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  • 環狀RNA結合功能蛋白!找對方向20分文章水到渠成

    環狀RNA作為研究持續火熱的明星分子,不同于對其豐富的表達譜研究,環狀RNA功能機制研究還僅僅處在起步階段。環狀RNA研究多為miRNA海綿機制,部分circRNA可競爭性結合miRNA,解除miRNA對靶基因的抑制作用,上調靶基因的表達。其實,環狀RNA可以通過結合不同種類的功能蛋白,分別在轉錄前、后及翻譯水平嚴格調控細胞生殖生長等過程。云序曾對環狀RNA經典研究思路進行過詳細解析(2018國自然研究熱點—環狀RNA研究深度剖析),感興趣的老師可以查詢瀏覽。4月3日,知名免疫學雜志Immunity(IF:22.845)在線發表了中科院生物物理所范祖森教授與王碩研究員為共同通訊作者的文章,介紹發現環狀RNA Cia-cGAS定位于細胞核,可結合DNA敏感的cGAMP合酶cGAS并抑制其活性,調控長效造血干細胞(LT-HSC)靜息狀態。本文極大拓展了核內環狀RNA通過結合激酶發揮重要生理功能的研究思路。 研究背景: ......閱讀全文

    環狀RNA結合功能蛋白!找對方向20分文章水到渠成

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    環狀RNA結合功能蛋白!找對方向20分文章水到渠成

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    環狀RNA結合功能蛋白

    環狀RNA作為研究持續火熱的明星分子,不同于對其豐富的表達譜研究,環狀RNA功能機制研究還僅僅處在起步階段。環狀RNA研究多為miRNA海綿機制,部分circRNA可競爭性結合miRNA,解除miRNA對靶基因的抑制作用,上調靶基因的表達。其實,環狀RNA可以通過結合不同種類的功能蛋白,分別在轉錄前

    環狀RNA研究文章匯總(二)

    4.世界首篇人膠質瘤環狀RNA研究(影響因子:3.0)膠質瘤作為最常見的顱內惡性腫瘤占顱腦腫瘤的40%~50%,電磁輻射等其他環境致癌因素會導致膠質瘤的發生,盡管手術切除、術后放療、藥物化療等方法可以作為主流的膠質瘤治療手段,但是多形性膠質母細胞瘤(GBM)的強侵襲、增殖能力仍給病人的治療造成很大的

    環狀RNA研究文章匯總(一)

    環狀RNA“一站式”服務一直以來是云序生物的主打產品,嚴格的質控把關、嚴謹的實驗設計、出色的生信分析以及貼心的售后服務造就了多項世界首篇環狀RNA研究文章,受到了廣大客戶的一致好評。迄今為止,云序已經積累了超過10000例環狀RNA測序的經驗,樣本覆蓋20多個物種以及50多種疾病,客戶發表文章達20

    環狀RNA高分文章怎么發?

    文章導讀環狀RNA作為最新發現的RNA分子,從誕生之日起就是光環加身,屢屢登上Science、Nature、Cell等高分期刊。近期發表的《2019研究前沿》中,“環狀RNA作為癌癥新的生物標志物”成為生物科學領域6個新興前沿之一。2019年環狀RNA共發表SCI論文885篇,較2018年增長約20

    云序生物環狀RNA研究文章匯總

      環狀RNA“一站式”服務一直以來是云序生物的主打產品,嚴格的質控把關、嚴謹的實驗設計、出色的生信分析以及貼心的售后服務造就了多項世界首篇環狀RNA研究文章,受到了廣大客戶的一致好評。迄今為止,云序已經積累了超過10000例環狀RNA測序的經驗,樣本覆蓋20多個物種以及50多種疾病,客戶發表文章達

    影響因子高達7.8分的直腸癌轉移肝癌環狀RNA文章思路解析

      云序客戶發表首篇直腸癌轉移肝癌環狀RNA文章,影響因子高達7.8分!?   文章導讀:   在非編碼RNA的大家族中,環狀RNA是近年來繼microRNA和lncRNA之后又一個明星成員。因其3’-5’端成環,所以在生物體中具有穩定性高,不易被降解的特性。大部分環狀RNA通過直接或間接調控m

    云序生物客戶發表的首篇吉西他濱耐藥胰腺導管癌環狀RNA

      本篇文章主要研究的藥物是吉西他濱,其主要應用于晚期胰腺癌病人的治療,可是若病人對此類藥物產生了耐藥反應,那勢必會影響患者的生活質量,甚至生命。目前,對于吉西他濱對胰腺癌耐藥機制研究尚不明朗。作者首先構建了對吉西他濱耐藥細胞系,并通過全轉錄組測序比較了耐藥與正常細胞系之間環狀RNA的表達譜。通過生

    2020年環狀RNA高分文章怎么發?

      環狀RNA作為最新發現的RNA分子,從誕生之日起就是光環加身,屢屢登上Science、Nature、Cell等高分期刊。近期發表的《2019研究前沿》中,“環狀RNA作為癌癥新的生物標志物”成為生物科學領域6個新興前沿之一。2019年環狀RNA共發表SCI論文885篇,較2018年增長約20%,

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    吉西他濱耐藥胰腺導管癌環狀RNA文章導讀

    文章導讀:本篇文章主要研究的藥物是吉西他濱,其主要應用于晚期胰腺癌病人的治療,可是若病人對此類藥物產生了耐藥反應,那勢必會影響患者的生活質量,甚至生命。目前,對于吉西他濱對胰腺癌耐藥機制研究尚不明朗。作者首先構建了對吉西他濱耐藥細胞系,并通過全轉錄組測序比較了耐藥與正常細胞系之間環狀RNA的表達譜。

    誘騙RNA結合蛋白不與癌細胞中的天然RNA分子結合

      科學家也開始變得“狡猾”,開始用欺騙來對抗癌癥。希伯萊大學的研究人員發明了一種誘餌,可以阻止癌癥用于轉移的RNA結合蛋白。  近年來,RNA結合蛋白在腫瘤生長中起著重要作用已經成為不爭的事實。這些蛋白在所有細胞中都很活躍,尤其是在癌細胞中,它們與RNA分子結合,加速癌細胞的生長。不幸的是,目前還

    環狀RNA研究的方法及功能作用(二)

    RNA是怎樣變成環狀的呢?a. 在可變剪切過程中,外顯子遷移,剪切形成套索結構,拉近剪切位點,促進序列成環b. 依賴鄰近的反向互補序列配對,拉近剪切位點,使其相互攻擊,促進序列成環c. 單個內含子直接成環d. RNA結合蛋白、反式作用因子參與成環研究功能,敲降看看據文獻報道,環狀RNA可以被小干擾R

    Nat-Rev-Genetics-|-環狀RNA的合成與功能

      環狀RNA(circular RNA,circRNA)是一種新興的內源性非編碼RNA(noncoding RNA,ncRNA),是繼microRNA (miRNA)以及long noncoding RNA (IncRNA)后非編碼RNA家族中極具研究潛力的新成員。越來越多的研究表明,環狀RNA具

    環狀RNA研究的方法及功能作用(一)

    環狀RNA—隱秘的未知RNA平行宇宙環狀RNA,被喻是隱秘的未知RNA平行宇宙。最近,復旦大學的鄭秋鵬博士(2016交流會嘉賓之一)以第一作者身份在Nature Communications上發布了他們關于circHIPK3的最新研究成果。現在就和小編一起來學習circRNA的研究思路,認識圓圈重塑

    Cell》重磅!全轉錄組測序技術揭示circRNA新的調控機制!

      2月7日,加拿大多倫多大學的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授團隊對144例前列腺癌樣本進行全轉錄組測序,結合后續的功能機制研究,揭示了前列腺癌circRNA新的調控機制!該研究成果以題為“Widespread and Functional RNA Ci

    找對研究對象輕松發20分文章

      臨床醫生朋友們是否還苦于寫課題文章沒有好的思路?Dr.S教你一招吃遍天,在上一期中,我們的Dr.S已經給大家介紹了肝癌經典有效的研究方法,今天咱們介紹一下白血病,分析一篇2017年發表在Cancer Cell(IF=23.214分)上的文章,還是用我們經典的ABCD四要素模式來分析。這次的側重點

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    推動癌癥發展的RNA結合蛋白

      最近,一項關于白血病細胞基因表達的研究,發現了一種RNA結合蛋白,在推動癌癥的發展過程中起著重要的作用。該蛋白通常活躍在胎兒組織,在成年人體內是關閉的,但它在一些癌細胞中被再度活化。這種表達模式使它成為抗癌藥物的一個有吸引力的靶標,因為阻斷它的活動,不太可能造成嚴重的副作用。  這項新的研究,發

    環狀RNA研究深度剖析

      1.環狀RNA為什么火?它到底是何方神圣?   2013年兩篇Nature[1][2]文章的出世,徹底顛覆了我們對RNA的傳統認知,同時也迅速引爆了整個生物醫學界!經過嚴格統計匯總后,2017年國家自然科學金獲批的項目中環狀RNA研究相關的項目總數高達176項,其中有兩項杰出青年基金,一項優秀

    2018國自然研究熱點一:環狀RNA研究深度剖析

      1.環狀RNA為什么火?它到底是何方神圣?   2013年兩篇Nature[1][2]文章的出世,徹底顛覆了我們對RNA的傳統認知,同時也迅速引爆了整個生物醫學界!經過嚴格統計匯總后,2017年國家自然科學金獲批的項目中環狀RNA研究相關的項目總數高達176項,其中有兩項杰出青年基金,一項優秀

    云序環狀RNA研究策略在環狀RNA研究的應用(一)

    環狀RNA作為新發現的RNA分子,從誕生之日起就是光環加身,屢屢登上Science、Nature、Cell等高分期刊。近期發表的《2019研究前沿》中,“環狀RNA作為癌癥新的生物標志物”成為生物科學領域6個新興前沿之一。2019年環狀RNA共發表SCI論文885篇,較2018年增長約20%,其中大

    云序環狀RNA研究策略在環狀RNA研究的應用(二)

    4.對年齡相關性白內障circRNA的分析顯示,circZNF292可以通過海綿機制調節miR-23b-3p功能發表期刊:Aging-us影響因子:4.831發表時間:2020.9.10研究方法:全轉錄組測序、qRT-PCR、RIP、RNA pull down、雙熒光素酶實驗等云序提供文章鏈接:Pr

    環狀-RNA-測序案例分析

    案例:以結腸癌,卵巢癌,特發性肺纖維化及正常的人組織為例探討 circular RNAs 的富集與增殖的相關性 背景:最新研究表明,circular RNAs 大量存在,是構成生物體 RNA 網絡的一部分,而且研究者們推測 circular RNAs 與 miRNAs 一樣具有生物學功能。 目的

    環狀RNA研究方法(二)

    在此基礎上,哪些環狀RNA分子發生了差異表達?在這里火山圖、Venn圖應有盡有。根據p=2的標準,一共發現42個環狀發生上調,47個環狀發生下調。?圖3. 差異環狀RNA的篩選2. 差異環狀RNA分子的qPCR驗證對于一篇做譜的文章,差異環狀RNA的結果驗證只需做到qPCR即可。對5個上調和5個下調

    環狀RNA研究方法(一)

    至2015起云序生物已經完成10000+例環狀RNA全轉錄組測序服務,涵蓋了50+疾病,20+物種,幫助眾多客戶在環狀RNA分子的研究中取得突破性進展。客戶發表的環狀RNA文章高達20篇以上。此外云序生物還提供環狀RNA機制研究手段,rip&RNA pull down技術,幫助客戶沖刺高分機制文章。

    環狀RNA研究深度剖析(一)

    1.環狀RNA為什么火?它到底是何方神圣?2013年兩篇Nature[1][2]文章的出世,徹底顛覆了我們對RNA的傳統認知,同時也迅速引爆了整個生物醫學界!經過嚴格統計匯總后,2017年國家自然科學金獲批的項目中環狀RNA研究相關的項目總數高達176項,其中有兩項杰出青年基金,一項優秀青年基金,兩

    RIP技術(RNA結合蛋白免疫沉淀)

    RIP技術(RNA Binding Protein Immunoprecipitation,RNA結合蛋白免疫沉淀),是研究細胞內RNA與蛋白結合情況的技術,是了解轉錄后調控網絡動態過程的有力工具,能幫助我們發現miRNA的調節靶點。RIP這種新興的技術運用針對目標蛋白的抗體把相應的RNA-蛋白復合

    環狀RNA(circRNA)功能研究又一利器——過表達載體

    circRNAs 環狀 RNA(circular RNAs,circRNA)是一類具有閉合環狀結構的 RNA 分子,早在 20 世紀八十年代即有研究報道,但由于其表達豐度低,文獻報道較少,一直被認為是 RNA 轉錄剪切的罕見錯誤而被忽視。直到 2012 年開始有研究者開始大批量鑒定 circRN

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