美國FDA關于提交抗病毒藥物二代測序數據要求概述
2019年7月，美國食品藥品監督管理局（FDA）發布了關于抗病毒藥物產品提交二代測序數據的指南。指南為抗病毒藥物產品向FDA提交二代核苷酸序列分析程序以及支持耐藥性評估數據提供了意見。 一、背景信息 為保護公共衛生、避免出現可能傳染他人并導致不能通過已批準藥物產品控制疾病暴發的新型耐藥和交叉耐藥病毒變異體，提供準確的耐藥性信息勢在必行。 FDA對開發中的抗病毒藥物產品相關的耐藥性數據進行獨立分析，從而確保在新審批的抗病毒藥物產品說明書中對產品耐藥性進行表征分析和解釋。此外，FDA要求將宿主靶向基因的核苷酸序列分析數據用于多態性分析，以此確定基于不同種群的等位基因是否對療效有影響。 二、二代數據提交要求 FDA要求申請人應當提交詳細的方案來描述樣本處理和二代測序技術（NGS）分析程序。同時每個研究的數據應提供基于種群測序、適合分析的病毒耐藥性數據格式，顯示基線和無效序列，并在氨基酸與參考序列相同時使用空白細胞。FDA......閱讀全文
美國FDA關于提交抗病毒藥物二代測序數據要求概述
2019年7月，美國食品藥品監督管理局（FDA）發布了關于抗病毒藥物產品提交二代測序數據的指南。指南為抗病毒藥物產品向FDA提交二代核苷酸序列分析程序以及支持耐藥性評估數據提供了意見。 一、背景信息 為保護公共衛生、避免出現可能傳染他人并導致不能通過已批準藥物產品控制疾病暴發的新型耐藥和交叉
二代測序技術
人們常說“事后諸葛亮”，可見“料事如神”是一個讓人艷羨的能力。現代科技的發展讓人們無限接近這種能力，天氣預報就是現代人諸多“料事如神”本領中的一種，不斷進步中切實提高了生活品質與舒適度。個人體會進步主要體現在兩個方面：1.越來越說人話。印象里小時候聽天氣預報感覺聽的是中文，但是這些中國話想表達什么聽
二代測序原理
第二代測序（Next-generation sequencing，NGS）又稱為高通量測序（High-throughput sequencing），是基于PCR和基因芯片發展而來的DNA測序技術。我們都知道一代測序為合成終止測序，而二代測序開創性的引入了可逆終止末端，從而實現邊合成邊測序（Seque
Thermo公司已完成二代測序儀申報工作－有望獲FDA批準
美國 Thermo Fisher生命科學公司今天宣稱,其下一代高通量測序儀 Ion PGM Dx 的申報工作已經結束。美國FDA計劃將Ion PGM Dx 作為二類醫療器械進行批準上市。 將如同之前illumina的 MiSeqDx測序儀一樣， Thermo公司將Ion PGM Dx測序儀直接
FDA批準首個基于二代測序（NGS）的伴隨診斷試劑盒
2016年12月19日，美國食品和藥物管理局（FDA）批準了Foundation Medicine公司的FoundationFocus CDxBRCA產品，成為市場上第一個基于二代測序的伴隨診斷試劑盒。 該產品被批準用于鑒定攜帶BRCA突變的晚期卵巢癌患者，這些患者更易對Clovis Onco
不卑不亢看待二代測序
人們常說“事后諸葛亮”，可見“料事如神”是一個讓人艷羨的能力。現代科技的發展讓人們無限接近這種能力，天氣預報就是現代人諸多“料事如神”本領中的一種，不斷進步中切實提高了生活品質與舒適度。個人體會進步主要體現在兩個方面： 1.越來越說人話。印象里小時候聽天氣預報感覺聽的是中文，但是這些中國話想表
二代測序及其應用
二代測序為高通量測序，采用微珠或高密度芯片邊合成邊測序，代表有454，solexa，solid，高通量，可一次獲得數G數據，相對與第三代，都仍然需要擴增的方法放大信號，擴增后再檢測。二代測序應用如下：1、Illumina 原理：橋式PCR+4色熒光可逆終止+激光掃描成像。2、Roche 454：油包
二代測序及其應用
二代測序為高通量測序，采用微珠或高密度芯片邊合成邊測序，代表有454，solexa，solid，高通量，可一次獲得數G數據，相對與第三代，都仍然需要擴增的方法放大信號，擴增后再檢測。二代測序應用如下：1、Illumina 原理：橋式PCR+4色熒光可逆終止+激光掃描成像。2、Roche 454：油包
二代測序在腫瘤治療研究項目中的應用及數據
GenomeWeb芝加哥訊 – 本周美國臨床腫瘤學會年度會議中展示的研究項目包括了來自于部分研究項目的大量數據，這些研究項目均使用了二代測序技術來指導對腫瘤患者的治療方法。?研究結果表明，正如之前科學界已報道的那樣，NGS panel及更廣泛的測序方法可以在很多情況下的少部分（有時是多數）患者中鑒別
美國消費者聯盟要求FDA重新調查焦糖色素
據美國食品安全新聞網1月24日消息，美國食品和藥物管理局(FDA)計劃重新調查飲料及食品中的焦糖色素，因焦糖色素副產品4-甲基咪唑可能誘發癌癥。 美國FDA此舉是為了回應本周四《消費者報告》發布的一項調查結果。《消費者報告》由美國消費者聯盟(Consumers Union)主辦出版。
診斷性二代測序指南
?? 通過二代測序（next-generation sequencing，NGS）能夠快速地對某個個體患者的數千個甚至數百萬個DNA堿基對進行測序。這一技術快速出現并且獲得成功，這預示著一個遺傳學診斷的新的時代的到來。但是，新技術也帶來了新的挑戰，一方面是技術層面上的，即數據處理問題，另一方
二代測序分析未來如何
二代測序數據分析越來越熱但是我覺得雖然在這個大環境下還是應該冷靜思考一下。數據分析和數據分析員，我覺得要先弄清這兩者的區別，數據分析，現在注重的算法和生物學的結合，優化現有的分析流程和對大數據背景下的深度挖掘（其實對計算機和算法的要求更高一些），如果數據分析員其實說白了就是一個重復分析流程的搬磚工。
什么是基因二代測序
第二代測序為高通量測序，采用微珠或高密度芯片邊合成邊測序，代表有454，solexa，solid，高通量，可一次獲得數G數據，相對與第三代，都仍然需要擴增的方法放大信號，擴增后再檢測。第二代測序技術的核心思想是邊合成邊測序（Sequencing by Synthesis），即通過捕捉新合成的末端的標
什么是二代測序技術
二代測序技術又稱為高通過量測序技術，是對傳統Sanger測序（稱為一代測序技術）革命性的改變。二代測序技術的核心思想是邊合成邊測序，可以一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定，所以又被稱深度測序。由于二代測序技術具有多樣本、多位點同時進行測序并且具有較高的覆蓋率等優勢，在生命科學領域已經被
什么是二代測序技術
二代測序技術又稱為高通過量測序技術，是對傳統Sanger測序（稱為一代測序技術）革命性的改變。二代測序技術的核心思想是邊合成邊測序，可以一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定，所以又被稱深度測序。由于二代測序技術具有多樣本、多位點同時進行測序并且具有較高的覆蓋率等優勢，在生命科學領域已經被
二代測序原理及應用
二代測序原理及應用如下：一、原理二代測序原理也就是文庫構建，PCR產生的片段或基因組打斷的片段兩端需要添加接頭修飾才能進行測序。1、末端修飾。打斷的片段是隨機斷裂，其末端可能是不平的。因此，建庫第一步是補齊不平的末端。2、添加接頭。經過末端修飾后的DNA片段3’末端具有突出的A尾，而接頭具有突出的T
高通量測序技術——第二代測序技術
高通量測序技術是對傳統測序一次革命性的改變，一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定，因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(next generation sequencing)足見其劃時代的改變，同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能，所以又被稱為深度測序(de
一代測序和二代測序的區別
一、含義不同：第一代測序：指雙脫氧末端終止法，擴增后通過毛細管電泳讀取序列，每次獲取數據量少。第二代測序：為高通量測序，采用微珠或高密度芯片邊合成邊測序，代表有454，solexa，solid，高通量，可一次獲得數G數據，相對與第三代，都仍然需要擴增的方法放大信號，擴增后再檢測。二、作用不同：San
第二代DNA測序技術
DNA總的說來，第一代測序技術的主要特點是測序讀長可達1000bp，準確性高達99.999%，但其測序成本高，通量低等方面的缺點，嚴重影響了其真正大規模的應用。因而第一代測序技術并不是最理想的測序方法。經過不斷的技術開發和改進，以Roche公司的454技術、illumina公司的Solexa，His
第二代測序（NGS）技術
二代測序是一個強大的功能平臺，它可以同時給數以萬計的DNA分子進行測序。由于這種可以多個樣本同時測序的能力，在個性化醫療、遺傳疾病和臨床診斷等方面，二代測序也就是高通量測序開創了革命性的領域。 早在1900年代就發明的Sanger測序法，成為了DNA測序的黃金法則，即便到了今天它仍被廣泛用來進
單基因檢測和二代測序
在肺癌患者中，有一批攜帶驅動基因突變的患者，在治療上可以針對突變的基因采用靶向治療。在預后上，這部分患者也往往具有較長的生存期。目前，指南推薦了9個靶向治療的相關基因，他們分別是：EGFR、ALK、ROS1、Her2、KRAS、MET、RET、BRAF和最近一年剛進入指南的NTRK基因。為了識別這一
美國協會CRN要求FDA修改療效食品指南的限制條件
據營養配料網消息，美國協會CRN向FDA提交評論書，闡述了療效食品最初的定義，并審查了FDA的分類方法。CRN對FDA療效食品指南的大部分內容表示了贊同。 FDA在療效食品指南中得出結論，療效食品的銷售僅針對疾病，并且是在膳食管理中通過正常飲食不能獲得療效的情況下。CRN提出意見認為，FD
一代測序，二代測序，三代測序的優點缺點
一代測序，二代測序，三代測序的優點缺點分別介紹如下：一代測序優點是讀長較長、準確性高。缺點是測序成本高、通量低，使得de novo測序、轉錄組測序等應用難以普及。二代測序優點是相比一代測序大幅降低了成本，保持了較高準確性，并且大幅降低了測序時間，將一個人類基因組從3年降為1周以內。缺點是序列讀長方面
一代測序，二代測序，三代測序的優點缺點
一代測序，二代測序，三代測序的優點缺點分別介紹如下：一代測序優點是讀長較長、準確性高。缺點是測序成本高、通量低，使得de novo測序、轉錄組測序等應用難以普及。二代測序優點是相比一代測序大幅降低了成本，保持了較高準確性，并且大幅降低了測序時間，將一個人類基因組從3年降為1周以內。缺點是序列讀長方面
美國擬發布抗菌農藥的數據要求技術修訂規則
美國聯邦公報6月2日消息，根據聯邦殺蟲劑，殺菌劑和殺鼠劑法案要求，美國EPA正式向美國農業部（USDA）和美國衛生和人類服務部（HHS）提交了一個抗菌農藥的數據要求技術修訂規則草案。 該草案內容在EPA正式通過聯邦公報向公眾公布前，不對外公布。如USDA與HHS兩個部門沒有其他意見，該
二代測序的焦磷酸測序，合成法測序，連接法測序和離子半導體測序原理
不同的二代測序平臺的區別主要體現在測序反應的技術上，這些差別可以分為4類： 焦磷酸測序，合成法測序，連接法測序和離子半導體測序。焦磷酸測序 在焦磷酸測序中，測序反應通過每個核苷酸結合過程中釋放的焦磷酸來調控。釋放的焦磷酸參與了一系列化學反應從而導致鏈光的產生。發出的光由記錄基因蔟相應序列的相
一代測序技術，二代測序技術具有哪些優點
相比一代測序技術，二代測序技術優點如下：1、Illumina 原理：橋式PCR+4色熒光可逆終止+激光掃描成像優勢：Illumina的這種測序技術每次只添加一個dNTP的特點能夠很好的地解決同聚物長度的準確測量問題，它的主要測序錯誤來源是堿基的替換。而讀長短（200bp-500bp）也讓其應用有所局
一代測序、二代測序和三代測序各有什么優勢
一代測序、二代測序和三代測序的優勢如下：第一代測序：指雙脫氧末端終止法，（Sanger法）擴增后通過毛細管電泳讀取序列，每次獲取數據量少。優勢：由于ddNTP的2’和3’都不含羥基，其在DNA的合成過程中不能形成磷酸二酯鍵，因此可以用來中斷DNA合成反應。在4個DNA合成反應體系中分別加入一定比例帶
一代測序、二代測序及三代測序的應用對比
一、初現廬山真面目 一代測序：又稱Sanger測序(多分子，單克隆) 歷史：第一代DNA測序技術(又稱Sanger測序)在1975年，由Sanger等人開創，并在1977年完成第一個基因組序列(噬菌體X174)，全長5375個堿基。研究人員經過30年的實踐并對技術及測序策略的不斷改進(如使用
一代測序、二代測序及三代測序的應用對比
一、初現廬山真面目 一代測序：又稱Sanger測序(多分子，單克隆) 歷史：第一代DNA測序技術(又稱Sanger測序)在1975年，由Sanger等人開創，并在1977年完成第一個基因組序列(噬菌體X174)，全長5375個堿基。研究人員經過30年的實踐并對技術及測序策略的不斷改進(如使用