做realtimePCR之前，你應該如何著手設計引物
正在著手做 real-time PCR 的朋友們，我想最開始肯定要考慮引物設計的問題。看完下面的文字，我保證你得到想要的引物設計方法和引物序列。第一步：拿到你所要研究的基因的序列。不要告訴我你不會找序列。如果真的不會，請參考丁香園內其他版塊，如NCBI使用，序列查找等。第二步：確定你想用哪種方法。Taqman Probe 還是 SYBR 染料？兩種方法各有利弊，這里不贅述，不明白的依然參見其他版塊。但需要指出的是，后者在國內更常用，因為比較簡單，容易操作，容易分析。建議初學者選擇。第三步：動手設計引物1）兩種引物設計軟件。在設計 real-time PCR 引物時，常用的有非常 NB 的 primer premier 5.0 和 primer express 3.0 (升級版有5.0)。前者可以應用與常規PCR和real-time PCR；后者是ABI公司的real-time PCR儀器配套的引物設計軟件，專......閱讀全文
做－realtime－PCR之前，你應該如何著手設計引物
正在著手做 real-time?PCR?的朋友們，我想最開始肯定要考慮引物設計的問題。看完下面的文字，我保證你得到想要的引物設計方法和引物序列。第一步：拿到你所要研究的基因的序列。不要告訴我你不會找序列。如果真的不會，請參考丁香園內其他版塊，如NCBI使用，序列查找等。第二步：確定你想用哪種方法。T
Realtime－PCR
實驗概要The ?exponential amplification via reverse transcription polymerase chain ?reaction provides for a highly sensitive technique in which a very low
RealTime－or－Kinetic－PCR
The DNA Facility houses the “real-time” or kinetic PCR instrument, the Applied Biosystems Model 7700 sequence detection system (the TaqMan instrument)
RealTime－PCR實驗流程
實驗試劑Total RNA Kit ：Omega：(Cat.No．R6834)First Strand cDNA Synthesis Kit：GeneCopoeia(Cat.No．C0210A)2xAllinOneTMQ-PCRMix：GeneCopoeia（cat.No．D0101A)Primer
Realtime－PCR－基礎知識
理論基礎?聚合酶鏈式反應作為一種革命性的方法在生物學研究的歷史中占據了重要的地位。以此為基礎發展出包括real-time PCR在內的多項應用技術。自誕生后real-time PCR技術持續發展，從簡單的增擴到整個PCR過程，real-time PCR表現出比PCR更敏感、更明確的定量分析特
realtime－PCR－數據分析
無論所使用的real-time PCR是何種型號，正確的數據分析對于獲得有效的實驗結果都是至關重要的。這里介紹有關real-time PCR數據分析的知識。?在討論基本分析過程之前，先介紹如何設計一個好的實驗。如果你是自己設計的引物和探針，那有助于下一步的工作。但是在有些情況下，人們使用出版文獻上的
realtime－PCR體系的優化
實時定量PCR以其精確、快速、方便，越來越多的應用在科研、臨床及檢驗檢疫的各個領域。但是定量PCR是對精確性要求很高的實驗，實驗的條件對實驗結果的影響非常大。在此談談體系優化的問題，希望對做相關試驗研究的朋友有所幫助。1、基本參數的優化：1）MgCl2的濃度：在PCR反應中，MgCl2的濃度對酶的活
REALTIME－PCR－WITH－SYBR－GREEN－I－PROTOCOL
1、反應體系 25ulCocktail 20 ul: Primer FP 1 ul + Primer RP 1u + 2 * SYBR GREEN I MIX 12.5 + H2O 5.5 ul cDNA 5 ul2、Primer 濃度，需要摸索，從200nM到700nm等，設置不同濃度。3、每個引
realtime－PCR－常用儀器和探針
?1.SYBR Green I：一種DNA結合染料，能非特異性地與雙鏈DNA結合，結合后發出熒光，價格便宜，但因無特異性，易受到非特異性擴增和引物二聚體地的影響，是定量結果不可靠。可用融解曲線分析區分特異性和非特異性擴增，引物的設計和反應條件的優化對消除非特異性熒光有很大幫助。2.Taqman探針：
實時定量PCR（Realtime－quantitative－PCR）
mRNA表達的研究 微小殘留病變的檢測 腫瘤耐藥基因表達的研究 病毒感染的定量監測Vs普通PCR，RT-PCR的優勢 采用封閉的檢測模式，因此擴增產物導致污染的可能性比普通PCR要小得多 。 擴增產物的檢測在PCR擴增過程中同時進行，并且數據的采集、分析全部由 儀器 自動完成，因此整個檢測所 需的時
realtime－PCR－常用儀器和探針
SYBR Green I：一種DNA結合染料，能非特異性地與雙鏈DNA結合，結合后發出熒光，價格便宜，但因無特異性，易受到非特異性擴增和引物二聚體地的影響，是定量結果不可靠。可用融解曲線分析區分特異性和非特異性擴增，引物的設計和反應條件的優化對消除非特異性熒光有很大幫助。 2.Taqman探針：
Realtime－PCR實驗注意事項
實驗中的一些好習慣加入試劑之前,把它混勻一下,以免放置時間長了濃度不均移液槍用完之后要歸到最大計量的位置，防止久而久之彈簧失去彈性一定要記著關水浴箱，切記切記多和大家討論，同時多關注別人討論的經驗，這幾乎是最快提高的捷徑了所有的試劑都自己配，出了問題才好找原因防止RNA酶污染的措施1. 所有的玻璃器
Realtime－PCR實驗注意事項
Real-time PCR實驗注意事項實驗中的一些好習慣加入試劑之前,把它混勻一下,以免放置時間長了濃度不均移液槍用完之后要歸到zui大計量的位置，防止久而久之彈簧失去彈性一定要記著關水浴箱，切記切記多和大家討論，同時多關注別人討論的經驗，這幾乎是zui快提高的捷徑了所有的試劑都自己配，出了問題才好
RTPCR、QPCR、Realtime－PCR、realtime－RTPCR你真的區分的開嗎？
多少同學能將 RT-PCR、Realtime-PCR、QPCR區分開？有多少同學還在犯暈？今兒這貼，師兄就帶你區分區分，撥開那扇 PCR 迷霧。什么是?RT-PCR？RT-PCR就是逆轉錄 PCR（reverse transcription PCR）或者稱反轉錄PCR(reverse transcr
realtime/qPCR－常遇到的那些疑問
通常來講，real-time PCR（ qPCR）的反應程序不需要像常規的 PCR 那樣，要變性、退火、延伸 3 步。由于其產物長度在 80～150 bp 之間，所以只需要變性和退火就可以了。 SYBR@Green 等染料法，好在 PCR 擴增程序結束后，加一個溶解程序，來形成溶解曲
realtime－PCR技術的原理及應用
一、實時熒光定量PCR原理（一）定義：在PCR反應體系中加入熒光基團，利用熒光信號累積實時監測整個PCR進程，最后通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法 。（二）實時原理1、常規PCR技術：對PCR擴增反應的終點產物進行定量和定性分析無法對起始模板準確定量，無法對擴增反應實時檢測。2、實時定量PC
Realtime－PCR－數據導出－——－ABI儀器篇
1. Real-time PCR數據：Real-time PCR完成后，所有數據并非可以直接導出，由于每一次實驗的情況都不相同，儀器的很多默認設定都會對最終數據結果造成重大偏差，所以在完成PCR過程后，需要人為對實驗結果進行條件設置，才能提取到科學有效的實驗結果，進而完成對實驗結果的分析和判斷。
realtime－PCR中內參基因的CT值
這個要看你在做PCR前的加樣量是否一致。如果加樣量是一致的，而內參做出來差別大（比如3-4個CT值）那說明你的實驗體系有嚴重的問題。理論上加入的DNA量一樣多，內參的CT值應該都一樣。如果你能肯定加樣量是一致的，那說明你的樣本要么降解了，要么就是你的實驗處理對內參的量產生了影響，必須換一個基因做內參
realtime－PCR中內參基因的CT值
這個要看你在做PCR前的加樣量是否一致。如果加樣量是一致的，而內參做出來差別大（比如3-4個CT值）那說明你的實驗體系有嚴重的問題。理論上加入的DNA量一樣多，內參的CT值應該都一樣。如果你能肯定加樣量是一致的，那說明你的樣本要么降解了，要么就是你的實驗處理對內參的量產生了影響，必須換一個基因做內參
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realtime－PCR負對照有信號問題分析
引物設計不夠優化：應避免引物二聚體和發夾結構的出現。 引物濃度不佳：適當降低引物的濃度，并注意上下游引物的濃度配比。 鎂離子濃度過高：適當降低鎂離子濃度，或選擇更合適的 mix 試劑盒。 模板有基因組的污染：RNA?提取過程中避免基因組?DNA?的引入，或通過引物設計避免非特異擴增。
Realtime－PCR實驗心得和RNA提取心得
并不是所有的實驗都可以做real－time的，技術路線要選好當你的基因表達量少或有些不表達具體就是做普通pcr跑膠條帶比較弱，不是很亮的情況下個人覺得最好不要選擇real，不容易做好，特別是融解曲線用sbgr green染料做的話，引物設計時擴增片斷最好小于250bp，太長了不好擴預實驗先rt－pc
realtime－PCR中內參基因的CT值
這個要看你在做PCR前的加樣量是否一致。如果加樣量是一致的，而內參做出來差別大（比如3-4個CT值）那說明你的實驗體系有嚴重的問題。理論上加入的DNA量一樣多，內參的CT值應該都一樣。如果你能肯定加樣量是一致的，那說明你的樣本要么降解了，要么就是你的實驗處理對內參的量產生了影響，必須換一個基因做內參
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Realtime－PCR與RTPCR的區別
實時熒光定量PCR原理所謂實時熒光定量PCR技術，是指在PCR反應體系中加入熒光基團，利用熒光信號積累實時監測整個PCR進程，最后通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。1．內標在傳統定量中的作用由于傳統定量方法都是終點檢測，即PCR到達平臺期后進行檢測，而PCR經過對數期擴增到達平臺期時，檢測重
realtime－PCR中內參基因的CT值
這個要看你在做PCR前的加樣量是否一致。如果加樣量是一致的，而內參做出來差別大（比如3-4個CT值）那說明你的實驗體系有嚴重的問題。理論上加入的DNA量一樣多，內參的CT值應該都一樣。如果你能肯定加樣量是一致的，那說明你的樣本要么降解了，要么就是你的實驗處理對內參的量產生了影響，必須換一個基因做內參
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引物設計原則（Principle－of－realtime－quantiation－PCR－primer－）
1、引物的長度一般為15-30bp，常用的是18-27bp，但不應大于38，因為過長會導致其延伸溫度大于74°C，不適于Taq?DNA聚合酶進行反應。2、引物序列在模板內應當沒有相似性較高，尤其是3’端相似性較高的序列，否則容易導致錯配。引物3’端出現3個以上的連續堿基，如GGG或CCC，也會使錯誤