研究揭示植物聚合酶參與寄主植物防御類病毒侵染
近日，中國農業科學院植物保護研究所經濟作物病毒病害流行與控制創新團隊研究發現，植物RNA依賴的RNA聚合酶1參與寄主防御類病毒的侵染，并參與水楊酸介導的植物對類病毒侵染的防御響應，該研究豐富了目前對植物類病毒與宿主相互作用的認識。相關研究成果在線發表在《分子植物病理學（Molecular Plant Pathology）》上。 據李世訪研究員介紹，類病毒是一種可以自主復制的非編碼的環狀單鏈RNA分子，迄今為止只在高等植物中發現。類病毒雖然很小，但引起病害的嚴重程度，跟病毒相比毫不遜色，尤其對蔬菜和果樹等重要經濟作物的生產構成很大的威脅。其中，馬鈴薯紡絲塊莖類病毒（PSTVd）可在自然狀態下侵染馬鈴薯、番茄、辣椒和茄子等數十種經濟作物，造成嚴重的經濟損失。植物RNA依賴的RNA聚合酶1已被證實在抗植物病毒防御過程中起著重要作用，但其在植物防御類病毒侵染過程中的作用尚不清楚。 該研究利用馬鈴薯紡絲塊莖類病毒和番茄/煙草組合，......閱讀全文
半制備規模單鏈RNA純化（一）
Sean M. McCarthy and Martin GilarWaters Corporation, Milford, MA, U.S.引言寡核苷酸合成是非常高效和高產率的過程。在固相載體上進行寡核苷酸反應的典型產率為每耦合階98～99.5%。在典型的多階寡核苷酸合成中，雜質聚集在一起，即使是一
帶你認識RNA軍團中“非正規軍”——非編碼RNA
人類的每一個細胞隨時都像在進行著一場無止盡的戰爭，細胞核是司令部，細胞質是戰場。六十年前，弗朗西斯·克里克（Francis Crick）的“中心法則”（ DNA轉錄成RNA，再翻譯成蛋白質）現在一直是細胞作戰的絕對軍規，軍事機密（遺傳信息）必須從司令DNA先到RNA軍團，再到“武器彈藥”蛋白質。司令
科學家通過多種方法探究長鏈非編碼RNA
直到今天，針對lncRNA的簡潔且合理的分類系統仍遙不可及。長鏈非編碼RNA的概念模型 2013年，一群研究人員決定更加深入地挖掘一種名為H1的人類胚胎干細胞系，并且獲得了一些驚喜。H1是最著名的干細胞系之一，但該團隊還是成功發現了2000多個此前未被闡明的RNA片段。更重要的是，其中有1
云序環狀RNA研究策略在環狀RNA研究的應用（一）
環狀RNA作為新發現的RNA分子，從誕生之日起就是光環加身，屢屢登上Science、Nature、Cell等高分期刊。近期發表的《2019研究前沿》中，“環狀RNA作為癌癥新的生物標志物”成為生物科學領域6個新興前沿之一。2019年環狀RNA共發表SCI論文885篇，較2018年增長約20%，其中大
云序環狀RNA研究策略在環狀RNA研究的應用（二）
4.對年齡相關性白內障circRNA的分析顯示，circZNF292可以通過海綿機制調節miR-23b-3p功能發表期刊：Aging-us影響因子：4.831發表時間：2020.9.10研究方法：全轉錄組測序、qRT-PCR、RIP、RNA pull down、雙熒光素酶實驗等云序提供文章鏈接：Pr
非編碼小RNA的基本信息
中文名稱非編碼小RNA英文名稱small non-messenger RNA;snmRNA定 義細胞中一大類由幾十核苷酸到幾百核苷酸組成的、不編碼蛋白質的RNA。本身或與蛋白質結合形成的復合體有生物學功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干擾小RNA、時序小RNA等。應用學科生物化學與分子生
Nature重要發現：獨特的非編碼RNA
我們的皮膚表皮是由許多不同細胞類型構成的混合體，每種細胞類型都有非常明確的職責。這樣復雜的組織，其生成或分化在細胞水平上需要進行大量的協調，這一過程發生故障可以導致災難性的后果。現在，來自斯坦福大學醫學院的研究人員確定了這一分化過程的一個主要調控因子。研究成果發表在12月2日的《自然》(Natu
非編碼小RNA的結構和功能
中文名稱非編碼小RNA英文名稱small non-messenger RNA;snmRNA定 義細胞中一大類由幾十核苷酸到幾百核苷酸組成的、不編碼蛋白質的RNA。本身或與蛋白質結合形成的復合體有生物學功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干擾小RNA、時序小RNA等。應用學科生物化學與分子生
m6A“RNA甲基化”研究匯總—非編碼RNA篇
RNA甲基化是目前申請國自然項目熱點，也是唯一能在短短3個月內發數十篇nature，cell級別高分文章領域，近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究熱潮。因mRNA參與蛋白編碼，之前多數文章針對mRNA甲基化進行研究（詳細見云序課堂之前往期回顧）。然而許多研究表明發生m6A甲基化的非編碼RNA在
環狀－RNA－測序案例分析
案例：以結腸癌，卵巢癌，特發性肺纖維化及正常的人組織為例探討 circular RNAs 的富集與增殖的相關性 背景：最新研究表明，circular RNAs 大量存在，是構成生物體 RNA 網絡的一部分，而且研究者們推測 circular RNAs 與 miRNAs 一樣具有生物學功能。 目的
環狀RNA研究深度剖析
1.環狀RNA為什么火？它到底是何方神圣？ 2013年兩篇Nature[1][2]文章的出世，徹底顛覆了我們對RNA的傳統認知，同時也迅速引爆了整個生物醫學界！經過嚴格統計匯總后，2017年國家自然科學金獲批的項目中環狀RNA研究相關的項目總數高達176項，其中有兩項杰出青年基金，一項優秀
環狀RNA結合功能蛋白
環狀RNA作為研究持續火熱的明星分子，不同于對其豐富的表達譜研究，環狀RNA功能機制研究還僅僅處在起步階段。環狀RNA研究多為miRNA海綿機制，部分circRNA可競爭性結合miRNA，解除miRNA對靶基因的抑制作用，上調靶基因的表達。其實，環狀RNA可以通過結合不同種類的功能蛋白，分別在轉錄前
環狀RNA研究方法（一）
至2015起云序生物已經完成10000+例環狀RNA全轉錄組測序服務，涵蓋了50+疾病，20+物種，幫助眾多客戶在環狀RNA分子的研究中取得突破性進展。客戶發表的環狀RNA文章高達20篇以上。此外云序生物還提供環狀RNA機制研究手段，rip&RNA pull down技術，幫助客戶沖刺高分機制文章。
環狀RNA研究方法（二）
在此基礎上，哪些環狀RNA分子發生了差異表達？在這里火山圖、Venn圖應有盡有。根據p=2的標準，一共發現42個環狀發生上調，47個環狀發生下調。?圖3. 差異環狀RNA的篩選2. 差異環狀RNA分子的qPCR驗證對于一篇做譜的文章，差異環狀RNA的結果驗證只需做到qPCR即可。對5個上調和5個下調
微生物所長鏈非編碼RNA與免疫細胞癌變研究獲進展
Abelson鼠白血病病毒（A-MuLV）是一種可以誘導小鼠淋巴細胞癌變的逆轉錄病毒，v-Abl是A-MuLV的癌基因。Bcr-Abl癌基因是由位于人類9號染色體的c-Abl基因和22號染色體的Bcr基因斷裂易位融合而成，編碼的Bcr-Abl融合蛋白可以誘發人的慢性粒細胞白血病（CML）和急性淋
武漢植物園等長鏈非編碼RNA調控基因轉錄研究獲進展
長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA, lncRNA)一般指長度大于200個核苷酸的非編碼RNA，目前已在多種生物中發現了大量lncRNA，然而只有少數lncRNA的精細作用機理被闡明。 中國科學院武漢植物園汪志偉博士在植物種群遺傳學科組王艇研究員支持和中國科學院留學
中國科大在長鏈非編碼RNA調控腫瘤形成研究中取得進展
7月1日，中國科學技術大學生命科學學院教授梅一德研究組在《美國國家科學院院刊》（PNAS）上在線發表題為Long noncoding RNA EMS connects c-Myc to cell cycle control and tumorigenesis的研究論文。 c-Myc作為促癌蛋白
同濟大學教授最新文章：癌癥與長鏈非編碼RNA
同濟大學生命科學與技術學院的研究人員發表了題為“HULC cooperates with MALAT1 to aggravate liver cancer stem cells growth through telomere repeat-binding factor 2”的文章，長鏈非編碼RNA－
CRISPR新成果：－針對長鏈非編碼RNA的完全敲除高通量篩選
之前的方法在效率、質量（假陽性、假陰性）上各有欠缺：比如CRISPRi的方法只能實現基因表達抑制而不是完全敲除，CRISPRa的方法只能上調基因表達，無法對基因不可或缺的作用實施篩選評估。大片段刪除的策略由于步驟的繁瑣，也限制了其在更大規模上得到應用。 作為強大的基因編輯工具，CRISPR/C
僅需1個長非編碼RNA變化足以逆轉細胞衰老
隨著時間推移，細胞慢慢老化，許多疾病發病都跟細胞衰老有關。誘導細胞再生是對抗細胞衰老相關疾病的核心策略之一。然而，老化細胞往往高度抵抗任何旨在誘導再生的操作。（老年成纖維細胞重編程效果低下） 雖然眾所周知RNA負責細胞內蛋白質合成，但是一類被稱為非編碼RNA的特殊分子從來不會被轉化為蛋白質，事
非編碼RNA為癌癥研究提供新思路
澳大利亞紐卡斯爾大學和中國科技大學等機構合作完成的兩項最新研究表明，非編碼RNA（核糖核酸）在癌癥治療方面存在巨大潛力，有助于開發出新型的癌癥靶向治療方法。 非編碼RNA是指不編碼蛋白質的RNA。長期以來，全球各地開展的癌癥研究主要針對能編碼蛋白質的基因，這些基因只占人類基因組的2%。 發表
長期被誤解－非編碼RNA存在“認知黑洞”
在人類基因組中95%的基因并不編碼蛋白質，其他物種也有大量的非編碼基因。這些DNA不會被編碼成蛋白質，卻又會轉錄出非編碼RNA，它們對生命活動起什么作用？是進化的冗余還是神秘的緩存？ 《細胞》雜志近日刊登中國工程院院士曹雪濤團隊的研究論文，他們發現一種全新非編碼RNA分子。該分子能夠調控免
深入研究非編碼RNA的新工具
最近，加拿大多倫多大學Donnelly中心的一個研究小組，開發出了一種方法，可使科學家們能夠深入探索“ncRNAs在人類細胞內做了什么”。 這項研究發表在5月19日的《Molecular Cell》雜志，同一天，來自新加坡基因組研究所的Yue Wan研究組與斯坦福大學的Howard Chang
中國科大發現新型非編碼RNA
最近，中國科學技術大學單革教授實驗室在國際知名雜志《自然-結構和分子生物學》(Nature Structural & Molecular Biology)發表研究性論文，報導了其實驗室發現的一類新型非編碼RNA以及此類非編碼RNA的功能和功能機理。 非編碼RNA是一大類不編碼蛋白質而在細胞中起
Cell封面故事：抗癌向著非編碼RNA開炮
一種常見兒童血癌中對觸動及推動腫瘤生長和進展的因子開展大型遺傳分析，來自紐約大學Langone醫學中心的研究人員報告稱，他們鑒別出了一個可能的、治療這種疾病的新藥物靶點。 T細胞急性淋巴母細胞性白血病（T-cell acute lymphoblastic leukemia）是一種最常見且具有侵
長期被誤解－非編碼RNA存在“認知黑洞”
在人類基因組中95%的基因并不編碼蛋白質，其他物種也有大量的非編碼基因。這些DNA不會被編碼成蛋白質，卻又會轉錄出非編碼RNA，它們對生命活動起什么作用？是進化的冗余還是神秘的緩存？ 《細胞》雜志近日刊登中國工程院院士曹雪濤團隊的研究論文，他們發現一種全新非編碼RNA分子。該分子能夠調控免疫
非編碼RNA的功能引發國際研究熱潮
由1962年諾貝爾生理學或醫學獎獲得者英國科學家克里克和美國科學家沃森提出的分子生物學中心法則認為，遺傳信息是從DNA（脫氧核糖核酸）傳遞給mRNA（信使核糖核酸），再從mRNA傳遞給功能蛋白質，由此來完成遺傳信息的轉錄和翻譯過程的。 根據這一中心法則，mRNA似乎只有唯一的
如何揭開長非編碼RNA的神秘面紗
長非編碼RNA(lncRNA)長達兩百個核苷酸以上的轉錄本，但并不編碼任何蛋白質。盡管如此，長非編碼RNA在不同組織和發育階段的表達依然具有特異性，說明lncRNA的調控具有重要的生物學意義。細胞中絕大多數lncRNA(也稱lincRNA)位于細胞核，它們對應的DNA區域有的與蛋白編碼基因重疊，
出人意料的非編碼RNA調控
為了將六英尺多的DNA塞進細胞核里，細胞將基因組緊緊纏繞在組蛋白核心上形成核小體，并最終將其包裝成緊密的染色質。DNA轉錄的時候需要打開核小體，而胚胎干細胞的染色質重塑復合體esBAF可以做到這一點。它不僅會打開需要轉錄的DNA，還暴露了促進轉錄的啟動子和增強子。 基因組測序研究最近顯示，增強
可以促進癌細胞生長的非編碼RNA
國際著名學術期刊《美國國家科學院院刊》發表西奈山伊坎醫學院教授Benjamin Greenbaum的一篇研究文章。研究人員在癌細胞中發現了一組可以激發免疫反應的非編碼RNA分子，它們具有與病原體相似的一些特征。由于這些分子在癌細胞中表達并擴增，它們造成的免疫反應有可能影響癌細胞的生長。 研究