基因組文庫法
基因組文庫法一）基因組DNA分離、純化和加工[Mbo I酶檢測]1．準備1.5ml小試管4個；每管內含有：基因組DNA（在TE或水中） 10.0μg10×Mbo I緩沖液 2.5μlH2O &nbs......閱讀全文
基因組文庫法
基因組文庫法一）基因組DNA分離、純化和加工[Mbo I酶檢測]1．準備1.5ml小試管4個；每管內含有：基因組DNA（在TE或水中）?????????????10.0μg10×Mbo I緩沖液?????????????????????????2.5μlH2O????????????????????
基因組文庫和cDNA文庫的構建及篩選
劉芝華 中國醫學科學院腫瘤研究所??分子腫瘤學國家重點實驗室?概念：?基因組文庫是含有某種生物體全部基因的隨機片段的重組DNA克隆群體；cDNA文庫是指含有所有重組cDNA的克隆群體。???基因組文庫：來源于基因組DNA，反映基因組的全部信息，用于基因組物理圖譜的構建，基因組序列分析，基因在染色體上
基因組文庫的擴增實驗
通過平板培養可對重組噬菌體文庫進行擴增，平板培養的原種可直接來源于本方案所述的包裝混合物。但只要可能，該擴增過程可被省略，而感興趣的 DNA 序列可從原始文庫直接篩選。擴增將不可避免地降低文庫的復雜性，部分原因在于在連續幾輪的噬菌體生長中，對生長緩慢的重組噬菌體來說是十分不利的。本實驗來源「分子克隆
基因組文庫的擴增實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 通過平板培養可對重組噬菌體文庫進行擴增，平板培養的原種可直接來源于本方案所述的包裝混合物。但只要可能，該擴增過程可被省略，而感興趣的 DNA 序列可從原始文庫直接篩選。擴增將不可避免地降低文庫的復雜性，部分原因在于在連續
基因組文庫的擴增實驗
實驗方法原理 通過平板培養可對重組噬菌體文庫進行擴增，平板培養的原種可直接來源于本方案所述的包裝混合物。但只要可能，該擴增過程可被省略，而感興趣的 DNA 序列可從原始文庫直接篩選。擴增將不可避免地降低文庫的復雜性，部分原因在于在連續幾輪的噬菌體生長中，對生長緩慢的重組噬菌體來說是十分不利的
差減cDNA文庫法
差減cDNA文庫法[第一條鏈cDNA合成]1．合成第一條cDNA鏈時，所有試劑應按下列順序依次加入：10×第一條鏈合成緩沖液?????????????????5.0μl10mM dNTP Mix(1.4μg/μl)???????????????2.5μl(終濃度1.25mM)Linker prime
構建小鼠基因組CRISPR導向RNAs文庫
研究人員開發出一種方法，構建出了一個可誘導小鼠基因組全基因靶向突變的CRISPR導向RNA(gRNAs)綜合文庫。人們可利用這一文庫來調查不同細胞類型中每個基因的作用。這一突破性的研究成果在線發表在12月23日的《自然生物技術》(Nature Biotechnology)雜志上。 CR
基因組DNA文庫構建必備實驗技巧
基因組DNA文庫用途十分廣泛，如用于人類及動植物基因組學研究，基因表達調控研究，分析、分離特定的基因片段等。通常情況下，基因組文庫構建的基本流程可以歸為四大步驟：分離基因組DNA、對基因組DNA作相關的處理、將基因組DNA片段連接入載體、將重組載體轉入宿主細胞。一、分離基因組DNA（gDNA） 毫無
基因組DNA文庫構建的基本流程
基因組 ?DNA文庫有十分廣泛的用途，如用于分析、分離特定的基因片段，用以基因表達調控、人類及動植物基因組工程的研究。通常情況下，基因組文庫構建的基本流程可以歸為4大步驟：分離基因組DNA、對基因組DNA作相關的處理、將基因組DNA片段連接入載體、將重組載體轉入宿主細胞。 一、分離基因組DN
差減cDNA文庫法3
[大量制備生產單鏈噬菌體DNA]1.新鮮過夜培養的宿主菌XLI-Blue，以1：20稀釋在LB培養液中，在37℃培養擴增2小時。2.加1ml含單鏈cDNA的上清液。3.再于37℃繼續培養2小時。4.然后將全部溶液轉到500~1000mlLB中，生長5~6小時。5.9500rpm離心60分鐘，除去細菌
差減cDNA文庫法2
[cDNA末端磷酸化]1.70℃滅活反應后，稍微離心一下，置室溫5分鐘。2.在反應混合物（10μl）中加入：1μl10×連接緩沖液2μl10mMATP1μl（10μ）DNA激酶 [限制性內切酶消化]以得到粘性末端 1.限制性內切酶消化DNA和載體。 2.在37℃保溫1~5小時，然后冷卻到
差減cDNA文庫法1
[第一條鏈cDNA合成] 1.合成第一條cDNA鏈時，所有試劑應按下列順序依次加入： 10×第一條鏈合成緩沖液5.0μl 10mMdNTPMix(1.4μg/μl)2.5μl(終濃度1.25mM) Linkerprimer(1.4μl，終濃度100μg/μl) DEP
應用黏粒載體構建基因組DNA文庫
在 λ 噬菌體中構建基因組 DNA 文庫的步驟與在黏粒載體中的步驟基本一致。在這兩種系統中，真核 DNA 在體外與載體 DNA 連接，形成能包裝到 λ 噬菌體顆粒中的多聯體。構建在 λ 噬菌體中的文庫以具有感染性的重組噬菌體形式貯存和增殖。本實驗來源「分子克隆實驗指南第三版」黃培堂等譯。實驗方法原理
應用黏粒載體構建基因組DNA文庫
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 在 λ 噬菌體中構建基因組 DNA 文庫的步驟與在黏粒載體中的步驟基本一致。在這兩種系統中，真核 DNA 在體外與載體 DNA 連接，形成能包裝到 λ 噬菌體顆粒中的多聯體。構建在 λ 噬菌體中的文庫以具有感染性的重組噬菌體
基因組DNA文庫構建必備實驗技巧2
技術支持資料：材料緩沖液和溶液- 堿裂解液I , 4°C50 mM 葡萄糖25 mM Tris-Cl (pH 8.0)10 mM EDTA (pH 8.0)配制堿裂解液I 約100ml，滅菌，保存在四度。- 堿裂解液II，新鮮配置，室溫保存0.2 N NaOH （從10N的NaOH新鮮制備）1% (
應用黏粒載體構建基因組DNA文庫
實驗方法原理 在 λ 噬菌體中構建基因組 DNA 文庫的步驟與在黏粒載體中的步驟基本一致。在這兩種系統中，真核 DNA 在體外與載體 DNA 連接，形成能包裝到 λ 噬菌體顆粒中的多聯體。構建在 λ 噬菌體中的文庫以具有感染性的重組噬菌體形式貯存和增殖。實驗材料 T4 噬菌體 DNA 連接酶牛小腸堿
基因組DNA文庫構建必備實驗技巧1
基因組DNA文庫用途十分廣泛，如用于人類及動植物基因組學研究，基因表達調控研究，分析、分離特定的基因片段等。通常情況下，基因組文庫構建的基本流程可以歸為四大步驟：分離基因組DNA、對基因組DNA作相關的處理、將基因組DNA片段連接入載體、將重組載體轉入宿主細胞。一、分離基因組DNA（gDNA） 毫無
用－PCR－控制基因組－DNA－文庫的質量實驗
在該方案中，用限制性內切酶的混合物處理人類基因組 DNA(內切酶混合物的識別位點為 4bp)，產生大概 50?500bp 的片段。最終使用這一類型的表達文庫，是通過利用表型的和生化的篩選方法，分離編碼功能多肽或蛋白片段的基因片段。用KlenowDNA 聚合酶處理后，基因組 DNA 片段成為平末端，然
消減－cDNA－或基因組－DNA－文庫的制備實驗
一次雙向消減，需要總量為 2ug 的基因組 DNA 或 cDNA。大多數分離 RNA 和基因組DNA 的方法都適用于本實驗（Sambrooketal.1989;ChomczynskiandSacchi1987;Farrell1993)。本實驗來源于 PCR 實驗指南（第二版），作者：種康，瞿禮嘉。試
消減－cDNA－或基因組－DNA－文庫的制備實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 緩沖液、溶液和試劑 酶和酶緩沖液 核酸和寡核苷酸 放射性化合物 酚 儀器、耗材
用－PCR－控制基因組－DNA－文庫的質量實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 ddH20 Vent 緩沖液 Vent DNA 聚合酶 dNTP 質粒 DNA PCR 引物
消減－cDNA－或基因組－DNA－文庫的制備實驗
試劑、試劑盒 緩沖液、溶液和試劑酶和酶緩沖液核酸和寡核苷酸放射性化合物酚儀器、耗材 熱循環儀水浴箱瓊脂糖凝膠電泳所需的試劑與設備實驗步驟 第1階段：RNA和DNA的分離一次雙向消減，需要總量為2ug的基因組DNA或cDNA。大多數分離RNA和基因組DNA的方法都適用于本實驗（Sambrooketal
用－PCR－控制基因組－DNA－文庫的質量實驗
試劑、試劑盒?ddH20Vent 緩沖液Vent DNA 聚合酶 dNTP質粒 DNAPCR 引物儀器、耗材?瓊脂糖凝膠電泳所需的試劑和設備熱循環儀實驗步驟?一、材料1. 緩沖液、溶液和試劑ddH202. 酶和酶緩沖液10X Vent 緩沖液Vent DNA 聚合酶3. 核酸和寡核苷酸dNTP，各
Nature子刊構建小鼠基因組CRISPR導向RNAs文庫
研究人員開發出一種方法，構建出了一個可誘導小鼠基因組全基因靶向突變的CRISPR導向RNA(gRNAs)綜合文庫。人們可利用這一文庫來調查不同細胞類型中每個基因的作用。這一突破性的研究成果在線發表在12月23日的《自然生物技術》(Nature Biotechnology)雜志上。 CR
科學狂人：文庫制備對宏基因組測序影響很大
我們體內生活著不計其數的微生物，它們組成的生態系統就是微生物組。近年來人們發現這些微生物對人體健康有著重要的影響，微生物組研究因此受到了極大的重視，甚至被稱為是人體的“第二基因組”。 微生物組參與了許多重要的機體功能，比如消化食物、合成營養物質和抵御疾病。許多人類疾病都與微生物組失衡有關。科學
基于堿基編輯的全基因組擾動文庫構建與篩選技術
通過全基因組規模擾動文庫的構建與篩選，從宏觀基因組層面系統研究基因型與表型的對應關系，是微生物功能基因組學研究的重要方法。相較于單個基因擾動文庫的構建與篩選，混合文庫的構建與篩選可通過一次實驗實現特定條件下對上千個基因的同時篩選，顯著提高通量。近年來，CRISPR/Cas技術憑借著精簡高效、可編
CDNA文庫
?CDNA文庫（主要內容如下）·?????????Construction of cDNA Library·?????????Construction of Genome DNA Library·?????????Library Screening??OthersConstruction of cD
Dharmacon文庫在RNAi文庫篩選的應用
1.什么是文庫？――大幅提高研究效率的利器以往的實驗室研究中，無論是尋找新基因的功能、探索已知基因致病的機制、解析復雜信號通路網絡、探索疾病發生發展的機制，藥物敏感性測試或者是尋找藥物開發的新靶點，科研工作者們往往是圍繞著潛在的單個目標基因進行改造，包括針對該基因的過表達、沉默、敲除、激活、修飾、突
cDNA文庫構建
cDNA文庫構建可以：（1）用于分離全長基因進而開展基因功能研究；（2）篩選目的基因并直接用于表達；（3）提供構建分子標記連鎖圖譜的所用探針。實驗方法原理cDNA 文庫是指某生物某發育時期所轉錄的全部 mRNA 經反轉錄形成的 cDNA 片段與某種載體連接而形成的克隆的集合。經典 cDNA 文庫構建
cDNA文庫構建
cDNA文庫[原理]：cDNA文庫不同于基因組文庫，被克隆DNA是從mRNA反轉錄來源的DNA。CDNA組成特點是其中不含有內含子和其他調控序列。從而做cDNA克隆時應是先從獲得mRNA開始，在此基礎上，通過反轉錄酶作用產生一條與mRNA相互補的DNA鏈，然后除掉mRNA，以第一條DNA鏈為模板復制