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  • 環狀RNA研究的方法及功能作用(一)

    環狀RNA—隱秘的未知RNA平行宇宙環狀RNA,被喻是隱秘的未知RNA平行宇宙。最近,復旦大學的鄭秋鵬博士(2016交流會嘉賓之一)以第一作者身份在Nature Communications上發布了他們關于circHIPK3的最新研究成果。現在就和小編一起來學習circRNA的研究思路,認識圓圈重塑的RNA世界吧。環狀RNA測序的樣本選擇、分析方法RNA測序分析來自6個正常組織(腦、結腸、心臟、肝、肺、胃)和7個癌癥組織(膀胱尿路上皮癌、乳癌、結直腸癌、肝癌、胃癌、腎透明細胞癌、前列腺癌)的去核糖體RNA后的總RNA,發現了67,358個潛在的環狀RNA,其中27,296含有至少兩個unique back-spliced reads。研究者使用RefSeq database 24對這些環狀RNA進行注釋;環狀RNA表達差異使用Wilcoxon rank-sum test計算,比較癌癥樣本與相應正常組織樣本。初步鑒定預測的新環......閱讀全文

    環狀RNA研究的方法及功能作用(一)

    環狀RNA—隱秘的未知RNA平行宇宙環狀RNA,被喻是隱秘的未知RNA平行宇宙。最近,復旦大學的鄭秋鵬博士(2016交流會嘉賓之一)以第一作者身份在Nature Communications上發布了他們關于circHIPK3的最新研究成果。現在就和小編一起來學習circRNA的研究思路,認識圓圈重塑

    環狀RNA研究的方法及功能作用(二)

    RNA是怎樣變成環狀的呢?a. 在可變剪切過程中,外顯子遷移,剪切形成套索結構,拉近剪切位點,促進序列成環b. 依賴鄰近的反向互補序列配對,拉近剪切位點,使其相互攻擊,促進序列成環c. 單個內含子直接成環d. RNA結合蛋白、反式作用因子參與成環研究功能,敲降看看據文獻報道,環狀RNA可以被小干擾R

    環狀RNA研究方法(一)

    至2015起云序生物已經完成10000+例環狀RNA全轉錄組測序服務,涵蓋了50+疾病,20+物種,幫助眾多客戶在環狀RNA分子的研究中取得突破性進展。客戶發表的環狀RNA文章高達20篇以上。此外云序生物還提供環狀RNA機制研究手段,rip&RNA pull down技術,幫助客戶沖刺高分機制文章。

    銳博生物:環狀RNA研究的方法及功能作用介紹

      銳博生物:環狀RNA—隱秘的未知RNA平行宇宙   環狀RNA,被喻是隱秘的未知RNA平行宇宙。最近,復旦大學的鄭秋鵬博士(2016交流會嘉賓之一)以第一作者身份在Nature Communications上發布了他們關于circHIPK3的最新研究成果。現在就和小編一起來學習circRNA的

    銳博生物:環狀RNA研究的方法及功能作用介紹

      銳博生物:環狀RNA—隱秘的未知RNA平行宇宙   環狀RNA,被喻是隱秘的未知RNA平行宇宙。最近,復旦大學的鄭秋鵬博士(2016交流會嘉賓之一)以第一作者身份在Nature Communications上發布了他們關于circHIPK3的最新研究成果。現在就和小編一起來學習circRNA的

    云序環狀RNA研究策略在環狀RNA研究的應用(一)

    環狀RNA作為新發現的RNA分子,從誕生之日起就是光環加身,屢屢登上Science、Nature、Cell等高分期刊。近期發表的《2019研究前沿》中,“環狀RNA作為癌癥新的生物標志物”成為生物科學領域6個新興前沿之一。2019年環狀RNA共發表SCI論文885篇,較2018年增長約20%,其中大

    環狀RNA研究方法(二)

    在此基礎上,哪些環狀RNA分子發生了差異表達?在這里火山圖、Venn圖應有盡有。根據p=2的標準,一共發現42個環狀發生上調,47個環狀發生下調。?圖3. 差異環狀RNA的篩選2. 差異環狀RNA分子的qPCR驗證對于一篇做譜的文章,差異環狀RNA的結果驗證只需做到qPCR即可。對5個上調和5個下調

    環狀RNA研究深度剖析(一)

    1.環狀RNA為什么火?它到底是何方神圣?2013年兩篇Nature[1][2]文章的出世,徹底顛覆了我們對RNA的傳統認知,同時也迅速引爆了整個生物醫學界!經過嚴格統計匯總后,2017年國家自然科學金獲批的項目中環狀RNA研究相關的項目總數高達176項,其中有兩項杰出青年基金,一項優秀青年基金,兩

    環狀RNA研究文章匯總(一)

    環狀RNA“一站式”服務一直以來是云序生物的主打產品,嚴格的質控把關、嚴謹的實驗設計、出色的生信分析以及貼心的售后服務造就了多項世界首篇環狀RNA研究文章,受到了廣大客戶的一致好評。迄今為止,云序已經積累了超過10000例環狀RNA測序的經驗,樣本覆蓋20多個物種以及50多種疾病,客戶發表文章達20

    環狀RNA(circRNA)功能研究又一利器——過表達載體

    circRNAs 環狀 RNA(circular RNAs,circRNA)是一類具有閉合環狀結構的 RNA 分子,早在 20 世紀八十年代即有研究報道,但由于其表達豐度低,文獻報道較少,一直被認為是 RNA 轉錄剪切的罕見錯誤而被忽視。直到 2012 年開始有研究者開始大批量鑒定 circRN

    云序環狀RNA研究策略在環狀RNA研究的應用(二)

    4.對年齡相關性白內障circRNA的分析顯示,circZNF292可以通過海綿機制調節miR-23b-3p功能發表期刊:Aging-us影響因子:4.831發表時間:2020.9.10研究方法:全轉錄組測序、qRT-PCR、RIP、RNA pull down、雙熒光素酶實驗等云序提供文章鏈接:Pr

    環狀RNA結合功能蛋白

    環狀RNA作為研究持續火熱的明星分子,不同于對其豐富的表達譜研究,環狀RNA功能機制研究還僅僅處在起步階段。環狀RNA研究多為miRNA海綿機制,部分circRNA可競爭性結合miRNA,解除miRNA對靶基因的抑制作用,上調靶基因的表達。其實,環狀RNA可以通過結合不同種類的功能蛋白,分別在轉錄前

    環狀RNA研究深度剖析

      1.環狀RNA為什么火?它到底是何方神圣?   2013年兩篇Nature[1][2]文章的出世,徹底顛覆了我們對RNA的傳統認知,同時也迅速引爆了整個生物醫學界!經過嚴格統計匯總后,2017年國家自然科學金獲批的項目中環狀RNA研究相關的項目總數高達176項,其中有兩項杰出青年基金,一項優秀

    2018國自然研究熱點一:環狀RNA研究深度剖析

      1.環狀RNA為什么火?它到底是何方神圣?   2013年兩篇Nature[1][2]文章的出世,徹底顛覆了我們對RNA的傳統認知,同時也迅速引爆了整個生物醫學界!經過嚴格統計匯總后,2017年國家自然科學金獲批的項目中環狀RNA研究相關的項目總數高達176項,其中有兩項杰出青年基金,一項優秀

    教你輕松玩轉環狀RNA測序加機制研究(一)

    從表達譜至海綿機制完美進階,教你輕松玩轉環狀RNA測序加機制研究文章導讀:禽白血病病毒J亞群(ALV-J)屬于逆轉錄病毒屬,慢病毒亞科的家族成員,可引起禽類多種腫瘤性疾病,如骨髓細胞瘤、肉瘤、血管瘤、腎腫瘤和成紅細胞增多癥,以及禽類骨髓白血病,導致受感染雞的高死亡很率。該分散的ALV-J菌株分布廣泛

    環狀RNA研究深度剖析(二)

    目標circRNA的機制研究 a RIP-qPCR:挑選功能最為明顯的1個circRNA做RIP-qPCR實驗,檢測circRNA是否與AGO2蛋白結合。(AGO2是circRNA發揮海綿作用的指示蛋白) b RNA pull down:對上述circRNA進行RNA pull down實驗,拉

    環狀RNA研究文章匯總(二)

    4.世界首篇人膠質瘤環狀RNA研究(影響因子:3.0)膠質瘤作為最常見的顱內惡性腫瘤占顱腦腫瘤的40%~50%,電磁輻射等其他環境致癌因素會導致膠質瘤的發生,盡管手術切除、術后放療、藥物化療等方法可以作為主流的膠質瘤治療手段,但是多形性膠質母細胞瘤(GBM)的強侵襲、增殖能力仍給病人的治療造成很大的

    非洲爪蟾環狀RNA研究成果

    作為最新的明星分子,環狀RNA的熱度與日俱增。環狀RNA到底火到了什么程度?從云序客戶捷報頻傳﹑研究成果不斷就可見一斑:上期我們剛剛介紹云序客戶發表了世界首個小鼠腦創傷模型外泌體環狀RNA的研究,整合了外泌體和環狀RNA兩大科研熱點。在探索新物種的環狀RNA研究上,云序客戶此前更是先后發表了全世界第

    Nat-Rev-Genetics-|-環狀RNA的合成與功能

      環狀RNA(circular RNA,circRNA)是一種新興的內源性非編碼RNA(noncoding RNA,ncRNA),是繼microRNA (miRNA)以及long noncoding RNA (IncRNA)后非編碼RNA家族中極具研究潛力的新成員。越來越多的研究表明,環狀RNA具

    環狀RNA成癌癥診療研究新熱點

    科技日報北京8月7日電?(記者張夢然)醫學界正致力于揭示環狀RNA在生物學中的復雜性,這一研究有望帶領人們迎接癌癥診療領域的革命性突破。澳大利亞弗林德斯大學發表在世界頂級癌癥期刊之一《自然評論·癌癥》上的一項新研究預測,在未來5—10年內,環狀RNA在改善癌癥治療和患者預后方面具有巨大潛力。文章表示

    環狀RNA成癌癥診療研究新熱點

    醫學界正致力于揭示環狀RNA在生物學中的復雜性,這一研究有望帶領人們迎接癌癥診療領域的革命性突破。澳大利亞弗林德斯大學發表在世界頂級癌癥期刊之一《自然評論·癌癥》上的一項新研究預測,在未來5—10年內,環狀RNA在改善癌癥治療和患者預后方面具有巨大潛力。文章表示,對環狀RNA的探索現已成為重要的研究

    云序生物環狀RNA研究文章匯總

      環狀RNA“一站式”服務一直以來是云序生物的主打產品,嚴格的質控把關、嚴謹的實驗設計、出色的生信分析以及貼心的售后服務造就了多項世界首篇環狀RNA研究文章,受到了廣大客戶的一致好評。迄今為止,云序已經積累了超過10000例環狀RNA測序的經驗,樣本覆蓋20多個物種以及50多種疾病,客戶發表文章達

    乳環狀試驗的方法作用

    中文名稱乳環狀試驗英文名稱milk ring test定  義用于檢測牛、羊是否感染布魯菌的高靈敏試驗。即制備蘇木精染色的死布魯菌懸液,與牛、羊乳汁進行環狀試驗,乳脂表層形成紅色(或藍色)環者為陽性。應用學科免疫學(一級學科),應用免疫(二級學科),免疫學檢測和診斷(三級學科)

    核仁小RNA的功能及其在癌癥研究中的作用(一)

    為什么研究snoRNAs?引言核仁小RNA(snoRNAs)是一類中等長度的非編碼小RNA,它們的長度在60-300nt不等,能與核仁核糖核蛋白結合形成snoRNPs 復合物[1]。在脊椎動物中編碼核仁小RNA的基因主要存在于蛋白編碼基因或非蛋白編碼基因的內含子區域,并且經過進一步的轉錄后加

    研究發現環狀RNA限制皮膚癌的轉移

      一項新的研究發現,一種神秘的遺傳物質可以抑制皮膚癌細胞的擴散,但隨著它們的成熟,這種物質往往會丟失。這項新研究近日發表在《Cancer Cell》上。通常,DNA被轉化成RNA,然后轉化成具有細胞功能的蛋白質。雖然大多數RNA是線性分子,但當它們的末端循環并附著時,有些會形成圓圈。  該研究的作

    當外泌體遇上環狀RNA(一)

    文章導讀外泌體是細胞分泌的大小為30-200nm的盤狀囊泡,它在人體體液中分布廣 泛。2013年,科學家通過研究外泌體細胞囊泡調控機制獲得諾貝爾獎,這使外泌體開始被廣 泛關注,隨著研究的深入,人們發現外泌體可作為細胞間信息交流的橋梁,在細胞間往來穿梭進行信息傳遞。另外,外泌體與疾病的發生尤其

    RNA沉默的功能作用

    植物可利用 PTGS 和 TGS 來抵抗病毒侵染, 病毒侵染植物后會產生大量病毒來源的小 RNA (virus-derived small interfering RNAs, vsiRNA), 介導對病毒 RNA 的降解或抑制病毒基因的轉錄;而在與植物長期共進化過程中, 病毒編碼一個或多個RNA沉默

    反式作用RNA的功能

    中文名稱反式作用RNA英文名稱trans-acting RNA定  義通過分子間反應機制起作用的RNA。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科)

    環狀-RNA-測序案例分析

    案例:以結腸癌,卵巢癌,特發性肺纖維化及正常的人組織為例探討 circular RNAs 的富集與增殖的相關性 背景:最新研究表明,circular RNAs 大量存在,是構成生物體 RNA 網絡的一部分,而且研究者們推測 circular RNAs 與 miRNAs 一樣具有生物學功能。 目的

    教你輕松玩轉環狀RNA測序加機制研究(二)

    3.gga-miR-373 通過與YAP1的3’UTR區結合負調控YAP1的表達,并且過表達gga-miR-375可減弱EMT生信預測揭示YAP1是gga-miR-375的潛在靶基因,進一步的雙熒光素酶報告基因證實了gga-miR-375可通過結合YAP1的3’UTR區抑制YAP1的表達;在體外細胞

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