋找攜帶癌癥驅動突變的基因就是當前癌癥研究領域科學家們的主要目標。 圖片來源：Institute for Resea......閱讀全文
Nature對兒童癌癥基因組分析，有望實現兒童癌癥精準治療
在一項新的研究中，來自美國圣猶大兒童研究醫院等研究機構的研究人員證實患有癌癥的兒童和成年人通常具有不同的發生突變的基因來促進疾病產生，這提示著這些患者可能受益于不同的療法。這一發現強調了對兒童癌癥進行精準醫療的必要性。相關研究結果于2018年2月28日在線發表在Nature期刊上，論文標題為“P
Nature：癌癥基因組分析的新浪潮
肺癌與乳腺癌不一樣，與胰腺癌也不一樣，然而根據發表在《自然遺傳學》(Nature Genetics)的兩項最新研究表明在分子水平上它們具有許多相同之處。同日，Nature網站對這一研究成果進行了即時新聞報道 這項“泛癌癥”研究針對12種不同類型的腫瘤3000多個基因組進行了分析，
大型研究為癌癥基因組分析奠定基礎
12月9日，國際癌癥基因組協會（ICGC）在著名的《Nature Communications》雜志，發表了一篇令人瞠目的文章，它為即將到來的癌癥基因組學研究時代，奠定了基礎。該項目，是由Centro Nacional de Analisis Genómico (CNAG-CRG)和German
Nature：癌癥基因組分析的新浪潮
肺癌與乳腺癌不一樣，與胰腺癌也不一樣，然而根據發表在《自然遺傳學》(Nature Genetics)的兩項最新研究表明在分子水平上它們具有許多相同之處。同日，Nature網站對這一研究成果進行了即時新聞報道 這項“泛癌癥”研究針對12種不同類型的腫瘤3000多個基因組進行了分析，尋找跨
透過大規模基因組分析推出－泛癌癥圖譜－開啟癌癥治療
【Technews科技新報】美國國立衛生研究院（NIH）資助的研究團隊已經完成了一份詳細的基因組分析，這個被稱為泛癌癥圖譜（PanCancer Atlas）的研究結果收錄了 27 篇論文，并包含了 33 種癌癥、1 萬多個種不同腫瘤分子和臨床訊息的數據資料。 泛癌癥圖譜主要是針對癌癥基因組
《Cell》：如何根據癌癥基因組圖譜分析腫瘤
時至今日，這一計劃已經取得了許多成果，最新Cell雜志公布了泛癌癥圖譜（Pan-Cancer Atlas），這也是癌癥基因組圖譜（TCGA）的收官項目，同期Cell雜志介紹了根據癌癥基因組圖譜分類的腫瘤類型列表，以及相關的一些主要發現（每種腫瘤類型的標記論文）。 生物通報道：2005年美國國立
國際癌癥基因組聯盟公布逾1萬個癌癥基因組數據
國際癌癥基因組聯盟(International Cancer Genome Consortium，簡稱"ICGC")近日向科研界公布了超過1萬個癌癥基因組的數據。這些數據能更好地幫助全世界的癌癥研究者從基因方面了解癌癥，加快對癌癥的研究并幫助更多癌癥靶向治療的發展。 安大略癌癥研究所所
Cell年度綜述：癌癥基因組入選
Cell雜志創刊于1976年，現已成為世界自然科學研究領域最著名的期刊之一，并陸續發行了十幾種姊妹刊，在各自專業領域里均占據著舉足輕重的地位。近期Cell雜志盤點了2013年度最佳綜述及最佳論文，其中熱門技術CRISPR也登上了榜單，相關論文描述了利用基因調控系統 CRISPR/Cas，一步
Science專題：癌癥基因組學
在2001年完成人類基因組測序后，許多的研究人員立即將目光放到了利用這些信息來更好地了解遺傳學上。最近，越來越多的研究確定了表觀遺傳學在癌癥的發生、形成及發展過程中起效應。從鑒別與遺傳性癌癥相關的單基因變異的前基因組時代轉向，測序技術的進步使得研究人員能夠利用全基因組方法來檢測基因組間的差異，以
Nature公布800個癌癥基因組
來自癌癥基因組計劃的科學家們近期報告了他們最新的癌癥基因組研究成果，他們公布了800個乳腺癌的遺傳特征，包括發現了導致乳腺癌最常見的形式的遺傳原因，為新的治療靶點提供線索，并確定乳腺癌和卵巢癌一種亞型之間的分子遺傳相似性。 這項研究結果有助于更全面的了解每種乳腺癌亞型背后的分子機制，相關成
1300多名學者合作－迄今最全面癌癥基因組分析完成
英國韋爾科姆基金會桑格研究所5日宣布，一個國際團隊完成了迄今覆蓋面最廣泛的癌癥全基因組分析，這有助于加深研究人員對癌癥的認識，為開發出更高效的治療方案鋪平道路。這個被稱為“泛癌癥計劃”的項目由來自37個國家的1300多名科學家合作開展，旨在研究可導致癌癥的變異基因，繪制出這些基因的全圖譜，桑格
癌癥基因組——癌癥研究和云計算的里程碑
圖片來源：https://www.nature.com/articles/d41586-020-00308-w 2001年，人類基因組計劃完成，整個計劃花費約30億美元，1985年提出，1990年正式啟動，歷經十余年。腫瘤是最熱門的研究領域之一，該領域的研究者們一直希望可以借助測序手段去表征腫瘤的
上海交大教授通過7000個癌癥基因組分析找到全新靶標
來自上海交通大學醫學院，德州大學健康科學中心等處的研究人員解析了33類腫瘤的7000例臨床病人基因組，將識別的47,000多個突變數據映射至已發現的蛋白結構上，用以尋找各類型腫瘤全新靶標，并找到了非小細胞肺癌的全新靶標PDE10A。這一研究成果公布在AJHG雜志上，文章的通訊作者分別是上海交通大學醫
上海交大教授通過7000個癌癥基因組分析找到全新靶標
生物通報道：來自上海交通大學醫學院，德州大學健康科學中心等處的研究人員解析了33類腫瘤的7000例臨床病人基因組，將識別的47,000多個突變數據映射至已發現的蛋白結構上，用以尋找各類型腫瘤全新靶標，并找到了非小細胞肺癌的全新靶標PDE10A。 這一研究成果公布在AJHG雜志上，文章的通訊作者
Nature－Genetics公布又一大規模癌癥基因組分析結果
超過20個研究機構的63位研究人員公布了一項包括30,000多人血液樣本的大規模研究成果，通過這項分析，研究人員確定了13種膠質瘤新遺傳危險因素，這揭示了增加膠質瘤易感性的個體DNA的特殊差異，同時也首次為臨床醫師提供了一種能區分成膠質細胞瘤和非膠質母細胞瘤等膠質瘤類型的新方法。 這一研究成果
Cell：癌癥基因組計劃再取重要成果
來自德克薩斯大學MD安德森癌癥中心的研究人員稱，他們將最致命的皮膚癌類型——黑色素瘤分為了4個不同的基因亞型，這一研究發現有可能會在尋求個體化醫療領域體現它的價值。這項研究是癌癥基因組圖譜計劃（TCGA）的一個組成部分，研究人員將他們的成果發布在6月18日的《細胞》（Cell）雜志上。 研究人
Cell新文章：癌癥全基因組測序
根據華盛頓大學醫學院的一項新研究，具有吸煙史的肺癌患者相比于不吸煙的肺癌患者腫瘤中的遺傳突變要多10倍。這一研究在線發表在9月13日的《細胞》(Cell)雜志上。 論文的資深作者、華盛頓大學基因組研究所主任Richard K. Wilson 說：“吸煙者基因組具有比不吸煙的肺癌患者基因
Nature新聞：讀取癌癥的基因組藍圖
在過去的10年里，人類基因組測序從劃時代的科學成果進入到了商業化的階段。新一代的測序(NGS)設備結合強有力的生物信息學使得研究人員常規概覽各種腫瘤類型扭曲及受損的基因組圖譜成為可能。相應地，公司、臨床研究團體和學術中心正競相將來自癌癥基因組學不斷增長的數據轉變為一些靶向性的、患者特異性的治療策
Nature：99個癌癥基因組全面解析
近日來自美國、澳大利亞、加拿大的研究人員組成的一個國際研究小組報告了一項大規模胰腺癌基因組分析研究的結果，揭示了導致這一癌癥潛在突變的復雜性，發現了與之相關的兩條新信號途徑。這些信息將推動開發出胰腺癌的新早期診斷測試。相關論文在線發表在10月24日的《自然》(Nature)雜志上。 貝勒醫
癌癥基因組項目(TCGA)完成之反思
經過美國不懈的努力，涉及上萬個癌基因的癌基因組項目正式告一段落。該項目在2006年開始，預計花費1億美元進行研究，并且癌癥基因組圖譜（TCGA）現在已經成為國際癌癥基因組協會最大的組成部分，該項目匯聚了來自16個國家的科學家，并發現了接近10萬個與癌癥相關的基因突變。 現在的問題是，下一步怎么
PNAS：探查癌癥基因組ncRNA“暗物質”
來自西奈山Icahn醫學院的研究人員在癌細胞中發現了一組可以激發免疫反應的非編碼RNA分子，它們具有與病原體相似的一些特征。由于這些分子在癌癥中表達并擴增，它們造成的免疫反應有可能影響了癌癥的生長。這項研究發布在《美國國家科學院院刊》（PNAS）上。 研究人員是通過探查基因組“暗物質”組成部分
《Nature－Genetics》：癌癥的基因組結構研究
癌癥的基因組結構研究發表《Nature Genetics》 B細胞通過一系列精心控制的染色體重排和“良好”突變產生抗體，這些突變使細胞能夠產生大量不同的抗體。“盡管變化對產生大量多樣的抗體至關重要，但仍有可能發生‘壞’突變并導致B細胞源性癌癥，”研究負責人、哥倫比亞大學內科醫師和外科醫生學院微
基因組學:－跨越癌癥研究國界
1982年11月，在尼日利亞海軍醫院外足球場上踢球的一名軍官，突然摔倒死亡。這名男子被帶到急診室時，當時還是一個新人的 Olufunmilayo Funmi Olopade醫生正在值班。“我們搞不明白為什么他死亡，這讓我感到震驚，從那時開始我意識到，我需要做更多的工作來理解和幫助人們。”Ol
證實基因組測序成功鑒定癌癥相關突變
最近，UT西南醫學中心的癌癥研究人員表明，全基因組測序可以用來確定患者遺傳性癌癥的風險，這可能會促進癌癥的預防、診斷和護理。 這項研究首次采用全基因組測序來評估258名癌癥患者的基因組，以提高癌癥誘發突變的診斷能力。相關研究結果發表在12月份的國際期刊《EBioMedicine》。 UT西南
大象為啥不生癌癥？秘密在基因組里
今年的諾貝爾化學獎讓我們對DNA損傷修復的研究有了一些認識，知道DNA損傷非常容易發生，但是生物進化獲得了能修復這些損傷的系統。盡管如此，在多細胞生物大量DNA損傷和修復過程中，仍然無法完全避免出現DNA發生突變的后果，這些突變大多數情況下容易帶來腫瘤等惡劣后果。 如果所有細胞都存在類似的DN
數字PCR技術精確檢測癌癥基因組擴增
來自斯坦福大學以及Bio-Rad的研究人員證實，數字PCR系統能夠精確測定長期存放的癌組織樣本中的癌癥基因組擴增。該研究成果發表在《Translational Medicine》雜志上。 某些拷貝數變異(如基因組擴增)可能導致特定癌基因的過表達，推動癌癥發展。靶定擴增的癌基因有望實現癌
大規模癌癥基因組研究發表《Nature》文章
髓母細胞瘤是兒童最常見的惡性腦瘤。大多數患者年齡在16歲以下。主要有4個亞組：Wnt、Sonic Hedgehog (SHH)、3組和4組。這些亞群由不同基因變化驅動，起始于不同細胞，常常表現出不同臨床狀況。Wnt組中，約95%患者可以成為長期存活者，3組患者只有50%。目前，尚無針對3組和4組
Nature：全基因組測序重新定義癌癥之王基因組突變藍圖
近日，一項發表于國際著名雜志Nature上的研究論文中，來自英國和澳大利亞的研究人員對100位胰腺癌患者癌癥組織的基因組進行了深入分析，結果發現了4種不同的亞型，這或許可以幫助后期開發治療胰腺癌患者的新型療法。文章中研究人員利用全基因組測序技術揭示了腫瘤基因組結構性改變的光譜模式，該技術可以幫助
Science：癌癥基因組中的突變“熱點”不一定會推動癌癥
Science一篇文章描述了DNA單鏈如何以所謂的"發夾"結構折疊起來，對許多癌癥中表達的基因編輯酶的突變高度敏感。但是，這些突變"熱點"中的許多發生在與癌癥完全無關的基因中，包括基因組的許多非編碼區域。圖片來源：Science MGH癌癥中心的Dr.Michael Lawrence說："一個
癌癥研究人員聯手匯集腫瘤基因組數據
研究人員希望，數據分享將為利用諸如這些腦部腺癌細胞等腫瘤的基因組信息帶來更好的方法。 這是為大型癌癥研究中心的很多病人提供的最新希望：“讓我們測序你的腫瘤，或許我們能將其同擊敗這種惡性疾病的藥物匹配。”不過，現實是基因組分析仍然僅為癌癥病人提供了一小部分幫助。“我們多半時候不知道如何處理這些