使用MDSoftMaxPro7軟件進行平行線分析和相對活性..(二)
噪聲和權重噪聲是指檢測響應的隨機變化,當進行平行線評價時這是需要考慮的重要因素,因為它會影響檢測平行性的能力。在高噪聲的情況下,平行性計算值由于由于受噪聲的影響過大,因此無法再正確的反應非平行性的程度。對于 F- 檢驗和卡方檢驗法這兩種方法,在計算各自的概率值的過程中對于不同噪聲水平的處理能力是不同的。F- 檢驗的概率值不受此因素影響,但是卡芳檢驗概率計算值則高度依賴于噪聲水平并要求對于數據方差進行準確的估算。因此,對于卡方檢驗法需要進行反方差權重設置。如在“Selecting the best weightingfactor in SoftMax Pro 7”此篇應用資料里討論的,生物實驗一般在在曲線的上半部分會有較大的方差。在無權重的回歸分析中,平行性的結果會主要受曲線的上半部分的數據點影響,而曲線的下半部分的數據點在對于平行性結果的影響不大。在軟件的模板中,權重因子的設置使用方差的倒數,但是根據情況可以調整為更合適的權......閱讀全文
使用MD-SoftMax-Pro-7軟件進行平行線分析和相對活性..(二)
噪聲和權重噪聲是指檢測響應的隨機變化,當進行平行線評價時這是需要考慮的重要因素,因為它會影響檢測平行性的能力。在高噪聲的情況下,平行性計算值由于由于受噪聲的影響過大,因此無法再正確的反應非平行性的程度。對于 F- 檢驗和卡方檢驗法這兩種方法,在計算各自的概率值的過程中對于不同噪聲水平的處理能力是不同
使用MD-SoftMax-Pro-7軟件進行平行線分析和相對活性..(一)
使用MD SoftMax Pro 7軟件進行平行線分析和相對活性評價介紹在生物實驗中要經常要使用到的平行線分析(PLA)方法,當無法直接檢測一個生物制品的活性而只能通過檢測其產生的效果時,PLA方法通常會被用來進行效應曲線的比較來獲得此制品的效果(Figure1)。如果對于兩種物質其生物響應相似或者
使用SoftMax-Pro-7軟件選擇最佳的曲線擬合方式(二)
SSE 方法使用下面的公式進行分析:SSE= Σ wi (yi - yi)2。假設數據誤差是不相關的且符合正態分布,使 SSE 盡可能的最小能夠最大近似的估算數據模型的曲線公式參數。換句話說,最佳的曲線擬合方式是其參數能夠得到最小的 SSE。如果兩種擬合方式都能符合數據,那么哪個殘差圖給出了最小的
如何在SoftMax-Pro-7軟件中選擇最佳權重因子?(二)
結論利用 SSE 和 AIC 方法開發了檢測模板,在SoftMax Pro7 軟件中選擇的曲線擬合模型測試最常見的加權因子。這些統計測試有助于比較適用于不同加權因子的擬合度優化,可以自信選擇最適當的加權方式。然而,必須確保有足夠的數據點支撐來解釋其變化。參考文獻1. Gottschalk, P.,
SoftMax-Pro軟件驗證方案
對于在GLP或GMP實驗室工作的科研人員,SoftMax Pro軟件驗證方案提供了最為全面的記錄文檔和可用于驗證GxP管理員功能,軟件運行和分析能力的工具。驗證時間從6個月縮短至三天對于您實驗最重要的莫過于結果的重復性,可靠性和完整性,但要做到這些可能需要多達6個月的時間進行充足的實驗步驟的認證和記
使用SoftMax-Pro-7軟件選擇最佳的曲線擬合方式(一)
引言當需要定義一個數據的特征時,如變化的比例、曲線上下邊的漸近線或者 EC50/IC50值時,選擇正確的曲線擬合方式是十分關鍵的。選擇的曲線擬合方式應該是能夠最準確的反映兩個已知變量 (x,y) 的關系。因此,曲線擬合的目的就是為了尋找最佳的公式和參數來匹配數據。SoftMax Pro 7軟
如何在SoftMax-Pro-7軟件中選擇最佳權重因子
前言 選擇合適的權重因子對于獲得最佳的曲線擬合至關重要, 獲得曲線擬合參數值使得曲線擬合模型盡可能接近真實的測量數據點。加權將會影響到每個濃度下數據點的影響程度和發揮的作用,或特定數據點或曲線某一部權重是對數據中誤差進行建模的一種方式,并且已經用于處理不同曲線的不同數據點的
如何在SoftMax-Pro-7軟件中選擇最佳權重因子?(一)
前言選擇合適的權重因子對于獲得最佳的曲線擬合至關重要, 獲得曲線擬合參數值使得曲線擬合模型盡可能接近真實的測量數據點。加權將會影響到每個濃度下數據點的影響程度和發揮的作用,或特定數據點或曲線某一部權重是對數據中誤差進行建模的一種方式,并且已經用于處理不同曲線的不同數據點的絕對誤差的差異,如四參數
利用SoftMax-Pro軟件分析心肌細胞球收縮
基于細胞的化合物篩選模型已變的越來越復雜,以展示生物系統的復雜性。活細胞成像和三維模型為活細胞的結構和細胞過程提供了有價值的見解。最近在開發代表人類不同種類組織的復雜類器官模型方面有了很大的進展,其中包括肝臟、胰腺、神經和心肌組織。心肌細胞球能夠在體外環境下收縮并且可對不同調控因子的影響作出反應
利用SoftMax-Pro軟件分析心肌細胞球收縮
前言基于細胞的化合物篩選模型已變的越來越復雜,以展示生物系統的復雜性。活細胞成像和三維模型為活細胞的結構和細胞過程提供了有價值的見解。最近在開發代表人類不同種類組織的復雜類器官模型方面有了很大的進展,其中包括肝臟、胰腺、神經和心肌組織。心肌細胞球能夠在體外環境下收縮并且可對不同調控因子的影響作出反應
SoftMax-Pro-7.1-GxP企業版數據獲取和分析軟件說明書
SoftMax Pro 7.1 GxP企業版數據獲取和分析軟件 在GMP/GLP實驗條件下符合FDA指導方針的完整驗證工具及手段 優勢: ? 通過系統審計追蹤功能可以輕松跟蹤和記錄所有的改變 ? Microsoft SQL 數據庫能夠使軟件具有企業級別文檔共享能力
微孔讀板機符合-GMP/GLP-實驗的合規之路
符合 GMP/GLP 實驗的合規之路 SoftMax? Pro 7.1 GxP 是 Molecular Devices 最新、最安全的一款軟件,符合全新的 FDA 21 CFR Part 11 的工作流程,以確保您獲得數據的完整性。每個步驟都經過優化,其目的 是簡化分析流程和報
在MD兩款酶標儀上應用Promega-CellTiterGlo化學發光法檢測...
在MD兩款酶標儀上應用Promega CellTiter-Glo化學發光法檢測細胞活性介紹Molecular Devices公司的SpectraMax? L及SpectraMax?M5型號酶標儀結合Promega公司的CellTiter-Glo化學發光細胞活性檢測試劑盒能進行快速靈敏的活細胞數量
用新型自動細胞成像系統和細胞分析軟件進行基...(二)
評價化合物對心機細胞毒性的作用評價心肌細胞毒性影響,使用各種不同的心肌細胞毒性化合物處理 24 小時,然后活細胞通過 Hoechst 核染料分子標記后,MitoTracker Orange 染料標記和 AF-488 連接的鬼筆環肽染料來檢測細胞骨架的完整性。利用 ImageXpress Pi
SoftMax?Pro7.1.1GxP應用于更全地獲得并分析數據
SoftMax?Pro7.1.1GxP是MolecularDevices最近更新、最安全的一款軟件,符合全新的FDA21CFRPart11的工作流程,以確保您獲得數據的完整性。每個步驟都經過優化,其目的是簡化分析流程和報告生成時間,以便于支持我們的微孔讀板機更快獲得完整、可靠的數據。為了確保您的微孔
使用SpectraMax微孔板讀板機檢測QuantiT-PicoGreen-dsDNA實驗-二
- 高濃度范圍標曲可以濃度從1 ng/mL制備到1 μg/mL,低濃度范圍標曲可以從25 pg/mL制備到25 ng/mL。對于高濃度范圍標曲,按Table 2中稀釋方案稀釋;對于低濃度范圍標曲,40倍稀釋2μg/mL溶液制備50 ng/mL溶液,參考Table 3中的稀釋方案。 注意:此篇
Molecular-Devices在細胞成像系統上檢測細胞活性或毒性
EarlyTox?細胞完整性試劑盒由一系列易于識別活細胞和死細胞的優化試劑組成。可用于檢測不同處理對細胞活性的影響,也可評估不同機制產生的細胞毒性,包括凋亡和壞死。該試劑盒設計工作于多種細胞類型,貼壁和懸浮均可。簡單的操作流程和優異的試劑表現使其能應用到高通量掃描上。試劑盒中使用了兩種結合DNA的熒
細胞周期的四種檢測方法詳解(二)
2 數據分析MiniMax 細胞計數儀的透射光模塊可以從自動聚焦得到更好的圖像效果。SoftMax Pro 軟件中的“Field Analysis”能進行自定義分析從而鑒別細胞重疊的部分。我們應用一種特殊的鑒別方法來區分目標球體和其余物體,如殘渣和個體細胞,從而在后續的分析中予以去除 (
利用MD微孔板讀板機對細胞內氧化自由基吸收能力(ORAC)...
引言活性氧簇 (Reactive oxygen species, ROS) 是由細胞內正常代謝反應,環境壓力 以及紫外輻射產生的一類物質,包括過氧 自由基、羥基自由基、超氧離子和單線態 氧。氧化自由基吸收能力 (oxygen radical absorbance capacity,ORAC)
利用MD微孔板讀板機對細胞內氧化自由基吸收能力ORAC
活性氧簇 (Reactive oxygen species, ROS) 是由細胞內正常代謝反應,環境壓力 以及紫外輻射產生的一類物質,包括過氧 自由基、羥基自由基、超氧離子和單線態 氧。氧化自由基吸收能力 (oxygen radical absorbance capacity,ORAC) 分析是
獨特無標記細胞分析技術無需熒光染料標記細胞也可對...
獨特無標記細胞分析技術無需熒光染料標記細胞也可對其進行成像分析簡介基于細胞成像的分析技術一般需要使用熒光染料進行標記,一些熒光標記可能對活細胞具有毒性或者只能用于固定過的細胞進行染色。無標記細胞分析技術使得研究者既無需耗時耗力的染色流程也無需擔心染料對正常細胞活力的影響,就可以計算出細胞數目和細胞匯
MD酶標儀應用:細胞活力和毒性分析的原理和方法(二)
上述的代謝法均屬于酶標儀光吸收應用,雖然相對經濟,但還是會受到光吸收本身的多種限制,尤其是動態范圍窄,容易受到具有光吸收特性的試劑和藥物干擾等。同時,光吸收法受限于比爾定律中的光徑因素,不適用于384或1536孔板等更高通量檢測等。因此,基于熒光檢測的代謝法也成為了主要的細胞活力檢測方法之一,其中常
利用細胞計數儀檢測細胞周期
前言球體是小型的3D細胞培養微環境,可以用于諸如低吸附微孔板等特殊的方法進行細胞培養。這種體外3D細胞培養模型具有高度的臨床及生物可靠性,并且已經被廣泛應用于高通量篩選(HTS)和高級細胞培養,從而方便對諸如化合物毒性和癌癥等重大疾病進行研究。Multicellular tumor sphe
應用MD微孔板讀板機和雙報告系統檢測NFκB活性(二)
方法細胞接種和轉染HEK293細胞(80%融合度)用胰酶消化后分到96孔白板中,每孔15,000細胞。當細胞超過50% 融合度時,用NF- κB-RE 螢火蟲熒光素酶和海腎對照組質粒對細胞進行共轉染,其中使用三種不同比例FuGENE和DNA組合方式,轉然后,細胞置于37°C培養箱中培養24h。
利用SpectraMax-i3x多功能微孔板讀板機檢測功能對...(二)
ATP標準曲線既可以驗證試驗條件也可以用來計算細胞內ATP的含量。因此ATP標準品濃度范圍從1nM至10uM產生的化學發光信號范圍可覆蓋整個不同細胞數目孔中產生的信號值(圖二),檢測的線性范圍大于四個數量級。??經十字孢堿(staurosporine)和茴香霉素 (anisomycin)等化合物
SpectraMax-M系列微孔板讀板機應用集錦(一)
引領微孔板檢測系統的行業標準歷經13年發展,SpectraMax? M系列多功能微孔板讀板機由于其優異的檢測表現、可靠的性能、深受廣大科研工作者的信賴,已然成為行業標準的引領者。可以根據應用需求輕松升級滿足您的檢測。儀器設置和數據處理都可借助于專業的SoftMax? Pro軟件完成,所有
如何使用M5-多功能微孔板讀板機和IMAP?-熒光偏振...(二)
結合反應步驟1.將75%的結合緩沖液A與25%的結合緩沖液B混合,制備結合緩沖液;步驟2.將結合試劑以1:600倍稀釋成結合緩沖液,得到結合反應液;步驟3.移出60ul結合反應液到每個檢測孔和校正標準孔中(包括背景孔樣本)步驟4.室溫避光孵育1小時 在SoftMax Pro軟件上設置模板,并在Spe
SpectraMax-M系列微孔板讀板機應用集錦(二)
軟件驗證對于在GLP或GMP實驗室工作的科研人員,SoftMax Pro軟件驗證方案提供了最為全面的記錄文檔和可用于驗證GxP管理員功能,軟件運行和分析能力的工具。- 驗證時間從6個月降低到3天支持平行線分析,4-P和5-P曲線擬合驗證- 全面復雜的針對常規實驗計算的檢測- 即時可用于OQ驗證檢測的
誘導多能干細胞毒性實驗(一)
優勢:1.? 簡易、快速的通過檢測細胞貼壁面積進行96或384孔板細胞毒性篩選2.? 按照一般微孔讀板機的簡單流程3.? 具有細胞影像數據,增加數據可信性藥物引起的組織毒性是候選藥物未能進入市場的一個重要原因,因此,安全性和有效性試驗的高度預測分析是提高藥物開發和降低候選藥物抗藥性的關鍵。人源誘導多
Pepfinder軟件對單克隆抗體進行肽圖分析(二)
?圖3 肽段SNWEAGNTFTCSVLHEGLHNHHTEK的脫酰胺鑒定及定量??圖4 在PepFinder2.0中對所有肽段進行De Novo Sequencing??圖5 對一張MS/MS譜圖進行De Novo Sequencing???圖6 在PepFinder軟件中計算單克隆抗體各種常用分