來自瑞典Ludwig癌癥研究所及Karolinska研究所的研究人員,在最新一期(9月22日)的《自然方法》(Nature Methods)雜志上報告了一項獲得重大改良的新技術,可以利用它來分析單細胞中的基因表達——這一性能與從基礎研究到未來癌癥診斷的一切事物均存在關聯。 資深作者Rickard Sandberg 說:“在腫瘤和健康組織中有一些細胞的數量稀少,除了單細胞方法沒有任何其他的技術能夠對它們進行分析。這種方法使得我們能夠鑒別各種各樣組織中稀少且重要的細胞亞群。我們還能夠利用它以從所未有的精確性,梳理分析隨著胚胎發育為生物體或是腫瘤獲得轉移性,細胞從一種狀態轉換至另一種狀態獨特基因組的表達情況。” 傳統的方法依賴于一次性總體分析數百萬個細胞的基因表達,往往會掩蓋特異組織中某些特化細胞具有生物學意義的基因表達差異。單細胞分析基因表達克服了這一局限。2012年,Illumina生物公司聯合Sandbe......閱讀全文
DNA微陣列基因表達數據分析 對于基因表達譜數據的分析是生物信息學 的研究熱點和難點。轉化為數學問題,分析任務是從數據矩陣 M 中找出顯著性結構,結構類型包括全局模型 (model) 和局部模式 (pattern) 。對基因表達譜數據的分析是數據挖掘問題,所采用的方法包括通過可視
流式細胞術工作原理是在細胞分子水平上通過單克隆抗體對單個細胞或其他生物粒子進行多參數、快速的定量分析。它可以高速分析上萬個細胞,并能同時從一個細胞中測得多個參數,具有速度快、精度高、準確性好的優點,是當代最先進的細胞定量分析技術之一。光源、液流通路、信號檢測傳輸和數據的分析系統是流式細胞儀的主要組成
核酸分子雜交技術由于核酸分子雜交的高度特異性及檢測方法的靈敏性,它已成為分子生物學中最常用的基本技術,被廣泛應用于基因克隆的篩選,酶切圖譜的制作,基因序列的定量和定性分析及基因突變的檢測等。其基本原理是具有一定同源性的原條核酸單鏈在一定的條件下(適宜的溫室度及離子強度等)可按堿基互補原成雙鏈。雜交的
流式細胞分析(Flow cytometry,FCM)是以高能量激光照射高速流動狀態下被熒光色素染色的單細胞或微粒,測量其產生的散射光和發射熒光的強度,從而對細胞(或微粒)的物理、生理、生化、免疫、遺傳、分子生物學性狀及功能狀態等進行定性或定量檢測的一種現代細胞分析技術,它具有如下幾個特點:①標本只要
腫瘤組織中免疫細胞的組成在免疫治療中起關鍵作用,然而人類腫瘤組織中免疫細胞的異質性和分化途徑還有待研究。李漢杰博士等通過對25名黑色素瘤患者腫瘤中免疫細胞的單細胞轉錄組測序和單細胞TCR測序分析,發現大量的CD8 T細胞的轉錄組呈連續性梯度分布,跨越了從“過渡態”到“功能失調狀態”的分化途徑。相
基因敲除可以說是基因組 學、細胞分離培養以及轉基因技術的組合。那么基因敲除的原理是什么呢? 基因敲除的方法有哪些呢?在此,做個小結,以供大家學習。一.概述:基因敲除是自80年代末以來發展起來的一種新型分子 生物學技術,是通過一定的途徑使機體特定的基因失活或缺失的技術。通常意義上的基因敲除主要是應用D
【探針技術用于檢測由siRNA介導的基因調制】 為了研究基因功能,科學家們常常會有針對性地關斷某些特定的基因。 而要驗證這種基因沉默的有效性, 就需要運用適當的具特異性的檢測方法。理想的檢測方法不僅要測量準確, 而且還要能讓細胞保持完好無損。 利用諸如RNA(核
流式細胞分析(Flow cytometry,FCM)是以高能量激光照射高速流動狀態下被熒光色素染色的單細胞或微粒,測量其產生的散射光和發射熒光的強度,從而對細胞(或微粒)的物理、生理、生化、免疫、遺傳、分子生物學性狀及功能狀態等進行定性或定量檢測的一種現代細胞分析技術,它具有如下幾個特點:①標本只要
IS PCR的技術特點 (1)既具有PCR的特異性與高靈敏性,又具有原位雜交的定位準確性;(2)測到低于2個拷貝量的細胞內特定DNA序列,甚至可檢測出單一細胞中的僅含一個拷貝的原病毒DNA;(3)有助于細胞內特定核酸序列定位與其形態學變化的結合分析;(4)可用于正常或惡性細胞,感染或非感染細胞的鑒定
分析測試百科網訊 2018年9月安捷倫以2.5億美元收購艾森生物(ACEA),艾森以其革新的NovoCyte臺式流式細胞儀和實時無標記細胞分析儀xCELLigence RTCA系統,在細胞分析市場上獨樹一幟,獲得全球數千高端客戶的信賴。在新冠疫情期間,安捷倫生物向中國疾控和武漢病毒所捐贈了xCE
接觸過單細胞轉錄組數據的小伙伴們都知道,數據的核心結果在于根據每個細胞的基因表達數據,來對細胞進行分群分類。現有通用的分析思路如下:首先根據轉錄組稀疏矩陣,通過計算和分析,找到不同的細胞Cluster,并找到每一類集群的Marker基因。根據已有對細胞特定Marker基因的認識,來對細胞可能的集
ImageStream是一種臺式多譜段成像流式細胞儀(Multispectral Imaging Flow Cytometry),能夠同時采集6個檢測通道中的細胞圖像。它將流式細胞檢測與熒光顯微成像結合于一身,既能提供細胞群的統計數據,又可以獲得單個細胞的圖像,從而提供細胞形態學、細胞結
接觸過單細胞轉錄組數據的小伙伴們都知道,數據的核心結果在于根據每個細胞的基因表達數據,來對細胞進行分群分類。現有通用的分析思路如下:首先根據轉錄組稀疏矩陣,通過計算和分析,找到不同的細胞Cluster,并找到每一類集群的Marker基因。根據已有對細胞特定Marker基因的認識,來對細胞可能的集群進
流式細胞儀在生物學中的應用 耿慧霞 ,王 來 ,王 強 (河南大學生命科學學院 ,河南開封 475001) 摘 要 :簡要論述了流式細胞儀(flow cytometry ,FCM) 的工作原理 ,并對其在生物學基礎科學研究中的應用進行闡述 ,包括 對細胞凋亡、細胞周期、免疫細胞、細胞受體的研
為規范和指導按照藥品研發及注冊的細胞治療產品的研究與評價工作,國家食品藥品監督管理總局組織制定了《細胞治療產品研究與評價技術指導原則(試行)》(見附件),現予發布。特此通告。食品藥品監管總局2017年12月18日細胞治療產品研究與評價技術指導原則(試行)一、前言近年來,隨著干細胞治療、免疫細胞治療和
“黑匣子”(Black Box),學名是飛行數據記錄儀,是飛機專用的電子記錄設備之一,可以記錄飛機飛行期間的詳細信息資料。 回首2014年,找不到“黑匣子”的馬航(MAS)在12月15日告別吉隆坡股票交易所,結束為期29年的上市生涯。這一天,恰好也是韓國科學家黃禹錫的生日。 看到上述開頭,你
近10年來,現代分子生物學技術越來越廣泛地被用于人類疾病研究的諸領域,為了解病理狀態下基因組DNA的變化積累了新資料。目前認為,人類基因組并非人們想像的那樣穩定,諸如基因重排、擴增、缺失,突變和DNA甲基化類型改變等時有發生,這些改變對于基因表達和調控,以及疾病過程的發展與轉歸等方面均具有重要意義。
基于單細胞轉錄組數據的細胞軌跡分析常見形式有細胞變化軌跡分析和細胞譜系分析,在上一篇中,我們詳細介紹了常規擬時間序列分析的相關內容(具體內容查看鏈接)。在這里,我們主要就細胞譜系分析進行介紹和解讀。 細胞譜系分析,最簡明的理解就是細胞領域的進化樹,通常指的是某類祖源細胞,在特定條件下,有多
基于單細胞轉錄組數據的細胞軌跡分析常見形式有細胞變化軌跡分析和細胞譜系分析,在上一篇中,我們詳細介紹了常規擬時間序列分析的相關內容(具體內容查看鏈接)。在這里,我們主要就細胞譜系分析進行介紹和解讀。 細胞譜系分析,最簡明的理解就是細胞領域的進化樹,通常指的是某類祖源細胞,在特定條件下,有多
單細胞檢測技術的發展為我們理解復雜生命體中細胞的組成與各自功能及變化過程提供了強有力的工具。基于單細胞基因表達譜數據,我們可以窺探發育過程中細胞內的調控變化,發現腫瘤微環境中的各類細胞及它們的細胞間交流,理解器官組織中復雜多樣的細胞類型。現有單細胞研究是一個從整體到個體,再由個體特征重建整體的過
單細胞檢測技術的發展為我們理解復雜生命體中細胞的組成與各自功能及變化過程提供了強有力的工具。基于單細胞基因表達譜數據,我們可以窺探發育過程中細胞內的調控變化,發現腫瘤微環境中的各類細胞及它們的細胞間交流,理解器官組織中復雜多樣的細胞類型。現有單細胞研究是一個從整體到個體,再由個體特征重建整體的過
基于單細胞轉錄組數據的細胞軌跡分析常見形式有細胞變化軌跡分析和細胞譜系分析,在上一篇中,我們詳細介紹了常規擬時間序列分析的相關內容(具體內容查看鏈接)。在這里,我們主要就細胞譜系分析進行介紹和解讀。細胞譜系分析,最簡明的理解就是細胞領域的進化樹,通常指的是某類祖源細胞,在特定條件下,有多個發育軌跡和
接觸過單細胞轉錄組數據的小伙伴們都知道,數據的核心結果在于根據每個細胞的基因表達數據,來對細胞進行分群分類。現有通用的分析思路如下:首先根據轉錄組稀疏矩陣,通過計算和分析,找到不同的細胞Cluster,并找到每一類集群的Marker基因。根據已有對細胞特定Marker基因的認識,來對細胞可能的集
根據歐洲兒科胃腸病學肝病學和營養學會European Society for Paediatric Gastroenterology Hepatology and Nutrition (ESPGHAN)定義,小兒(<17歲)發作的腸炎為小兒腸炎(pediatric IBD,PIBD)【1】
外源基因在原核細胞中表達是基因工程操作中最初取得成功的途徑。1 原核生物基因表達的特點同所有的生命過程一樣,外源基因在原核細胞中的表達包括兩個主要過程:即 DNA轉錄成mRNA和 mRNA翻譯成蛋白質。與真核細胞相比,原核細胞的表達有以下特點:①原核生物只有一種RNA 聚合酶(真核細胞有三種)識別原
上一期為大家介紹了過去一年里CRISPR技術在動物造模及單堿基技術方面取得的重大突破。本期繼續為大家從功能基因組篩選、細胞譜系示蹤及疾病診斷方面談談CRISPR-Cas系統的技術運用。 一、大規模基因功能的篩選 盡管測序和基因組編輯技術取得了重大進展,但是解析復雜的基因型-表型關系仍
上一期為大家介紹了過去一年里CRISPR技術在動物造模及單堿基技術方面取得的重大突破。本期繼續為大家從功能基因組篩選、細胞譜系示蹤及疾病診斷方面談談CRISPR-Cas系統的技術運用。 一、大規模基因功能的篩選 盡管測序和基因組編輯技術取得了重大進展,但是解析復雜的基
在血液中循環的細胞具有多種功能,在成年人機體中,其來自于骨髓中的祖細胞,祖細胞中DNA序列的突變會引發血細胞發育的改變,有時候會導致癌癥發生;由于技術限制,科學家們在闡明祖細胞突變對血細胞發育的影響上面對一定的挑戰,近日,研究者Nam等人在Nature雜志上發表文章指出,他們開發了一種新方法能夠
在雙鏈 DNA 分子中,只有一條鏈轉錄成 mRNA,這條鏈稱為有意義鏈(sense strand),該基因的另一條鏈則稱反意義鏈(antisense strand)。在含有許多基因的 DNA 雙鏈中,每個基因的有意義鏈并不是在同一條 DNA 鏈上。也就是說,一條鏈上既具有某些基因的有意義鏈,
為了保護他人而改變自己的身份,聽起來像是漫畫書里的“義務警員(vigilantes)”才會做的事情,但是,在一項新的研究中,來自美國斯坦福大學醫學院的研究人員發現,動脈壁上的一組細胞正是這樣做的。對于這些細胞而言,身份轉變發生在一種稱為動脈粥樣硬化的疾病中。當動脈被脂肪、膽固醇和分子顆粒堆積在一