蛋白質組學的標準化(上)
Tim Wehr 由于人類基因序列的建立已經接近完成，人們認識到生物科學屆的下一項任務將是表征基因組的產物——其中絕大部分是蛋白質。作為正在興起的研究領域，蛋白質組學將其研究目標定位于：鑒定和測量在一個細胞或組織中的所有蛋白質，這樣做的預期是，將能發現那些能夠成為疾病生物標志物(biomarker)或藥物靶標的候選蛋白質。經證明，這是一項令人望而生畏的工作，難度之一在于，25,000個基因中的每一個都會產生拼接、翻譯后修飾，最后表達的蛋白質數量將會大大增加。另一個增加難度的因素是蛋白質的濃度范圍太廣——通常為許多個數量級——并且很可能大多數人們感興趣的都是那些低豐度的蛋白。 目前，已有大量的技術和實驗方法用于解決蛋白質組學的問題。其中應用最廣泛的是“自下而上”的方法。用蛋白質水解酶(典型的為胰蛋白酶)將細胞提取液或溶胞產物中的所有蛋白質酶解，接著用反相液相色譜(LC)分離，然后在線引入電噴霧源的質譜。一種參考的液......閱讀全文
ThermoFisher推出Proteome－Discoverer蛋白質組學軟件
Thermo Fisher推出Proteome Discoverer：前沿蛋白質組學研究的突破性生物軟件 質量信息學平臺提供了強大的分析、開放和靈活架構，易于使用的界面 2008年5月30日，圣何塞，服務科學，世界領先的賽默飛世爾科技公司，今天宣布將在ASMS 2008（第56屆美國質譜大會）上
質譜和蛋白質組學：擊中目標
Nature Methods - 5, 741 - 747 (2008)?? 作者：Nathan Blow?? 分析測試百科? 譯 ??? 近年來，質譜儀大幅提高了動態范圍和靈敏度，使研究者們在疾病生物標志物的發現和驗證方面，更從容地面對挑戰。 ??? 在2008年6月的美國質譜大會（ASMS）
Orbitrap質譜蛋白質組沙龍在京舉行
【導語】使用質譜儀器進行蛋白質組研究中有三個關鍵環節，第一個是樣品的處理階段，這是最簡單，也是最重要的一個步驟。第二個階段是儀器的操作部分，使用液相、質譜等儀器把蛋白質進行分離、分析。主要涉及儀器參數的優化調整。第三步是生物信息學分析部分，這也是最難的部分。本期沙龍中中科院生物物理所的
華盈視角：蛋白質組學——質譜技術
蛋白質作為功能的直接執行者，在生物醫學領域中有著重要意義，檢測蛋白質表達、修飾、互作等有助于我們理解生命機體的各類機制和活動規律，為疾病的治療、診斷，藥物的開發、優化等提供有力的支持。質譜技術作為檢測蛋白質組學的主流技術，有必要了解其核心原理，才能更好的服務于科學問題的解決。1.質譜的原理： 質譜是
定量蛋白質組學質譜采集技術進展（三）
然而PRM 的分析通量不如SRM。PRM 能同時監測最多10 ~15 個母離子,而SRM 能同時監測上百個離子對,因為高分辨質譜的有效掃描速度通常只有10 ~15 Hz,遠慢于SRM 的有效掃描速度。但是這一問題正逐步得到解決,多重累積(Multiplexing, MSX)技術的發展和使用有
定量蛋白質組學質譜采集技術進展（二）
同步母離子選擇(Synchronous precursor selection, SPS)技術的出現徹底解決了MS3 響應弱的問題。SPS 技術利用多頻切跡的選擇波形電壓(MultiNotch) [27] ,在線性離子阱中實現一次選擇同時獲得多個離子,最多可同時選擇15 個(圖2A)。利用這一原理,
定量蛋白質組學質譜采集技術進展（四）
無論是相對定量還是絕對定量方法,DIA很好地克服了DDA鳥槍法和SRM目標監測的種種不足, 在定量蛋白質組學中具有良好的應用前景。然而,目前DIA 方法的循環時間仍然較長,只能與納流液相聯用,并使用較長的梯度以獲得足夠的色譜峰寬,限制了DIA 的應用范圍。這也是DIA 技術下一步需要解決
定量蛋白質組學質譜采集技術進展（一）
摘要 質譜是定量蛋白組學的主要工具。近年來隨著定量蛋白質組學研究的深入,傳統質譜定量技術面臨著復雜基質干擾、分析通量限制等諸多問題。而最近一系列質譜新技術的發展,包括同步母離子選擇(SPS)、質量虧損標記、平行反應監測(PRM)、多重累積(MSX)和多種全新數據非依賴性采集(DIA)等,為解決目前蛋
蛋白質組質譜新方法一覽
2003年人類基因組精細圖繪制完成，是人類科學史上一個里程碑式的事件。后基因組時代的研究重點自然落在了蛋白質頭上。為啥？因為中心法則告訴我們，基因的產物——蛋白質，是生命活動的最終執行者。與基因組類比，研究生物體內全套蛋白質的科學，就是蛋白質組學。基因組計劃完成的同年，人類蛋白質組計劃啟動，令人激動
《自然》子刊專題：蛋白質組學中的質譜
涉及到蛋白質組學分析的研究人員都知道蛋白質組學研究的技術路線有兩條，一條是以雙向電泳加生物質譜的方法鑒定生物體系中各種蛋白的表達譜以及各蛋白表達程度的相對變化，另一條路線就是多維色譜與生物質譜相結合的稱之為鳥槍法的技術路線。其中質譜分析技術（Mass spectrometry，MS）是蛋白質組學常用
質譜技術在蛋白質組研究中的分析方法
2003年人類基因組精細圖繪制完成，是人類科學史上一個里程碑式的事件。后基因組時代的研究重點自然落在了蛋白質頭上。為啥？因為中心法則告訴我們，基因的產物——蛋白質，是生命活動的最終執行者。與基因組類比，研究生物體內全套蛋白質的科學，就是蛋白質組學。基因組計劃完成的同年，人類蛋白質組計劃啟動，令人激動
蛋白質質譜測序
蛋白質譜一般來講是用來對某個蛋白質進行鑒定的方法而蛋白質測序實際上就是檢測蛋白質的多肽鏈數目，不一定要用到質譜技術簡單說，蛋白質測序的方法有很多，一般是在構建完成后，通過測序來對比之前的預測的序列是否正確。而質譜檢測一般是用在蛋白質表達純化完成后，用來鑒定是否是最初設計的那個蛋白。
蛋白質組學的標準化(下)
蛋白質組學信息學研究組 蛋白質組學信息學研究組的任務是教育蛋白質組學研究實驗室最大程度地應用和實踐生物信息學方法，向精確和復雜的蛋白質組學數據分析方向發展。iPRG積極地支持和參與開發和提高新的算法、軟件工具以及蛋白質組信息學戰略，目標是向全體會員教育和介紹這些新技術。iPRG已經發起了兩
蛋白質組學的標準化(上)
Tim Wehr 由于人類基因序列的建立已經接近完成，人們認識到生物科學屆的下一項任務將是表征基因組的產物——其中絕大部分是蛋白質。作為正在興起的研究領域，蛋白質組學將其研究目標定位于：鑒定和測量在一個細胞或組織中的所有蛋白質，這樣做的預期是，將能發現那些能夠成為疾病生物標志物(bioma
質譜組學，引領精準
8月，上海。炎炎夏日，驕陽似火，正值生機盎然的季節，一場造福行業發展的合作協議今日于上海簽訂。賽默飛世爾科技（中國）有限公司和上海中科新生命生物科技有限公司在多組學及精準醫療領域，建立戰略合作伙伴關系。出席本次簽訂協議的嘉賓有賽默飛世爾科技（中國）有限公司商務運營副總裁馮時瀚先生、上海中科新生命
基于質譜的空間蛋白質組學系統研究方法
蛋白質亞細胞定位及其動態變化過程對于蛋白質功能至關重要。隨著鳥槍法蛋白質組學的發展，通過亞細胞分離及質譜技術同時測定數千個蛋白質穩態定位的“蛋白質組學顯微鏡(proteomic microscope)”出現了。然而，表征因擾動導致的亞細胞定位變化的工具卻一直局限在光學顯微鏡，每次僅能成像一個或幾
質譜技術在蛋白質組研究中的分析方法介紹
2003年人類基因組精細圖繪制完成，是人類科學史上一個里程碑式的事件。后基因組時代的研究重點自然落在了蛋白質頭上。為啥？因為中心法則告訴我們，基因的產物——蛋白質，是生命活動的最終執行者。與基因組類比，研究生物體內全套蛋白質的科學，就是蛋白質組學。基因組計劃完成的同年，人類蛋白質組計劃啟動，令人
AB－SCIEX三大質譜平臺支撐蛋白質組學研究
2010年10月18~19日，由國家自然科學基金委、中國化學會分析化學委員會主辦，復旦大學、上海交通大學承辦的2010年微納尺度分離和分析技術學術會議暨第六屆全國微全分析學術會議在上海復旦大學復宣大酒店隆重召開。來自全國高等院校、科研機構、企事業單位的300余名專家學者出席了本次會議。
“組學國標”項目結碩果：最精準的mRNA測序與蛋白質組質譜
二代測序、蛋白質組質譜，這些“高大上”的組學手段早已不是稀罕事，使人們對生命和疾病的理解進入了一個嶄新的時代。這些組學技術大量用于科研的同時，在應用領域卻陷入了巨大的困境。 蛋白質組質譜技術和RNA測序目前幾乎沒有任何值得一提的臨床應用，即便是在臨床應用得相對較多的DNA測序，也飽受重復性差、
質譜技術幫助科學家發現蛋白質組學重要成果
最近，來自瑞士和荷蘭的科學家，對在22種不同生長條件下大腸桿菌表達的蛋白質，進行了定量和定性分析。確定了超過2300個蛋白質，其中一些處于每個細胞一個副本的平均水平。由此產生的數據集描述了細胞中大多數(> 90%)的蛋白質量，對細胞生物學家來說這將是一個寶藏。相關研究結果發表在十二月出版的《Na
AB－SCIEX推出創新的蛋白質組學質譜應用新技術
將與蘇黎世聯邦理工學院通力合作，專注發展 TripleTOF 5600 系統上的 SWATH? 采集方式，來研究全面的系統蛋白質組學 馬薩諸塞州弗雷明漢市2011年6月7日電 /美通社亞洲/? --蘇黎世聯邦理工學院及 AB SCIEX（全球領
綜述：基于質譜技術的糖蛋白質組學與糖組學研究進展
糖是組成生命體的四大類重要分子之一，糖蛋白質是由糖鏈與肽鏈中的特定氨基酸殘基以糖苷鍵共價連接而成的蛋白質。糖蛋白質普遍存在于生物體內，在很多生命過程中起著重要作用，如蛋白質的折疊、細胞之間的相互識別、炎癥反應等。同時，糖基化修飾在疾病中，特別是腫瘤的發生、發展和轉移過程中也起到重要作用，許多疾
杭州質譜學術大會系列：Astral突破質譜組學新極限
——2020-2023杭州質譜學術大會系列報導 6月11日，中國質譜學術大會 “新方法與新技術”專場報告中，來自北京生命科學研究所董夢秋研究員、中科院大連化物所張麗華研究員、南京大學鞠幌先教授、賽默飛應用主管范自全等專家、學者和企業代表帶來了關于蛋白質相互作用、結構分析的最新質譜檢測方法與應用
蛋白質組學質譜分析
Proteomics Primer1. Proteomics2. 2-D PAGE3. Immobilised pH gradients (IPGs)4. Mass spectrometry5. Principles of mass spectrometry6. Matrix assisted la
ASMS－2018賽默飛世爾科技揭曉串聯質譜格蘭特獎
——國際競爭獎頒給四位在蛋白質組學領域具有杰出影響力的科學家 分析測試百科網訊 2018年6月4日，在圣地亞哥ASMS 2018上，賽默飛世爾科技將在美國當地時間2018年6月6日，與ASMS共同舉辦的第66屆早餐研討會上宣布2018年賽默飛串聯質譜研究獎的獲獎者名單。 現在，該獎項已經進入
質譜技術助力全新定量蛋白質組數據差異分析計算模型
8月13日，國際學術期刊Cell Discovery 在線發表了中國科學院上海營養與健康研究所中科院計算生物學重點實驗室（馬普計算生物學研究所）邵振課題組研究論文“MAP: model-based analysis of proteomic data to detect proteins wit
賽默飛在ASMS發布Orbitrap－Eclipse質譜－激活高端蛋白質組研究
分析測試百科網訊 2019年6月3日，賽默飛在ASMS 2019大會推出全新的Orbitrap Eclipse三合一超高分辨質譜儀，通過智能數據采集最大化獲取研究信息并提高效率，其擴展的分析功能可重新激活高端蛋白質研究。Orbitrap Eclipse 三合一超高分辨質譜儀 面對日益復雜的學術
譚敏佳：色譜質譜雙翼護航－助力蛋白質組學新突破
分析測試百科網訊 2021年9月23日，賽默飛雙重新品線上直播發布會召開，重磅推出了Thermo Scientific? TSQ? Plus 三重四極桿質譜儀和Vanquish Neo UHPLC 系統，為蛋白質組學、精準醫學、制藥和生物制藥、臨床研究、轉化研究等領域提供了從色譜到質譜的高效、高
基于質譜的蛋白質組學，揭示不老分子的抗衰奧秘
——清華大學蛋白質化學與組學平臺主管鄧海騰教授專訪 近年來， NAD+的前體NMN作為抗衰老保健品成為京東最暢銷的商品，這是因為NAD+可能和每個人的健康壽命都有關系。這激勵著更多科學家們開展研究，探索NAD+多靶標抗衰老的功效和機理。基于質譜的蛋白質組學研究方法也在NAD+的研究中發揮重要作
賽默飛在ASMS－2017上公布TMT研究獎獲獎者名單
分析測試百科網訊 在第65屆美國質譜年會（ASMS）上，賽默飛公布2016年賽默飛TMT（Tandem Mass Tag）研究獎的獲獎者名單。這已經是第三年，這一獎項根據申請者應用串聯質譜標記試劑的創新性和影響力，在全球眾多蛋白質組學研究者當中評選出獲獎者。專有的TMT試劑由Proteome S